Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470356
- Subject:
- NM_001363570.1
- Aligned Length:
- 3570
- Identities:
- 3332
- Gaps:
- 234
Alignment
Query 1 ATGAGGAGGGACGAGCGAGACGCCAAAGCCATGCGGTCCCTGCAGCCGCCGGATGGGGCCGGCTCGCCCCCCGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGAGGGACGAGCGAGACGCCAAAGCCATGCGGTCCCTGCAGCCGCCGGATGGGGCCGGCTCGCCCCCCGA 74
Query 75 GAGTCTGAGGAACGGCTACGTGAAGAGCTGCGTGAGCCCCTTGCGGCAGGACCCTCCGCGCGGCTTCTTCTTCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAGTCTGAGGAACGGCTACGTGAAGAGCTGCGTGAGCCCCTTGCGGCAGGACCCTCCGCGCGGCTTCTTCTTCC 148
Query 149 ACCTCTGCCACTTCTGCAACGTGGAGCTGCGGCCGCCGCCGGCCTCTCCCCAGCAGCCGCGGCGCTGCTCCCCC 222
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACCTCTGCCGCTTCTGCAACGTGGAGCTGCGGCCGCCGCCGGCCTCTCCCCAGCAGCCGCGGCGCTGCTCCCCC 222
Query 223 TTCTGCCGGGCGCGCCTCTCGCTGGGCGCCCTGGCTGCCTTTGTCCTCGCCCTGCTGCTGGGCGCGGAACCCGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCTGCCGGGCGCGCCTCTCGCTGGGCGCCCTGGCTGCCTTTGTCCTCGCCCTGCTGCTGGGCGCGGAACCCGA 296
Query 297 GAGCTGGGCTGCCGGGGCCGCCTGGCTGCGGACGCTGCTGAGCGTGTGTTCGCACAGCTTGAGCCCCCTCTTCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGCTGGGCTGCCGGGGCCGCCTGGCTGCGGACGCTGCTGAGCGTGTGTTCGCACAGCTTGAGCCCCCTCTTCA 370
Query 371 GCATCGCCTGTGCCTTCTTCTTCCTCACCTGCTTCCTCACCCGGACCAAGCGGGGACCCGGCCCGGGCCGGAGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCATCGCCTGTGCCTTCTTCTTCCTCACCTGCTTCCTCACCCGGACCAAGCGGGGACCCGGCCCGGGCCGGAGC 444
Query 445 TGCGGCTCCTGGTGGCTGCTGGCGCTGCCCGCCTGCTGTTACCTGGGGGACTTCTTGGTGTGGCAGTGGTGGTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGCGGCTCCTGGTGGCTGCTGGCGCTGCCCGCCTGCTGTTACCTGGGGGACTTCTTGGTGTGGCAGTGGTGGTC 518
Query 519 TTGGCCTTGGGGGGATGGCGACGCAGGGTCCGCGGCCCCGCACACGCCCCCGGAGGCGGCAGCGGGCAGGTTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTGGCCTTGGGGGGATGGCGACGCAGGGTCCGCGGCCCCGCACACGCCCCCGGAGGCGGCAGCGGGCAGGTTGC 592
Query 593 TGCTGGTGCTGAGCTGCGTAGGGCTGCTGCTGACGCTCGCGCACCCGCTGCGGCTGCGGCACTGCGTTCTGGTG 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCTGGTGCTGAGCTGCGTAGGGCTGCTGCTGACGCTCGCGCACCCGCTGCGGCTCCGGCACTGCGTTCTGGTG 666
Query 667 CTGCTCCTGGCCAGCTTCGTCTGGTGGGTCTCCTTCACCAGCCTCGGGTCGCTGCCCTCCGCCCTCAGGCCGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGCTCCTGGCCAGCTTCGTCTGGTGGGTCTCCTTCACCAGCCTCGGGTCGCTGCCCTCCGCCCTCAGGCCGCT 740
Query 741 GCTCTCCGGCCTGGTGGGGGGCGCTGGCTGCCTGCTGGCCCTGGGGTTGGATCACTTCTTTCAAATCAGGGAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTCTCCGGCCTGGTGGGGGGCGCTGGCTGCCTGCTGGCCCTGGGGTTGGATCACTTCTTTCAAATCAGGGAAG 814
Query 815 CGCCTCTTCATCCTCGACTGTCCAGTGCCGCCGAAGAAAAAGTGCCTGTGATCCGACCCCGGAGGAGGTCCAGC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CGCCTCTTCATCCTCGACTGTCCAGTGCCGCCGAAGAAAAAGTGCCTGTGATCCGACCCCGGAGGAGGTCCAGC 888
