Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470451
• Subject: NM_001306091.2
• Aligned Length: 2661
• Identities: 2127
• Gaps: 534

Alignment

Query    1  ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AATGAATTGAAAAACCTTCAGGCTGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTATT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCTTTTTTCTTGGAGCCAGCAA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TAATTATCACAATTACTGATGGGAGCAAGTTGACTACCACCAGTGGAGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTT  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  AATTCTCCTTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTCTTTGCATTAGTGTT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  GCGGTTGCCTGGCACCATGTCAGTAGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTAGATGACTCTGCAATCACAC  592
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------ATGTCAGTAGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTAGATGACTCTGCAATCACAC  58

Query  593  CAATGTGTGAAGTGACAGGCGGCCGTTCATATTCTGTGTGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAGTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   59  CAATGTGTGAAGTGACAGGCGGCCGTTCATATTCTGTGTGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAGTCC  132

Query  667  TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAAGCAGGACCAGATCCTTCCCCTGTAGAAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAAGCAGGACCAGATCCTTCCCCTGTAGAAGA  206

Query  741  TGGGCAGCCAGATATATCAAGGCCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAACTCATATATGTCAGAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  TGGGCAGCCAGATATATCAAGGCCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAACTCATATATGTCAGAC  280

Query  815  CAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGTCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAAAATTCGCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  CAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGTCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAAAATTCGCCA  354

Query  889  ACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAACCAATGGTTATTGATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  ACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAACCAATGGTTATTGATAA  428

Query  963  ACTTCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAATTTATCCTGGAAAGGAAATCTCCTCAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  ACTTCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAATTTATCCTGGAAAGGAAATCTCCTCAAA  502

Query 1037  CATGTTGGCAGGTGTACGTGAGCAATAGTGCAAAATACAGTGAACTTGGTCATCCTTTTGGTTACTTGAAAGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  503  CATGTTGGCAGGTGTACGTGAGCAATAGTGCAAAATACAGTGAACTTGGTCATCCTTTTGGTTACTTGAAAGCC  576

Query 1111  AGTACAGCACTGAACTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTATCCAGTCCTTCTTCCCCTCTTAGATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  AGTACAGCACTGAACTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTATCCAGTCCTTCTTCCCCTCTTAGATGA  650

Query 1185  CTTGTTTAAAGTGCATAAAGCAAAACCAACATTGAAGTGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAATGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  CTTGTTTAAAGTGCATAAAGCAAAACCAACATTGAAGTGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAATGC  724

Query 1259  CTCCCTACTATCTTGGGCCCTTGAAGAAAGCTGTTAGGATGATGGGAGCACCTAACCTAATAGCAGACAGTATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  CTCCCTACTATCTTGGGCCCTTGAAGAAAGCTGTTAGGATGATGGGAGCACCTAACCTAATAGCAGACAGTATG  798

Query 1333  GAATATGGACTTAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAACTGAGTCAACAGGCCAAAATAGAATCTGATCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  GAATATGGACTTAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAACTGAGTCAACAGGCCAAAATAGAATCTGATCG  872

Query 1407  AGTCATTGGATCTGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAGACTGGAATAAAAGTCCGGAGCCGATCACATGGTTTAT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  AGTCATTGGATCTGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAGACTGGAATAAAAGTCCGGAGCCGATCACATGGTTTAT  946

Query 1481  CAATGGCATATAGGAAAGATTTTCAACAACTCCTCCAGGGAATTTCAGAGGATGTCCCTCACAGACTGCTAGAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  CAATGGCATATAGGAAAGATTTTCAACAACTCCTCCAGGGAATTTCAGAGGATGTCCCTCACAGACTGCTAGAC  1020

Query 1555  CTTAATATGAAGGAATACACTGGGTTCCAAGTTGCTTTGCTGAATAAGGATTTGAAGCCACAGACATTTAGAAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  CTTAATATGAAGGAATACACTGGGTTCCAAGTTGCTTTGCTGAATAAGGATTTGAAGCCACAGACATTTAGAAA  1094

