Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470587
- Subject:
- XM_011241668.2
- Aligned Length:
- 1706
- Identities:
- 1263
- Gaps:
- 235
Alignment
Query 1 ATGGGACTCCAAGCCTGCCTCCTAGGGCTCTTTGCCCTCATCCTCTCTGGCAAATGCAGTTACAGCCCGGAGCC 74
|||||||||||||||.||||||||||||||.||||.|||.||.||.|.||||||||||.|||||.|||.|||||
Sbjct 1 ATGGGACTCCAAGCCCGCCTCCTAGGGCTCCTTGCTCTCGTCATCGCCGGCAAATGCACTTACAACCCTGAGCC 74
Query 75 CGACCAGCGGAGGACGCTGCCCCCAGGCTGGGTGTCCCTGGGCCGTGCGGACCCTGAGGAAGAGCTGAGTCTCA 148
.|||||||||.|||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGACCAGCGGTGGATGCTGCCTCCAGGCTGGGTGTCCCTGGGCCGCGTGGATCCCGAGGAAGAGCTGAGTCTCA 148
Query 149 CCTTTGCCCTGAGACAGCAGAATGTGGAAAGACTCTCGGAGCTGGTGCAGGCTGTGTCGGATCCCAGCTCTCCT 222
|.|||||.||||.|||||.|||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 CTTTTGCGCTGAAACAGCGGAACCTGGAAAGACTCTCGGAGCTGGTGCAGGCTGTGTCGGATCCTAGCTCTCCT 222
Query 223 CAATACGGAAAATACCTGACCCTAGAGAATGTGGCTGATCTGGTGAGGCCATCCCCACTGACCCTCCACACGGT 296
|||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.|||||.|||||....|||||.||.||||||||||.|||.||
Sbjct 223 CAATATGGAAAGTACCTAACCCTGGAGGATGTAGCTGAGCTGGTTCAACCATCACCCCTGACCCTCCTCACTGT 296
Query 297 GCAAAAATGGCTCTTGGCAGCCGGAGCCCAGAAGTGCCATTCTGTGATCACACAGGACTTTCTGACTTGCTGGC 370
.|||||.|||||||..|||||.|||||||.|||.|||.||||.||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAAAAGTGGCTCTCAGCAGCTGGAGCCCGGAACTGCGATTCAGTGACCACCCAGGACTTTCTGACTTGCTGGC 370
Query 371 TGAGCATCCGACAAGCAGAGCTGCTGCTCCCTGGGGCTGAGTTTCATCACTATGTGGGAGGACCTACGGAAACC 444
||||..|||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||.||.||||||||..|.|||
Sbjct 371 TGAGTGTCCGACAGGCTGAGCTGCTGCTCCCAGGAGCTGAGTTTCATCGCTATGTAGGGGGACCTACAAAGACC 444
Query 445 CATGTTGTAAGGTCCCCACATCCCTACCAGCTTCCACAGGCCTTGGCCCCCCATGTGGACTTTGTGGGGGGACT 518
||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 445 CATGTTATAAGGTCCCCACATCCCTACCAGCTTCCCCAGGCCTTGGCCCCTCATGTGGATTTTGTGGGGGGGCT 518
Query 519 GCACCGTTTTCCCCCAACATCATCCCTGAGGCAACGTCCTGAGCC---GCAGGTGACAGGGACTGTAGGCCTGC 589
|||||||||.|||| |.|||||.|..||.||||||||.||.|| .||||| |||.|||||..||||||
Sbjct 519 GCACCGTTTCCCCC---CTTCATCTCCAAGACAACGTCCAGAACCACAACAGGT---AGGAACTGTTAGCCTGC 586
Query 590 ATCTGGGGGTAACCCCCTCTGTGATCCGTAAGCGATACAACTTGACCTCACAAGACGTGGGCTCTGGCACCAGC 663
|..||||.||.||.||.||||||.|||||.|||||||||||.||||..|..||||.||||||||.|||||||.|
Sbjct 587 ACTTGGGAGTGACTCCGTCTGTGCTCCGTCAGCGATACAACCTGACAGCCAAAGATGTGGGCTCAGGCACCACC 660
Query 664 AATAACAGCCAAGCCTGTGCCCAGTTCCTGGAGCAGTATTTCCATGACTCAGACCTGGCTCAGTTCATGCGCCT 737
||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.||.|||.||.|||||||||||||
Sbjct 661 AACAATAGCCAGGCCTGTGCCCAGTTCCTGGAACAGTACTTCCATAACTCGGATCTGACTGAGTTCATGCGCCT 734
Query 738 CTTCGGTGGCAACTTTGCACATCAGGCATCAGTAGCCCGTGTGGTTGGACAACAGGGCCGGGGCCGGGCCGGGA 811
.||||||||||..|||.||||.|||||.||||||||....||.||||||.|.||.||.||.|||||.||.||||