Query 889 TGCGTGTCGTTAGGAGAAACTGCAGCCAGTTACTATGGCAGTTGCAAAATATTCAGGAGACCGTCGTTGCCTTG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCGTGTCGTTAGGAGAAACTGCAGCCAGTTACTATGGCAGTTGCAAAATATTCAGGAGACCGTCGTTGCCTTG 962
Query 963 TATTTCCAGAGAACAGATGATTCTTTGGGATTGGGACTTAAAACAATGGTATAAGCCTCATTATCAA------- 1029
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TATTTCCAGAGAACAGATGATTCTTTGGGATTGGGACTTAAAACAATGGTATAAGCCTCATTATCAAGCTGGAG 1036
Query 1030 -------------------------------------------------------------------------- 1029
Sbjct 1037 TGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCAGCTCCCTGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGG 1110
Query 1030 -------------------------------------------------------------------------- 1029
Sbjct 1111 AGTAGCTGGGATTACAGGCATGTGCCACCACACCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGATTTCTCCA 1184
Query 1030 -------------------------------------------------------------------------- 1029
Sbjct 1185 TGTTGGTCAGGCTGGTCTTGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 1258
Query 1030 -----AATTCTGGAGGTGGAAATGGAGTTGATCTTTCAGTGCTAAATGAGGCTCGCAATATGGTGTCAGATCTT 1098
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGGGAATTCTGGAGGTGGAAATGGAGTTGATCTTTCAGTGCTAAATGAGGCTCGCAATATGGTGTCAGATCTT 1332
Query 1099 CTGACTGATCCAAGCCTTCCACCACAAGTCATTTCCTCTCTACGGAGTATTAGTAGCTTAATGGGTGCTTTCTC 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGACTGATCCAAGCCTTCCACCACAAGTCATTTCCTCTCTACGGAGTATTAGTAGCTTAATGGGTGCTTTCTC 1406
Query 1173 AGGTTCCTGTAGGCCAAAGATTAATCCTCTCACACCATTTCCTGGATTTTACCCCTGTTCTGAAATAGAGGACC 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGGTTCCTGTAGGCCAAAGATTAATCCTCTCACACCATTTCCTGGATTTTACCCCTGTTCTGAAATAGAGGACC 1480
Query 1247 CAGCTGAGAAAGGGGATAGAAAACTTAACAAGGGACTAAATAGGAATAGTTTGCCAACTCCACAGCTGAGGAGA 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGCTGAGAAAGGGGATAGAAAACTTAACAAGGGACTAAATAGGAATAGTTTGCCAACTCCACAGCTGAGGAGA 1554
Query 1321 AGCTCGGGAACTTCAGGATTGCTACCTGTTGAACAGTCTTCAAGGTGGGATCGTAATAATGGCAAAAGGCCTCA 1394
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555 AGCTCAGGAACTTCAGGATTGCTACCTGTTGAACAGTCTTCAAGGTGGGATCGTAATAATGGCAAAAGACCTCA 1628
Query 1395 CCAAGAATTTGGCATTTCAAGTCAAGGATGCTATCTAAATGGGCCTTTTAATTCAAATCTACTGACTATCCCGA 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCAAGAATTTGGCATTTCAAGTCAAGGATGCTATCTAAATGGGCCTTTTAATTCAAATCTACTGACTATCCCGA 1702
Query 1469 AGCAAAGGTCATCTTCTGTATCACTGACTCACCATGTAGGTCTCAGAAGAGCTGGTGTTTTGTCCAGTCTGAGT 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGCAAAGGTCATCTTCTGTATCACTGACTCACCATGTAGGTCTCAGAAGAGCTGGTGTTTTGTCCAGTCTGAGT 1776
