Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470524
• Subject: XM_006527801.1
• Aligned Length: 1088
• Identities: 724
• Gaps: 319

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------ATGGCGGAGAAGTTTGACTGCCACTA  26
                                                            |||.||||||||||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCTTCTCAAAGACACTCAGGTCCCTCCAGCTATAAGGTGGGCACCATGTCGGAGAAGTTCGACTGTCACTA  74

Query   27  CTGCAGGGATCCCTTGCAGGGGAAGAAGTATGTGCAAAAGGATGGCCACCACTGCTGCCTGAAATGCTTTGACA  100
            |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CTGCAGGGACCCCTTGCAGGGGAAGAAGTACGTGCAGAAGGATGGCCGTCACTGCTGCCTGAAGTGCTTTGACA  148

Query  101  AGTTCTGTGCCAACACCTGTGTGGAATGCCGCAAGCCCATCGGTGCGGACTCCAAGGAGGTGCACTATAAGAAC  174
            |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct  149  AGTTCTGCGCCAACACCTGCGTGGACTGCCGCAAGCCCATAAGCGCTGATGCCAAGGAGGTGCATTATAAGAAT  222

Query  175  CGCTTCTGGCATGACACCTGCTTCCGCTGTGCCAAGTGCCTTCACCCCTTGGCCAATGAGACCTTTGTGGCCAA  248
            ||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||
Sbjct  223  CGCTACTGGCACGACAACTGCTTCCGCTGTGCCAAGTGCCTTCACCCCTTGGCCAGTGAGACCTTTGTGTCCAA  296

Query  249  GGACAACAAGATCCTGTGCAACAAGTGCACCACTCGGGAGGACTCCCCCAAGTGCAAGGGGTGCTTCAAGGCCA  322
            |||...||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GGATGGCAAGATCCTGTGCAACAAGTGCGCTACTCGGGAGGACTCCCCCAGGTGCAAAGGGTGCTTCAAGGCCA  370

Query  323  TTGTGGCAGGAGATCAAAACGTGGAGTACAAGGGGACCGTCTGGCACAAAGACTGCTTCACCTGTAGTAACTGC  396
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  371  TTGTGGCAGGAGACCAGAACGTGGAGTACAAGGGCACCGTCTGGCATAAAGACTGCTTCACCTGCAGCAACTGC  444

Query  397  AAGCAAGTCATCGGGACTGGAAGCTTCTTCCCTAAAGGGGAGGACTTCTACTGCGTGACTTGCCATGAGACCAA  470
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCAAGTCATTGGGACCGGAAGCTTCTTCCCGAAAGGGGAGGACTTCTACTGTGTGACTTGCCATGAGACCAA  518

Query  471  GTTTGCCAAGCATTGCGTGAAGTGCAACAAGGCCATCACATCTGGAGGAATCACTTACCAGGATCAGCCCTGGC  544
            |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTCGCCAAACATTGCGTGAAGTGCAACAAGGCCATCACATCTGGAGGAATCACTTACCAGGATCAGCCCTGGC  592

Query  545  ATGCCGATTGCTTTGTGTGTGTTACCTGCTCTAAGAAGCTGGCTGGGCAGCGTTTCACCGCTGTGGAGGACCAG  618
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCCGAGTGCTTTGTGTGTGTTACCTGCTCTAAGAAGCTGGCTGGGCAGCGTTTCACCGCTGTGGAGGACCAG  666

Query  619  TATTACTGCGTGGATTGCTACAAGAACTTTGTGGCCAAGAAGTGTGCTGGATGCAAGAACCCCATCACT-----  687
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  667  TATTACTGCGTGGATTGCTACAAGAACTTTGTGGCCAAGAAGTGTGCTGGATGCAAGAACCCCATCACTGGGAA  740

Query  688  --------------------------------------------------------------------------  687
                                                                                      
Sbjct  741  AAGGACTGTGTCAAGAGTGAGCCACCCAGTCTCTAAAGCTAGGAAGTCCCCAGTGTGCCACGGGAAACGCTTGC  814

Query  688  --------------------------------------------------------------------------  687
                                                                                      
Sbjct  815  CTCTCACCCTGTTTCCCAGCGCCAACCTCCGGGGCAGGCATCCGGGTGGAGAGAGGACTTGTCCCTCGTGGGTG  888

Query  688  -----------------------------------------------GGGTTTGGTAAAGGCTCCAGTGTGGTG  714
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGTTCTTTATAGAAAAAATCGAAGCTTAGCAGCTCCTCGAGGCCCGGGTTTGGTAAAGGCTCCAGTGTGGTG  962

Query  715  GCCTATGAAGGACAATCCTGGCACGACTACTGCTTCCACTGCAAAAAATGCTCCGTGAATCTGGCCAACAAGCG  788
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  963  GCCTATGAAGGACAATCCTGGCACGACTACTGCTTCCACTGCAAAAAATGCTCCG-------------------  1017

Query  789  CTTTGTTTTCCACCAGGAGCAAGTGTATTGTCCCGACTGTGCCAAAAAGCTG  840
                                                                
Sbjct 1018  ----------------------------------------------------  1017