Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470421
• Subject: XM_006715120.1
• Aligned Length: 1323
• Identities: 1080
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ATGGAGCAGCCACAGGAGGAAGCCCCTGAGGTCCGGGAAGAGGAGGAGAAAGAGGAAGTGGCAGAGGCAGAAGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCAGCCACAGGAGGAAGCCCCTGAGGTCCGGGAAGAGGAGGAGAAAGAGGAAGTGGCAGAGGCAGAAGG  74

Query   75  AGCCCCAGAGCTCAATGGGGGACCACAGCATGCACTTCCTTCCAGCAGCTACACAGACCTCTCCCGGAGCTCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCCAGAGCTCAATGGGGGACCACAGCATGCACTTCCTTCCAGCAGCTACACAGACCTCTCCCGGAGCTCCT  148

Query  149  CGCCACCCTCACTGCTGGACCAACTGCAGATGGGCTGTGACGGGGCCTCATGCGGCAGCCTCAACATGGAGTGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCCACCCTCACTGCTGGACCAACTGCAGATGGGCTGTGACGGGGCCTCATGCGGCAGCCTCAACATGGAGTGC  222

Query  223  CGGGTGTGCGGGGACAAGGCATCGGGCTTCCACTACGGTGTTCATGCATGTGAGGGGTGCAAGGGCTTCTTCCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGGTGTGCGGGGACAAGGCATCGGGCTTCCACTACGGTGTTCATGCATGTGAGGGGTGCAAGGGCTTCTTCCG  296

Query  297  TCGTACGATCCGCATGAAGCTGGAGTACGAGAAGTGTGAGCGCAGCTGCAAGATTCAGAAGAAGAACCGCAACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGTACGATCCGCATGAAGCTGGAGTACGAGAAGTGTGAGCGCAGCTGCAAGATTCAGAAGAAGAACCGCAACA  370

Query  371  AGTGCCAGTACTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCACTGGGCATGTCACACAACGCTATCCGTTTTGGTCGGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGTGCCAGTACTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCACTGGGCATGTCACACAACGCTATCCGTTTTGGTCGGATG  444

Query  445  CCGGAGGCTGAGAAGAGGAAGCTGGTGGCAGGGCTGACTGCAAATGAGGGGAGCCAGTACAACCCACAGGTGGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCGGAGGCTGAGAAGAGGAAGCTGGTGGCAGGGCTGACTGCAAACGAGGGGAGCCAGTACAACCCACAGGTGGC  518

Query  519  CGACCTGAAGGCCTTCTCCAAGCACATCTACAATGCCTACCTGAAAAACTTCAACATGACCAAAAAGAAGGCCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGACCTGAAGGCCTTCTCCAAGCACATCTACAATGCCTACCTGAAAAACTTCAACATGACCAAAAAGAAGGCCC  592

Query  593  GCAGCATCCTCACCGGCAAAGCCAGCCACACGGCGCCCTTTGTGATCCACGACATCGAGACATTGTGGCAGGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAGCATCCTCACCGGCAAAGCCAGCCACACGGCGCCCTTTGTGATCCACGACATCGAGACATTGTGGCAGGCA  666

Query  667  GAGAAGGGGCTGGTGTGGAAGCAGTTGGTGAATGGCCTGCCTCCCTACAAGGAGATCAGCGTGCACGTCTTCTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAAGGGGCTGGTGTGGAAGCAGTTGGTGAATGGCCTGCCTCCCTACAAGGAGATCAGCGTGCACGTCTTCTA  740

Query  741  CCGCTGCCAGTGCACCACAGTGGAGACCGTGCGGGAGCTCACTGAGTTCGCCAAGAGCATCCCCAGCTTCAGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGCTGCCAGTGCACCACAGTGGAGACCGTGCGGGAGCTCACTGAGTTCGCCAAGAGCATCCCCAGCTTCAGCA  814

Query  815  GCCTCTTCCTCAACGACCAGGTTACCCTTCTCAAGTATGGCGTGCACGAGGCCATCTTCGCCATGCTGGCCTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCTCTTCCTCAACGACCAGGTTACCCTTCTCAAGTATGGCGTGCACGAGGCCATCTTCGCCATGCTGGCCTCT  888

Query  889  ATCGTCAACAAGGACGGGCTGCTGGTAGCCAACGGCAGTGGCTTTGTCACCCGTGAGTTCCTGCGCAGCCTCCG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCGTCAACAAGGACGGGCTGCTGGTAGCCAACGGCAGTGGCTTTGTCACCCGTGAGTTCCTGCGCAGCCTCCG  962

Query  963  CAAACCCTTCAGTGATATCATTGAGCCTAAGTTTGAATTTGCTGTCAAGTTCAACGCCCTGGAACTTGATGACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAACCCTTCAGTGATATCATTGAGCCTAAGTTTGAATTTGCTGTCAAGTTCAACGCCCTGGAACTTGATGACA  1036

Query 1037  GTGACCTGGCCCTATTCATTGCGGCCATCATTCTGTGTGGA----GGTGAG-----------------------  1083
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||..||                       
Sbjct 1037  GTGACCTGGCCCTATTCATTGCGGCCATCATTCTGTGTGGAGACCGGCCAGGCCTCATGAACGTTCCACGGGTG  1110

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1111  GAGGCTATCCAGGACACCATCCTGCGTGCCCTCGAATTCCACCTGCAGGCCAACCACCCTGATGCCCAGTACCT  1184

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1185  CTTCCCCAAGCTGCTGCAGAAGATGGCTGACCTGCGGCAACTGGTCACCGAGCACGCCCAGATGATGCAGCGGA  1258

Query 1084  -----------------------------------------------------------------  1083
                                                                             
Sbjct 1259  TCAAGAAGACCGAAACCGAGACCTCGCTGCACCCTCTGCTCCAGGAGATCTACAAGGACATGTAC  1323