Query 1629  TGCTTATGACATACCAAGACGAAATCTTTTGGATCACTTAACAAGAATGAGATCTAATCTTTTGAAGAGCACTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  TGCTTATGACATACCAAGACGAAATCTTTTGGATCACTTAACAAGAATGAGATCTAATCTTTTGAAGAGCACTC  1168

Query 1703  GCAGATTTCTGAAAGGACAGGACGAAGATCAAGTGCACAGTGTTCCTATAGCACAAATGGGGAACTACCAGGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  GCAGATTTCTGAAAGGACAGGACGAAGATCAAGTGCACAGTGTTCCTATAGCACAAATGGGGAACTACCAGGAA  1242

Query 1777  TACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCACTAAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCACGAAGGTTGCATACATTTGGCAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  TACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCACTAAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCACGAAGGTTGCATACATTTGGCAA  1316

Query 1851  CCCCTTTAAGCTGGATAAGAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAAAATAAAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  CCCCTTTAAGCTGGATAAGAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAAAATAAAC  1390

Query 1925  ATAAACGACCCGGAGAACCAAATATGCAAGGGATCCCTAAAAGACGTCGGTGTATGTCTCCACTACTAAGAGGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  ATAAACGACCCGGAGAACCAAATATGCAAGGGATCCCTAAAAGACGTCGGTGTATGTCTCCACTACTAAGAGGC  1464

Query 1999  AGACAGCAGAATCCTGTTGTAAACAATCATATTGGGGGAAAAGGACCACCTGCACCTACAACTCAAGCACAGCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465  AGACAGCAGAATCCTGTTGTAAACAATCATATTGGGGGAAAAGGACCACCTGCACCTACAACTCAAGCACAGCC  1538

Query 2073  AGATCTTATTAAACCTCTTCCTCTTCATAAAATTTCAGAAACCACTAATGATTCGATAATACATGATGTGGTTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539  AGATCTTATTAAACCTCTTCCTCTTCATAAAATTTCAGAAACCACTAATGATTCGATAATACATGATGTGGTTG  1612

Query 2147  AAAATCATGTTGCAGACCAACTTTCATCAGACATTACACCAAATGCTATGGATACGGAATTTTCAGCATCTTCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613  AAAATCATGTTGCAGACCAACTTTCATCAGACATTACACCAAATGCTATGGATACGGAATTTTCAGCATCTTCT  1686

Query 2221  CCAGCCAGTTTACTGGAACGGCCAACCAATCATATGGAGGCTCTTGGTCATGACCATTTAGGAACCAATGACCT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687  CCAGCCAGTTTACTGGAACGGCCAACCAATCATATGGAGGCTCTTGGTCATGACCATTTAGGAACCAATGACCT  1760

Query 2295  CACTGTTGGTGGATTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAGATAAAGAACAATGTGCTGAAGAGAACATACCAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761  CACTGTTGGTGGATTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAGATAAAGAACAATGTGCTGAAGAGAACATACCAG  1834

Query 2369  CATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGCAGAAGCCATGAAGAGGTCAATACTGAACTAAAAGCA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1835  CATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGCAGAAGCCATGAAGAGGTCAATACTGAACTAAAAGCA  1908

Query 2443  CAAATAATGAAAGAGATCCGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACTTTACTGAAGCATGTGCAAGG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909  CAAATAATGAAAGAGATCCGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACTTTACTGAAGCATGTGCAAGG  1982

Query 2517  CAGTTTACAAACAAGACTAATATTTTTACAAAATGTCATTAAAGAAGCATCAAGGTTTAAAAAACGAATGCTAA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983  CAGTTTACAAACAAGACTAATATTTTTACAAAATGTCATTAAAGAAGCATCAAGGTTTAAAAAACGAATGCTAA  2056

Query 2591  TAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAGATCAACCATATTAATAGCAAT  2661
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2057  TAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAGATCAACCATATTAATAGCAAT  2127