Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470397
• Subject: XM_006517569.3
• Aligned Length: 1364
• Identities: 1139
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  ATGTACAATACTGTTTGGAATATGGAAGACCTGGATTTAGAATATGCCAAGACAGATATAAATTGTGGCACAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTGATGTTTTAT--ATAGAAATGGACCCACCAGCACTGCCTCCTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAA  146
                       ||  |||       |||..|.|.|||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct    1  -----------ATGCATA-------ACCTGCAAACACTGCCCCCCAAACCACCCAAGCCCACTACTGTAGCCAA  56

Query  147  CAACGGTATGAATAACAATATGTCCTTACAAGATGCTGAATGGTACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGA  220
            ||||.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   57  CAACAGCATGAACAACAATATGTCCTTGCAGGATGCTGAATGGTACTGGGGAGACATCTCAAGGGAAGAAGTGA  130

Query  221  ATGAAAAACTTCGAGATACAGCAGACGGGACCTTTTTGGTACGAGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTAT  294
            ||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  131  ATGAAAAACTCCGAGACACTGCTGATGGGACCTTTTTGGTACGAGACGCATCTACTAAAATGCACGGCGATTAC  204

Query  295  ACTCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTC  368
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  205  ACTCTTACACTAAGGAAAGGAGGAAATAACAAATTAATCAAAATCTTTCACCGTGATGGAAAATATGGCTTCTC  278

Query  369  TGACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATC  442
            |||.|||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.||.|
Sbjct  279  TGATCCATTAACCTTCAACTCTGTGGTTGAGTTAATAAACCACTACCGGAATGAGTCTTTAGCTCAGTACAACC  352

Query  443  CCAAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATT  516
            ||||..||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  353  CCAAGCTGGATGTGAAGTTGCTCTACCCAGTGTCCAAATACCAGCAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATT  426

Query  517  GAAGCTGTAGGGAAAAAATTACATAAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATA  590
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  427  GAAGCTGTAGGGAAAAAATTACATGAATATAATACTCAATTTCAAGAAAAAAGTCGGGAATATGATAGATTATA  500

Query  591  TGAAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAA  664
            |||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  501  TGAGGAGTACACCCGTACTTCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGAACGGCTATCGAAGCATTTAATGAAACCATAA  574

Query  665  AAATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGC  738
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  575  AAATATTTGAAGAACAATGCCAAACCCAGGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAGAAGTTTAAACGCGAAGGC  648

Query  739  AATGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAG  812
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||.|||||||.||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  649  AACGAGAAAGAAATTCAAAGGATTATGCATAACCATGATAAGCTGAAGTCGCGTATCAGTGAGATCATTGACAG  722

Query  813  TAGAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCA  886
            |||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  723  TAGGAGGAGGTTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTACCGAGAGATCGACAAACGCATGAACAGTA  796

Query  887  TTAAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGG  960
            ||||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||
Sbjct  797  TTAAGCCGGACCTCATCCAGTTGAGAAAGACAAGAGACCAATACTTGATGTGGCTGACGCAGAAAGGTGTGCGG  870

Query  961  CAAAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGA  1034
            ||.||||||.|||||||||||.||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  871  CAGAAGAAGCTGAACGAGTGGCTGGGGAATGAAAATACCGAAGATCAATACTCCCTGGTAGAAGATGATGAGGA  944

Query 1035  TTTGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAG  1108
            |||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  945  TTTGCCCCACCATGACGAGAAGACGTGGAATGTCGGGAGCAGCAACCGAAACAAAGCGGAGAACCTATTGCGAG  1018

Query 1109  GGAAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGAC  1182
            ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1019  GGAAGCGAGACGGCACTTTCCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAGCAGGGCTGCTATGCCTGCTCCGTAGTGGTAGAC  1092

Query 1183  GGCGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAG  1256
            ||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1093  GGCGAAGTCAAGCATTGCGTCATTAACAAGACTGCCACCGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTACAACCTGTACAG  1166

Query 1257  CTCTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACAC  1330
            |||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1167  CTCCCTGAAGGAGCTGGTGCTACATTATCAACACACCTCCCTCGTGCAGCACAATGACTCCCTCAATGTCACAC  1240

Query 1331  TAGCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA  1362
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1241  TAGCATACCCAGTATATGCACAACAGAGGCGA  1272