Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470397
- Subject:
- XM_006517570.3
- Aligned Length:
- 1362
- Identities:
- 1089
- Gaps:
- 153
Alignment
Query 1 ATGTACAATACTGTTTGGAATATGGAAGACCTGGATTTAGAATATGCCAAGACAGATATAAATTGTGGCACAGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTTGATGTTTTATATAGAAATGGACCCACCAGCACTGCCTCCTAAACCACCAAAACCTACTACTGTAGCCAACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACGGTATGAATAACAATATGTCCTTACAAGATGCTGAATGGTACTGGGGAGATATCTCGAGGGAAGAAGTGAAT 222
|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1 -----ATGAACAACAATATGTCCTTGCAGGATGCTGAATGGTACTGGGGAGACATCTCAAGGGAAGAAGTGAAT 69
Query 223 GAAAAACTTCGAGATACAGCAGACGGGACCTTTTTGGTACGAGATGCGTCTACTAAAATGCATGGTGATTATAC 296
||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 70 GAAAAACTCCGAGACACTGCTGATGGGACCTTTTTGGTACGAGACGCATCTACTAAAATGCACGGCGATTACAC 143
Query 297 TCTTACACTAAGGAAAGGGGGAAATAACAAATTAATCAAAATATTTCATCGAGATGGGAAATATGGCTTCTCTG 370
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 144 TCTTACACTAAGGAAAGGAGGAAATAACAAATTAATCAAAATCTTTCACCGTGATGGAAAATATGGCTTCTCTG 217
Query 371 ACCCATTAACCTTCAGTTCTGTGGTTGAATTAATAAACCACTACCGGAATGAATCTCTAGCTCAGTATAATCCC 444
|.|||||||||||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||
Sbjct 218 ATCCATTAACCTTCAACTCTGTGGTTGAGTTAATAAACCACTACCGGAATGAGTCTTTAGCTCAGTACAACCCC 291
Query 445 AAATTGGATGTGAAATTACTTTATCCAGTATCCAAATACCAACAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGA 518
||..||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 AAGCTGGATGTGAAGTTGCTCTACCCAGTGTCCAAATACCAGCAGGATCAAGTTGTCAAAGAAGATAATATTGA 365
Query 519 AGCTGTAGGGAAAAAATTACATAAATATAACACTCAGTTTCAAGAAAAAAGTCGAGAATATGATAGATTATATG 592
||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 366 AGCTGTAGGGAAAAAATTACATGAATATAATACTCAATTTCAAGAAAAAAGTCGGGAATATGATAGATTATATG 439
Query 593 AAGAATATACCCGCACATCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGGACAGCTATTGAAGCATTTAATGAAACCATAAAA 666
|.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 AGGAGTACACCCGTACTTCCCAGGAAATCCAAATGAAAAGAACGGCTATCGAAGCATTTAATGAAACCATAAAA 513
Query 667 ATATTTGAAGAACAGTGCCAGACCCAAGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAAAAGTTTAAACGTGAAGGCAA 740
||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 514 ATATTTGAAGAACAATGCCAAACCCAGGAGCGGTACAGCAAAGAATACATAGAGAAGTTTAAACGCGAAGGCAA 587
Query 741 TGAGAAAGAAATACAAAGGATTATGCATAATTATGATAAGTTGAAGTCTCGAATCAGTGAAATTATTGACAGTA 814
.|||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||.|||||||.||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 588 CGAGAAAGAAATTCAAAGGATTATGCATAACCATGATAAGCTGAAGTCGCGTATCAGTGAGATCATTGACAGTA 661
Query 815 GAAGAAGATTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTATCGAGAAATTGACAAACGTATGAACAGCATT 888
|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 662 GGAGGAGGTTGGAAGAAGACTTGAAGAAGCAGGCAGCTGAGTACCGAGAGATCGACAAACGCATGAACAGTATT 735
Query 889 AAACCAGACCTTATCCAGCTGAGAAAGACGAGAGACCAATACTTGATGTGGTTGACTCAAAAAGGTGTTCGGCA 962
||.||.|||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 736 AAGCCGGACCTCATCCAGTTGAGAAAGACAAGAGACCAATACTTGATGTGGCTGACGCAGAAAGGTGTGCGGCA 809
Query 963 AAAGAAGTTGAACGAGTGGTTGGGCAATGAAAACACTGAAGACCAATATTCACTGGTGGAAGATGATGAAGATT 1036
.||||||.|||||||||||.||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 810 GAAGAAGCTGAACGAGTGGCTGGGGAATGAAAATACCGAAGATCAATACTCCCTGGTAGAAGATGATGAGGATT 883
Query 1037 TGCCCCATCATGATGAGAAGACATGGAATGTTGGAAGCAGCAACCGAAACAAAGCTGAAAACCTGTTGCGAGGG 1110
|||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 884 TGCCCCACCATGACGAGAAGACGTGGAATGTCGGGAGCAGCAACCGAAACAAAGCGGAGAACCTATTGCGAGGG 957
Query 1111 AAGCGAGATGGCACTTTTCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAACAGGGCTGCTATGCCTGCTCTGTAGTGGTGGACGG 1184
||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 958 AAGCGAGACGGCACTTTCCTTGTCCGGGAGAGCAGTAAGCAGGGCTGCTATGCCTGCTCCGTAGTGGTAGACGG 1031
Query 1185 CGAAGTAAAGCATTGTGTCATAAACAAAACAGCAACTGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTATAACTTGTACAGCT 1258
||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1032 CGAAGTCAAGCATTGCGTCATTAACAAGACTGCCACCGGCTATGGCTTTGCCGAGCCCTACAACCTGTACAGCT 1105
Query 1259 CTCTGAAAGAACTGGTGCTACATTACCAACACACCTCCCTTGTGCAGCACAACGACTCCCTCAATGTCACACTA 1332
|.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 CCCTGAAGGAGCTGGTGCTACATTATCAACACACCTCCCTCGTGCAGCACAATGACTCCCTCAATGTCACACTA 1179
Query 1333 GCCTACCCAGTATATGCACAGCAGAGGCGA 1362
||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1180 GCATACCCAGTATATGCACAACAGAGGCGA 1209