Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470622
- Subject:
- XM_011239935.1
- Aligned Length:
- 1287
- Identities:
- 1074
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ATGGCCAGCCCAAGAACCAGGAAGGTTCTTAAAGAAGTCAGGGTGCAGGATGAGAACAACGTTTGTTTTGAGTG 74
|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||..|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCCAGCCCAAGAACCAGGAAAGTTCTTAAGGAAGTCCGGGCACAGGATGAGAATAATGTTTGCTTTGAGTG 74
Query 75 TGGCGCGTTCAATCCTCAGTGGGTCAGTGTGACCTACGGCATCTGGATCTGCCTGGAGTGCTCGGGGAGACACC 148
|||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 75 TGGTGCGTTCAATCCTCAGTGGGTCAGCGTGACTTATGGCATCTGGATCTGCCTGGAATGCTCTGGGAGACACC 148
Query 149 GCGGGCTTGGGGTTCACCTCAGCTTTGTGCGCTCTGTTACTATGGACAAGTGGAAGGACATTGAGCTTGAGAAG 222
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 GTGGGCTTGGGGTGCACCTCAGCTTTGTGCGCTCTGTTACAATGGACAAATGGAAGGACATTGAGCTGGAGAAG 222
Query 223 ATGAAAGCTGGTGGGAATGCTAAGTTCCGAGAGTTCCTGGAGTCTCAGGAGGATTACGATCCTTGCTGGTCCTT 296
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||.||.|||.|||||||..|
Sbjct 223 ATGAAGGCTGGTGGGAATGCTAAGTTCCGAGAGTTCCTGGAGACACAGGACGACTATGAGCCTAGCTGGTCACT 296
Query 297 GCAGGAGAAGTACAACAGCAGAGCCGCGGCCCTCTTTAGGGATAAGGTGGTCGCTCTGGCCGAAGGCAGAGAGT 370
||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||...||.||||.|||||.|.|||||
Sbjct 297 GCAGGACAAGTACAGCAGCAGAGCCGCGGCGCTCTTCAGGGATAAGGTGGCTACTTTGGCAGAAGGTAAAGAGT 370
Query 371 GGTCTCTGGAGTCATCACCTGCCCAGAACTGGACCCCACCTCAGCCCAGGACGCTGCCGTCCATGGTGCACCGA 444
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||.||..|..||||||
Sbjct 371 GGTCTCTGGAGTCATCGCCTGCACAGAACTGGACCCCACCTCAGCCCAAGACACTGCAGTTCACTGCCCACCGA 444
Query 445 GTCTCTGGCCAGCCGCAGAGTGTGACCGCCTCCTCGGACAAGGCTTTTGAAGACTGGCTGAATGATGACCTCGG 518
|.||||||||||||.|||||||...|||||||...||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 445 GCCTCTGGCCAGCCACAGAGTGCAGCCGCCTCTGGGGACAAGGCTTTTGAAGATTGGCTGAATGATGACCTGGG 518
Query 519 CTCCTATCAAGGGGCCCAGGGGAATCGCTACGTGGGGTTTGGGAACAC---GCCACCGCCTCAGAAGAAAGAAG 589
.|||||.||.||.||.||||.|||||||||.||.|||||||||||||| |||| ||||||||||.|||||
Sbjct 519 TTCCTACCAGGGTGCTCAGGAGAATCGCTATGTAGGGTTTGGGAACACAGTGCCA---CCTCAGAAGAGAGAAG 589
Query 590 ATGACTTCCTCAACAACGCCATGTCCTCCCTGTACTCGGGCTGGAGCAGCTTCACCACTGGAGCCAGCCGGTTT 663
||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||..||||
Sbjct 590 ATGACTTCCTCAACAATGCCATGTCATCGCTGTACTCGGGCTGGAGCAGTTTTACCACTGGGGCGAGCAAGTTT 663
Query 664 GCCTCGGCAGCCAAGGAGGGCGCTACAAAGTTTGGATCCCAAGCGAGTCAGAAGTTTTGGGGTCACAAGCAGCA 737
||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 664 GCATCTGCAGCAAAGGAGGGTGCTACAAAATTTGGATCTCAAGCAAGTCAGAAGTTTTGGGGTTACAAGCAGCA 737
Query 738 GCCGGAGCCGGCGTCCGAGCTGGGCCACAGCCTGAACGAGAACGTCCTCAAGCCTGCGCAGGAGAAGGTGAAGG 811
|.|.||||||||.||.|||.||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 738 GTCAGAGCCGGCTTCGGAGTTGGGCCACAGCCTGAATGAGAATGTTCTCAAGCCTGCACAGGAGAAGGTGAAGG 811
Query 812 AGGGAAAGATTTTTGATGATGTCTCCAGTGGGGTCTCTCAGTTGGCGTCCA------AGGGAGTCGGTAGTAAG 879
||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||| |||||||.||.||||||
Sbjct 812 AGGGAAGGATTTTTGATGATGTGTCCAGTGGGGTCTCTCAGTTGGCATCCAAGGTCCAGGGAGTTGGCAGTAAG 885
Query 880 GGATGGCGGGACGTCACCACCTTTTTTTCGGGGAAAGCAGAGGGCCCCTTGGACAGCCCCTCGGAGGGCCACAG 953
||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||.|.|.|.|..|||||.||||..|||||||||||
Sbjct 886 GGATGGCGTGATGTCACTACTTTCTTCTCTGGGAAAGCCGAAGACTCTTCAGACAGACCCTTAGAGGGCCACAG 959
Query 954 TTATCAGAACAGCGGTCTGGACCACTTCCAAAACAGCAACATAGACCAGAGCTTCTGGGAGACCTTTGGAAGTG 1027
.||.|||||||||.||...|||.|||..||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 960 CTACCAGAACAGCAGTGGAGACAACTCTCAGAACAGCAACATAGACCAGAGCTTCTGGGAGACCTTTGGGAGTG 1033
Query 1028 CTGAGCCCACCAAGACCCGCAAGTCCCCGAGCAGCGACAGCTGGACGTGCGCGGACACCTCCACCGAGAGGAGG 1101
||||||||.|||||.| |||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||..|.||.||.|.|||||||
Sbjct 1034 CTGAGCCCCCCAAGGC---CAAGTCCCCAAGCAGTGACAGCTGGACCTGTGCAGATGCTTCAACAGGGAGGAGG 1104
Query 1102 AGCTCGGACAGCTGGGAGGTGTGGGGC------TCGGCCTCCACCAACAGGAACAGCAACAGCGACGGC----- 1164
|||||||||||||||||.||.|||||| ||.||.||||.|||||.|||||||||.|||||.|||
Sbjct 1105 AGCTCGGACAGCTGGGACGTTTGGGGCTCAGGTTCCGCATCCAACAACAAGAACAGCAATAGCGATGGCTGGGA 1178
Query 1165 -------------------GGGGAGGGCGGGG---AGGGCACCAAGAAGGCAGTGCCGCCGGCCGTGCCCA--- 1213
|||||||||.||| |||.||||||||||||| ||| ||.| |||
Sbjct 1179 GAGTTGGGAGGGAGCCAGTGGGGAGGGCAGGGCAAAGGCCACCAAGAAGGCA--GCC-----CCAT--CCACGG 1243
Query 1214 CTGATGATGGCTGGGACAACCAGAACTGG 1242
|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1244 CTGATGAGGGCTGGGACAACCAGAACTGG 1272