Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000470535
Subject:
NM_001322019.1
Aligned Length:
1153
Identities:
1028
Gaps:
116

Alignment

Query    1  ATGGCCTTGCGGCTCCTGAAGCTGGCAGCGACGTCCGCGTCCGCCCGGGTCGTGGCGGCGGGCGCCCAGCGCGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTTGCGGCTCCTGAAGCTGGCAGCGACGTCCGCGTCCGCCCGGGTCGTGGCGGCGGGCGCCCAGCGCGT  74

Query   75  GAGAGGAATTCATAGCAGTGTGCAGTGCAAGCTGCGCTATGGAATGTGGCATTTCCTACTTGGGGATAAAGCAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGAGGAATTCATAGCAGTGTGCAGTGCAAACTGCGCTATGGAATGTGGCATTTCCTACTTGGGGATAAAGCAA  148

Query  149  GCAAAAGACTGACAGAACGCAGCAGAGTGATAACTGTAGATGGCAATATATGTACTGGAAAAGGCAAACTTGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAAAGACTGACAGAACGCAGCAGAGTGATAACTGTAGATGGCAATATATGTACTGGAAAAGGCAAACTTGCA  222

Query  223  AAAGAAATAGCAGAGAAACTAGGCTTCAAGCACTTTCCTGAAGCGGGGATTCATTATCCAGACAGTACCACAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGAAATAGCAGAGAAACTAGGCTTCAAGCACTTTCCTGAAGCGGGGATTCATTATCCAGACAGTACCACAGG  296

Query  297  AGATGGGAAGCCCCTCGCCACCGACTATAATGGCAACTGTAGTTTGGAGAAATTTTACGATGATCCGAGAAGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATGGGAAGCCCCTCGCCACCGACTATAATGGCAACTGTAGTTTGGAGAAATTTTACGATGATCCGAGAAGCA  370

Query  371  ATGATGGCAACAGTTACCGCCTGCAGTCCTGGTTGTACAGCAGTCGCCTGCTGCAGTACTCAGATGCCTTGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGATGGCAACAGTTACCGCCTGCAGTCCTGGTTGTACAGCAGTCGCCTGCTGCAGTACTCAGATGCCTTGGAG  444

Query  445  CACTTGCTGACCACAGGACAAGGTGTTGTGTTGGAGCGCTCCATCTTCAGTGACTTTGTGTTCCTGGAGGCGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACTTGCTGACCACAGGACAAGGTGTTGTGTTGGAGCGCTCCATCTTCAGTGACTTTGTGTTCCTGGAGGCGAT  518

Query  519  GTACAACCAGGGATTCATCCGAAAGCAGTGTGTGGACCACTACAACGAGGTGAAGAGCGTCACCATCTGCGATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACAACCAGGGATTCATCCGAAAGCAGTGTGTGGACCACTACAACGAGGTGAAGAGCGTCACCATCTGCGATT  592

Query  593  ACCTGCCCCCCCACCTGGTGATTTACATCGATGTGCCCGTTCCAGAGGTCCAGAGGCGGATTCAGAAGAAAGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTGCCCCCCCACCTGGTGATTTACATCGATGTGCCCGTTCCAGAGGTCCAGAGGCGGATTCAGAAGAAAGGA  666

Query  667  GATCCACATGAAATGAAGATCACCTCTGCCTATCTACAGGACATTGAGAATGCCTATAAGAAAACCTTTCTCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCCACATGAAATGAAGATCACCTCTGCCTATCTACAGGACATTGAGAATGCCTATAAGAAAACCTTTCTCCC  740

Query  741  TGAGATGAGTGAAAAATGTGAGGTTTTACAGTATTCTGCAAGGGAAGCTCAAGATTCAAAAAAGGTGGTAGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAGATGAGTGAAAAATGTGAGGTTTTACAATATTCTGCAAGGGAAGCTCAAGATTCAAAAAAGGTGGTAGAGG  814

Query  815  ACATTGAATACCTGAAGTTCGATAAAGGGCCGTGGCTCAAGCAGGACAATCGCACTTTATACCACCTGCGATTA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATTGAATACCTGAAGTTCGATAAAGGGCCGTGGCTCAAGCAGGACAATCGCACTTTATACCACCTGCGATTA  888

Query  889  CTGGTTCAGGATAAGTTTGAGGTGCTGAATTACACAAGCATTCCTATCTTTCTCCCGGAAGTCACCATTGGAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGTTCAGGATAAGTTTGAGGTGCTGAATTACACAAGCATTCCTATCTTTCTCCCGGAAGTCACCATTGGAGC  962

Query  963  TCATCAGACTGACCGTGTCTTACATCAGTTCAGAGAGCTGCCGGGCCGCAAGTACAG------CCCTGGGTACA  1030
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||.|||      |..|||    |
Sbjct  963  TCATCAGACTGACCGTGTCTTACATCAGTTCAGAG---------------AGTTCAGTCTCTTCAATGG----A  1017

Query 1031  ACACCGAGGTGGGAGACAAGTG-------GAT-CTG-GC--------TGAAG----------------------  1065
            |         ||.||.||..||       ||| ||| ||        |||||                      
Sbjct 1018  A---------GGAAGCCAGATGCTGTTAAGATACTGTGCTCCCTCCTTGAAGCTGATCGTTCCCTCCTTGAAGC  1082

Query 1066  -------------------------------------------  1065
                                                       
Sbjct 1083  TGATCGTTCCCTCCTTGAAGCTGATCGTGTCCAAGATAGTTGC  1125