Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470566
- Subject:
- XM_024448162.1
- Aligned Length:
- 2211
- Identities:
- 2015
- Gaps:
- 195
Alignment
Query 1 ATGCCTGGGAAACTCCTCTGGGGGGACATTATGGAGCTGGAAGCACCCTTGGAGGAGTCCGAGAGCCAGAAGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAGAGGCAAAAGAGTGACAGAAGGAAGTCAAGGCACCATTATGACTCGGATGAGAAATCAGAAACAAGAGAAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATGGTGTTACAGATGACCTGGATGCTCCCAAGGCCAAAAAATCTAAAATGAAAGAGAAGCTAAATGGAGACACT 222
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------ATGAAAGAGAAGCTAAATGGAGACACT 27
Query 223 GAAGAAGGATTTAATAGACTTTCAGATGAATTCTCCAAATCTCATAAGTCAAGAAGAAAAGATCTACCAAATGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 28 GAAGAAGGATTTAATAGACTTTCAGATGAATTCTCCAAATCTCATAAGTCAAGAAGAAAAGATCTACCAAATGG 101
Query 297 AGATATAGATGAATATGAAAAAAAATCAAAGCGAGTATCATCTTTAGATACTTCTACTCATAAATCAAGTGATA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 102 AGATATAGATGAATATGAAAAAAAATCAAAGCGAGTATCATCTTTAGATACTTCTACTCATAAATCAAGTGATA 175
Query 371 ATAAACTAGAGGAGACCTTAACACGTGAACAGAAAGAAGGAGCCTTCTCCAATTTTCCTATTTCTGAAGAGACT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 176 ATAAACTAGAGGAGACCTTAACACGTGAACAGAAAGAAGGAGCCTTCTCCAATTTTCCTATTTCTGAAGAGACT 249
Query 445 ATAAAGCTTCTGAAAGGTCGAGGGGTAACATATCTCTTTCCTATTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTGTATATGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 ATAAAGCTTCTGAAAGGTCGAGGGGTAACATATCTCTTTCCTATTCAAGTTAAGACCTTTGGTCCTGTATATGA 323
Query 519 AGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACGGACAGGAACAGGAAAGACATTCTCTTTTGCCATCCCCTTAATTGAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 AGGAAAAGATTTAATAGCTCAAGCACGGACAGGAACAGGAAAGACATTCTCTTTTGCCATCCCCTTAATTGAAA 397
Query 593 GACTCCAAAGAAATCAAGAAACAATTAAAAAAAGCCGCTCACCAAAGGTACTTGTTTTGGCTCCAACAAGGGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 GACTCCAAAGAAATCAAGAAACAATTAAAAAAAGCCGCTCACCAAAGGTACTTGTTTTGGCTCCAACAAGGGAA 471
Query 667 CTGGCAAACCAAGTAGCCAAAGACTTCAAAGATATAACTAGGAAACTCAGCGTGGCGTGTTTTTATGGTGGAAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 CTGGCAAACCAAGTAGCCAAAGACTTCAAAGATATAACTAGGAAACTCAGCGTGGCGTGTTTTTATGGTGGAAC 545
Query 741 ATCATATCAAAGCCAAATTAATCATATTCGAAATGGTATTGACATCTTGGTTGGAACACCTGGTCGTATCAAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 ATCATATCAAAGCCAAATTAATCATATTCGAAATGGTATTGACATCTTGGTTGGAACACCTGGTCGTATCAAAG 619
Query 815 ACCATCTGCAGAGTGGCCGATTGGATCTTTCTAAACTGCGACATGTTGTGCTTGATGAAGTGGATCAGATGTTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 ACCATCTGCAGAGTGGCCGATTGGATCTTTCTAAACTGCGACATGTTGTGCTTGATGAAGTGGATCAGATGTTA 693
Query 889 GATTTAGGTTTCGCTGAACAAGTTGAAGATATTATTCATGAATCCTACAAAACTGATTCTGAAGACAATCCTCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 GATTTAGGTTTCGCTGAACAAGTTGAAGATATTATTCATGAATCCTACAAAACTGATTCTGAAGACAATCCTCA 767
Query 963 GACTTTACTTTTTTCTGCAACTTGCCCACAGTGGGTATACAAAGTTGCAAAAAAATACATGAAATCCAGATATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 GACTTTACTTTTTTCTGCAACTTGCCCACAGTGGGTATACAAAGTTGCAAAAAAATACATGAAATCCAGATATG 841
Query 1037 AACAGGTTGACCTTGTTGGAAAAATGACTCAAAAGGCTGCAACTACTGTGGAACATTTGGCCATCCAGTGTCAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 AACAGGTTGACCTTGTTGGAAAAATGACTCAAAAGGCTGCAACTACTGTGGAACATTTGGCCATCCAGTGTCAT 915
