Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470545
• Subject: NM_009762.2
• Aligned Length: 1470
• Identities: 1280
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGACAATAGGGAGAATGGAGAACGTGGAGGTCTTCACCGCTGAGGGCAAAGGAAGGGGTCTGAAGGCCACCAA  74
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGACAATAGGCAGCATGGAGAACGTGGAGGTCTTCACTTCCGAGGGCAAAGGCAGAGGTCTGAAGGCTACGAA  74

Query   75  GGAGTTCTGGGCTGCAGATATCATCTTTGCTGAGCGGGCTTATTCCGCAGTGGTTTTTGACAGCCTTGTTAATT  148
            |||||||||||||||.|||.||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||..||||.|
Sbjct   75  GGAGTTCTGGGCTGCGGATGTCATCTTTGCGGAGAGGGCTTATTCTGCAGTGGTTTTTGACAGCCTCATTAACT  148

Query  149  TTGTGTGCCACACCTGCTTCAAGAGGCAGGAGAAGCTCCATCGCTGTGGGCAGTGCAAGTTTGCCCATTACTGC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TCGTGTGCCACACCTGCTTCAAGAGGCAGGAGAAGCTCCATCGCTGCGGGCAGTGCAAGTTCGCCCATTACTGC  222

Query  223  GACCGCACCTGCCAGAAGGATGCTTGGCTGAACCACAAGAATGAATGTTCGGCCATCAAGAGATATGGGAAGGT  296
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||..|.||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  223  GACCGCACGTGCCAGAAGGATGCTTGGCTGAATCACAAGAACGAGTGCGCTGCCATCAAGAAATATGGGAAAGT  296

Query  297  GCCCAATGAGAACATCAGGCTGGCGGCGCGCATCATGTGGAGGGTGGAGAGAGAAGGCACCGGGCTCACGGAGG  370
            ||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  297  GCCCAACGAGAACATCAGGCTGGCCGCCCGCATCATGTGGCGGGTGGAGAGAGAGGGCACTGGGCTCACAGAGG  370

Query  371  GCTGCCTGGTGTCCGTGGACGACTTGCAGAACCACGTGGAGCACTTTGGGGAGGAGGAGCAGAAGGACCTGCGG  444
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  371  GCTGCCTGGTGTCCGTGGATGACTTACAGAACCACGTGGAGCACTTTGGGGAGGAGGAGCAGAAGGAACTCCGA  444

Query  445  GTGGACGTGGACACATTCTTGCAGTACTGGCCGCCGCAGAGCCAGCAGTTCAGCATGCAGTACATCTCGCACAT  518
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  445  GTAGACGTGGACACGTTCTTGCAGTACTGGCCACCACAGAGCCAGCAGTTCAGCATGCAGTATATCTCACACAT  518

Query  519  CTTCGGAGTGATTAACTGCAACGGTTTTACTCTCAGTGATCAGAGAGGCCTGCAGGCCGTGGGCGTAGGCATCT  592
            |||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||
Sbjct  519  CTTTGGTGTGATCAACTGCAACGGTTTCACTCTCAGTGACCAGAGAGGGCTACAGGCAGTAGGTGTGGGCATCT  592

Query  593  TCCCCAACCTGGGCCTGGTGAACCATGACTGTTGGCCCAACTGTACTGTCATATTTAACAATGGCAATCATGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||       
Sbjct  593  TCCCCAACCTGGGCCTGGTGAACCATGATTGCTGGCCAAACTGCACTGTCATATTCAACAATGGCAA-------  659

Query  667  GCAGTGAAATCCATGTTTCATACCCAGATGAGAATTGAGCTCCGGGCCCTAGGCAAGATCTCAGAAGGAGAGGA  740
                                            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  660  --------------------------------GATTGAGCTCCGGGCCCTGGGCAAGATCTCAGAAGGCGAGGA  701