Sbjct 735 ATTCGGTGGCAGTTTTACACACCAGGCCTCAGTAGCAAAAGTTGTTGGAAAGCAAGGGCGAGGCCGAGCTGGGA 808
Query 812 TTGAGGCCAGTCTAGATGTGCAGTACCTGATGAGTGCTGGTGCCAACATCTCCACCTGGGTCTACAGTAGCCCT 885
|.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 809 TCGAGGCCAGTCTAGATGTGGAATACCTGATGAGTGCTGGTGCCAATATCTCCACTTGGGTCTACAGTAGCCCT 882
Query 886 GGCCGGCATGAGGGACAGGAGCCCTTCCTGCAGTGGCTCATGCTGCTCAGTAATGAGTCAGCCCTGCCACATGT 959
|||||.|||||||.|||||||||||||.|.||.||||||.||||.||.||.|||||||||.|..||||||||||
Sbjct 883 GGCCGCCATGAGGCACAGGAGCCCTTCTTACAATGGCTCCTGCTTCTTAGCAATGAGTCATCTTTGCCACATGT 956
Query 960 GCATACTGTGAGCTATGGAGATGATGAGGACTCCCTCAGCAGCGCCTACATCCAGCGGGTCAACACTGAGCTCA 1033
.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||..||||||||||.|.||||||||||||.|||
Sbjct 957 ACATACTGTGAGTTACGGAGACGATGAAGACTCCCTCAGCAGCATCTACATCCAGAGAGTCAACACTGAGTTCA 1030
Query 1034 TGAAGGCTGCCGCTCGGGGTCTCACCCTGCTCTTCGCCTCAGGTGACAGTGGGGCCGGGTGTTGGTCTGTCTCT 1107
||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1031 TGAAGGCTGCTGCTCGGGGTCTCACCCTCCTTTTTGCCTCAGGTGACACTGGAGCTGGGTGTTGGTCTGTCTCC 1104
Query 1108 GGAAGACACGAGTTCCGCCCTACCTTCCCTGCCTCCAGCCCCTATGTCACCACAGTGGGAGGCACATCCTTCCA 1181
|||||||||.||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||.|
Sbjct 1105 GGAAGACACAAGTTCCGCCCTAGCTTCCCTGCTTCCAGCCCCTATGTTACTACAGTTGGAGGAACCTCCTTCAA 1178
Query 1182 GGAACCTTTCCTCATCACAAATGAAATTGTTGACTATATCAGTGGTGGTGGCTTCAGCAATGTGTTCCCACGGC 1255
|.|.|||||||||||||||.|||||.|.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1179 GAATCCTTTCCTCATCACAGATGAAGTAGTTGACTATATCAGTGGTGGAGGCTTCAGCAATGTTTTCCCACGGC 1252
Query 1256 CTTCATACCAGGAGGAAGCTGTAACGAAGTTCCTGAGCTCTAGCCCCCACCTGCCACCATCCAGTTACTTCAAT 1329
||.|.||||||||||||||.||..|..|||||.|||..||.|||.|.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 CTCCCTACCAGGAGGAAGCAGTGGCCCAGTTCTTGAAATCCAGCTCTCATCTACCACCATCCAGTTACTTCAAT 1326
Query 1330 GCCAGTGGCCGTGCCTACCCAGATGTGGCTGCACTTTCTGATGGCTACTGGGTGGTCAGCAACAGAGTGCCCAT 1403
||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||..||.|||||
Sbjct 1327 GCTAGTGGCCGTGCCTACCCAGATGTTGCCGCACTATCTGATGGCTACTGGGTGGTCAGCAACATGGTCCCCAT 1400
Query 1404 TCCATGGGTGTCCGGAACCTCGG---------CCTCTACTCCAGTGTTTGGGGGGATC-CTATCCTTGATCAAT 1467
|||||||||.||.|||||||||| .||||.|||.| |.| ||.|.||
Sbjct 1401 TCCATGGGTATCTGGAACCTCGGTAAGAATCAGCTCTGCTCTA------------AACGCTCTACT-------- 1454
Query 1468 GAGCACAGGATCCTTAGTGGCCGCCCCCCTCTTGGCTTTCTCAACC----CAAGGCTCTACCAGCAGCATGGGG 1537
|||||.| || ||||| || |.|||.||| ||| ||
Sbjct 1455 -----CAGGAAC--TA----------CCCTC---GC-TCCTCCACCTACACAA---TC---------------- 1488
Query 1538 CAGGACTCTTTGATGTAACCCGTGGCTGCCATGAGTCCTGTCTGGATGAAGAGGTAGAGGGCCAGGGTTTCTGC 1611
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1612 TCTGGTCCTGGCTGGGATCCTGTAACAGGCTGGGGAACACCCAACTTCCCAGCTTTGCTGAAGACTCTACTCAA 1685
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1686 CCCC 1689
Sbjct 1489 ---- 1488