Query 1111 TGGTCTCAGAGGCCAGCAGTTATTGGAGATGTCCTTCAAGTCTACAGTGGGTCTGAAGGGAGGGCTATTATTTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 TGGTCTCAGAGGCCAGCAGTTATTGGAGATGTCCTTCAAGTCTACAGTGGGTCTGAAGGGAGGGCTATTATTTT 989
Query 1185 CTGTGAGACCAAGAAGAATGTAACTGAAATGGCCATGAATCCACACATAAAACAGAATGCCCAGTGTTTACATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 CTGTGAGACCAAGAAGAATGTAACTGAAATGGCCATGAATCCACACATAAAACAGAATGCCCAGTGTTTACATG 1063
Query 1259 GGGACATTGCACAGTCACAAAGAGAAATTACACTAAAAGGCTTCAGAGAAGGTAGTTTTAAAGTTTTGGTGGCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 GGGACATTGCACAGTCACAAAGAGAAATTACACTAAAAGGCTTCAGAGAAGGTAGTTTTAAAGTTTTGGTGGCA 1137
Query 1333 ACCAATGTGGCTGCCCGTGGTTTGGACATTCCTGAAGTTGACCTGGTGATTCAAAGTTCTCCTCCTCAGGATGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 ACCAATGTGGCTGCCCGTGGTTTGGACATTCCTGAAGTTGACCTGGTGATTCAAAGTTCTCCTCCTCAGGATGT 1211
Query 1407 TGAGTCCTATATCCATCGCTCTGGACGCACAGGTAGAGCTGGACGGACAGGGATTTGTATATGTTTTTATCAAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212 TGAGTCCTATATCCATCGCTCTGGACGCACAGGTAGAGCTGGACGGACAGGGATTTGTATATGTTTTTATCAAC 1285
Query 1481 CAAGAGAAAGAGGTCAACTAAGATATGTGGAACAAAAAGCAGGAATTACTTTTAAACGTGTAGGTGTTCCTTCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286 CAAGAGAAAGAGGTCAACTAAGATATGTGGAACAAAAAGCAGGAATTACTTTTAAACGTGTAGGTGTTCCTTCT 1359
Query 1555 ACAATGGATTTAGTTAAATCTAAAAGCATGGATGCCATCAGGTCTCTGGCTTCCGTTTCTTATGCTGCTGTTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1360 ACAATGGATTTAGTTAAATCTAAAAGCATGGATGCCATCAGGTCTCTGGCTTCCGTTTCTTACGCTGCTGTTGA 1433
Query 1629 TTTTTTCCGACCATCAGCTCAGAGACTGATAGAAGAGAAAGGTGCAGTGGATGCATTGGCTGCAGCTTTAGCCC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1434 TTTTTTCCGACCATCAGCTCAGAGACTGATAGAAGAGAAAGGTGCAGTGGATGCATTGGCTGCAGCTTTAGCCC 1507
Query 1703 ACATTTCTGGTGCATCAAGCTTTGAACCACGATCTTTGATCACCTCTGATAAGGGGTTTGTGACCATGACTCTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508 ACATTTCTGGTGCATCAAGCTTTGAACCACGATCTTTGATCACCTCTGATAAGGGGTTTGTGACCATGACTCTG 1581
Query 1777 GAAAGCCTAGAGGAAATACAGGATGTCAGCTGTGCTTGGAAAGAACTTAACAGAAAGCTGAGTAGTAATGCAGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1582 GAAAGCCTAGAGGAAATACAGGATGTCAGCTGTGCTTGGAAAGAACTTAACAGAAAGCTGAGTAGTAATGCAGT 1655
Query 1851 GTCTCAGATTACCAGAATGTGCCTCCTGAAAGGAAATATGGGTGTTTGCTTTGATGTTCCTACAACTGAGTCAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656 GTCTCAGATTACCAGAATGTGCCTCCTGAAAGGAAATATGGGTGTTTGCTTTGATGTTCCTACAACTGAGTCAG 1729
Query 1925 AAAGGTTACAGGCAGAGTGGCATGATTCCGACTGGATACTCTCAGTGCCAGCCAAATTACCTGAAATTGAAGAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730 AAAGGTTACAGGCAGAGTGGCATGATTCCGACTGGATACTCTCAGTGCCAGCCAAATTACCTGAAATTGAAGAA 1803
Query 1999 TATTATGATGGAAACACATCTTCTAATTCCAGACAGAGGAGTGGCTGGTCAAGTGGTCGATCAGGCCGGTCAGG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804 TATTATGATGGAAACACATCTTCTAATTCCAGACAGAGGAGTGGCTGGTCAAGTGGTCGATCAGGCCGGTCAGG 1877
Query 2073 CCGGTCAGGTGGTCGATCTGGCGGCCGGTCAGGTAGACAGAGTCGACAAGGAAGTCGCTCAGGAAGTCGACAAG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1878 CCGGTCAGGTGGTCGATCTGGCGGCCGGTCAGGTAGACAGAGTCGACAAGGAAGTCGCTCAGGAAGTCGACAAG 1951
Query 2147 ATGGTAGAAGACGAAGTGGGAATAGAAATCGATCAAGAAGTGGGGGCCACAAACGGAGTTTTGAC 2211
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1952 ATGGTAGAAGACGAAGTGGGAATAGAAATCGATCAAGAAGTGGGGGCCACAAACGGAGTTTTGAC 2016