Query  741  GCTGACTGTGTCCTATATTGACTTCCTCAACGTTAGTGAAGAACGCAAGAGGCAGCTGAAGAAGCAGTACTACT  814
            |||||||||||||||.||.||||||||..||.|.|||||.||.||||.|.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct  702  GCTGACTGTGTCCTACATAGACTTCCTGCACCTCAGTGAGGAGCGCAGGCGGCAGCTGAAGAAACAGTACTACT  775

Query  815  TTGACTGCACATGTGAACACTGCCAGAAAAAACTGAAGGATGACCTCTTCCTGGGGGTGAAAGACAACCCCAAG  888
            ||||||||.|.|||||.|||||||||||....||||||||.|||||||||||||..|.|||.||..||||||||
Sbjct  776  TTGACTGCTCCTGTGAGCACTGCCAGAAGGGGCTGAAGGACGACCTCTTCCTGGCAGCGAAGGAAGACCCCAAG  849

Query  889  CCCTCTCAGGAAGTGGTGAAGGAGATGATACAATTCTCCAAGGATACATTGGAAAAGATAGACAAGGCTCGTTC  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  850  CCCTCCCAGGAAGTGGTGAAGGAGATGATACAATTCTCAAAGGATACACTGGAAAAAATAGACAAGGCTCGCTC  923

Query  963  CGAGGGTTTGTATCATGAGGTTGTGAAATTATGCCGGGAGTGCCTGGAGAAGCAGGAGCCAGTGTTTGCTGACA  1036
            |||||||||||||||.|||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  924  CGAGGGTTTGTATCACGAGGTTGTGAAGCTGTGTCGGGAGTGCCTGGAGAAGCAGGAGCCAGTGTTCGCCGACA  997

Query 1037  CCAACATCTACATGCTGCGGATGCTGAGCATTGTTTCGGAGGTCCTTTCCTACCTCCAGGCCTTTGAGGAGGCC  1110
            |||||.|||||.||||.|||.||||.|||||||..||.||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  998  CCAACCTCTACGTGCTTCGGCTGCTCAGCATTGCATCAGAGGTCCTCTCCTACCTCCAGGCCTATGAGGAGGCC  1071

Query 1111  TCGTTCTATGCCAGGAGGATGGTGGACGGCTATATGAAGCTCTACCACCCCAACAATGCCCAACTGGGCATGGC  1184
            ||....|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072  TCACATTATGCCAGGAGGATGGTTGATGGCTACATGAAACTCTACCACCATAACAATGCCCAACTGGGCATGGC  1145

Query 1185  CGTGATGCGGGCAGGGCTGACCAACTGGCATGCTGGTAACATTGAGGTGGGGCACGGGATGATCTGCAAAGCCT  1258
            .||||||.||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1146  TGTGATGAGGGCAGGGCTTACCAACTGGCATGCTGGTCACATCGAAGTGGGGCATGGGATGATCTGCAAAGCCT  1219

Query 1259  ATGCCATTCTCCTGGTGACACACGGACCCTCCCACCCCATCACTAAGGACTTAGAGGCCATGCGGGTGCAGACG  1332
            ||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1220  ATGCTATTCTCCTGGTGACCCATGGACCCTCCCACCCTATCACCAAAGACTTAGAGGCCATGCGGATGCAGACA  1293

Query 1333  GAGATGGAGCTACGCATGTTCCGCCAGAACGAATTCATGTACTACAAGATGCGCGAGGCTGCCCTGAACAACCA  1406
            |||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1294  GAGATGGAGCTGCGTATGTTCCGCCAAAACGAATTCATGTATCACAAGATGCGAGAGGCTGCCCTGAACAACCA  1367

Query 1407  GCCCATGCAGGTCATGGCCGAGCCCAGCAATGAGCCATCCCCAGCTCTGTTCCACAAGAAGCAA  1470
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1368  GCCCATGCAGGTCATGGCTGAGCCTAGCAATGAACCAGCCCCCGCTCTGTTCCATAAGAAGCAG  1431