Query 1543 CCTGTGAATTCTTCCAACCATGGACCAGTGTCTACTGGCTCTCTAACTAATCGATCACCCATAGAATTTCCTGA 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CCTGTGAATTCTTCCAACCATGGACCAGTGTCTACTGGCTCTCTAACTAATCGATCACCCATAGAATTTCCTGA 1850
Query 1617 TACTGCTGATTTTCTTAATAAGCCAAGCGTTATCTTGCAGAGATCTCTGGGCAATGCACCTAATACTCCAGATT 1690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TACTGCTGATTTTCTTAATAAGCCAAGCGTTATCTTGCAGAGATCTCTGGGCAATGCACCTAATACTCCAGATT 1924
Query 1691 TTTATCAGCAACTTAGAAATTCTGATAGCAATCTGTGTAACAGCTGTGGACATCAAATGCTGAAATATGTTTCA 1764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTTATCAGCAACTTAGAAATTCTGATAGCAATCTGTGTAACAGCTGTGGACATCAAATGCTGAAATATGTTTCA 1998
Query 1765 ACATCTGAATCAGATGGTACAGATTGCTGCAGTGGAAAATCAGGTGAAGAAGAAAACATTTTCTCGAAAGAATC 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ACATCTGAATCAGATGGTACAGATTGCTGCAGTGGAAAATCAGGTGAAGAAGAAAACATTTTCTCGAAAGAATC 2072
Query 1839 ATTCAAACTTATGGAAACTCAACAAGAAGAGGAAACAGAGAAGAAAGACAGCAGAAAATTATTTCAGGAAGGTG 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ATTCAAACTTATGGAAACTCAACAAGAAGAGGAAACAGAGAAGAAAGACAGCAGAAAATTATTTCAGGAAGGTG 2146
Query 1913 ATAAGTGGCTAACAGAAGAGGCACAGAGTGAACAGCAAACAAATATTGAACAGGAAGTATCACTGGACCTGATT 1986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATAAGTGGCTAACAGAAGAGGCACAGAGTGAACAGCAAACAAATATTGAACAGGAAGTATCACTGGACCTGATT 2220
Query 1987 TTAGTAGAAGAGTATGACTCATTAATAGAAAAGATGAGCAACTGGAATTTTCCAATTTTTGAACTTGTAGAAAA 2060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTAGTAGAAGAGTATGACTCATTAATAGAAAAGATGAGCAACTGGAATTTTCCAATTTTTGAACTTGTAGAAAA 2294
Query 2061 GATGGGAGAGAAATCAGGAAGGATTCTCAGTCAGGTTATGTATACCTTATTTCAAGACACTGGTTTATTGGAAA 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GATGGGAGAGAAATCAGGAAGGATTCTCAGTCAGGTTATGTATACCTTATTTCAAGACACTGGTTTATTGGAAA 2368
Query 2135 TATTTAAAATTCCCACTCAACAATTTATGAACTATTTTCGTGCATTAGAAAATGGCTATCGAGACATTCCTTAT 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TATTTAAAATTCCCACTCAACAATTTATGAACTATTTTCGTGCATTAGAAAATGGCTATCGAGACATTCCTTAT 2442
Query 2209 CACAATCGTATACATGCCACAGATGTGCTACATGCAGTTTGGTATCTGACAACACGGCCAGTTCCTGGCTTACA 2282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CACAATCGTATACATGCCACAGATGTGCTACATGCAGTTTGGTATCTGACAACACGGCCAGTTCCTGGCTTACA 2516
Query 2283 GCAGATCCACAATGGTTGTGGAACAGGAAATGAAACAGATTCTGATGGTAGAATTAACCATGGGCGAATTGCTT 2356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GCAGATCCACAATGGTTGTGGAACAGGAAATGAAACAGATTCTGATGGTAGAATTAACCATGGGCGAATTGCTT 2590
Query 2357 ATATTTCTTCGAAGAGCTGCTCTAATCCTGATGAGAGTTATGGCTGCCTGTCTTCAAACATTCCTGCATTAGAA 2430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ATATTTCTTCGAAGAGCTGCTCTAATCCTGATGAGAGTTATGGCTGCCTGTCTTCAAACATTCCTGCATTAGAA 2664
Query 2431 TTGATGGCTCTATACGTGGCAGCTGCCATGCATGATTATGATCACCCAGGGAGGACAAATGCATTTCTAGTGGC 2504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TTGATGGCTCTATACGTGGCAGCTGCCATGCATGATTATGATCACCCAGGGAGGACAAATGCATTTCTAGTGGC 2738
Query 2505 TACAAATGCCCCTCAGGCAGTTTTATACAATGACAGATCTGTTCTGGAAAATCATCATGCTGCGTCAGCTTGGA 2578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TACAAATGCCCCTCAGGCAGTTTTATACAATGACAGATCTGTTCTGGAAAATCATCATGCTGCGTCAGCTTGGA 2812
Query 2579 ATCTATATCTTTCTCGCCCAGAATACAACTTCCTTCTTCATCTTGATCATGTGGAATTCAAGCGCTTTCGTTTT 2652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ATCTATATCTTTCTCGCCCAGAATACAACTTCCTTCTTCATCTTGATCATGTGGAATTCAAGCGCTTTCGTTTT 2886
Query 2653 TTAGTCATTGAAGCAATCCTTGCTACGGATCTTAAAAAGCATTTTGATTTTCTCGCAGAATTCAATGCCAAGGC 2726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TTAGTCATTGAAGCAATCCTTGCTACGGATCTTAAAAAGCATTTTGATTTTCTCGCAGAATTCAATGCCAAGGC 2960
Query 2727 AAATGATGTAAATAGTAATGGCATAGAATGGAGTAATGAAAATGATCGCCTCTTGGTATGCCAGGTGTGCATCA 2800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AAATGATGTAAATAGTAATGGCATAGAATGGAGTAATGAAAATGATCGCCTCTTGGTATGCCAGGTGTGCATCA 3034
Query 2801 AACTGGCAGATATAAATGGCCCAGCAAAAGTTCGAGACTTGCATTTGAAATGGACAGAAGGCATTGTCAATGAA 2874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AACTGGCAGATATAAATGGCCCAGCAAAAGTTCGAGACTTGCATTTGAAATGGACAGAAGGCATTGTCAATGAA 3108
Query 2875 TTTTATGAGCAGGGAGATGAAGAAGCAAATCTTGGTCTGCCCATCAGTCCATTCATGGATCGTTCTTCTCCTCA 2948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TTTTATGAGCAGGGAGATGAAGAAGCAAATCTTGGTCTGCCCATCAGTCCATTCATGGATCGTTCTTCTCCTCA 3182
Query 2949 ACTAGCAAAACTCCAAGAATCTTTTATCACCCACATAGTGGGTCCCCTGTGTAACTCCTATGATGCTGCTGGTT 3022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 ACTAGCAAAACTCCAAGAATCTTTTATCACCCACATAGTGGGTCCCCTGTGTAACTCCTATGATGCTGCTGGTT 3256
Query 3023 TGCTACCAGGTCAGTGGTTAGAAGCAGAAGAGGATAATGATACTGAAAGTGGTGATGATGAAGACGGTGAAGAA 3096
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TGCTACCAGGTCAGTGGTTAGAAGCAGAAGAGGATAATGATACTGAAAGTGGTGATGATGAAGACGGTGAAGAA 3330
Query 3097 TTAGATACAGAAGATGAAGAAATGGAAAACAATCTAAATCCAAAACCACCAAGAAGGAAAAGCAGACGGCGAAT 3170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 TTAGATACAGAAGATGAAGAAATGGAAAACAATCTAAATCCAAAACCACCAAGAAGGAAAAGCAGACGGCGAAT 3404
Query 3171 ATTTTGTCAGCTAATGCACCACCTCACTGAAAACCACAAGATATGGAAGGAAATCGTAGAGGAAGAAGAAAAAT 3244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 ATTTTGTCAGCTAATGCACCACCTCACTGAAAACCACAAGATATGGAAGGAAATCGTAGAGGAAGAAGAAAAAT 3478
Query 3245 GTAAAGCTGATGGGAATAAACTGCAGGTGGAGAATTCCTCCTTACCTCAAGCAGATGAGATTCAGGTAATTGAA 3318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 GTAAAGCTGATGGGAATAAACTGCAGGTGGAGAATTCCTCCTTACCTCAAGCAGATGAGATTCAGGTAATTGAA 3552
Query 3319 GAGGCAGATGAAGAGGAA 3336
||||||||||||||||||
Sbjct 3553 GAGGCAGATGAAGAGGAA 3570