Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470684
- Subject:
- NR_146783.2
- Aligned Length:
- 3716
- Identities:
- 3008
- Gaps:
- 699
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AGAACCCAGCTCTTCCCTACACGGTCGGCACATGCGCGGCAGCTCTTTTCCTTCTTCCTCCACTTCCCCTACCC 74
Query 1 ----------------------------------------------------ATGGCCGCCGCGGAGACCCAGT 22
||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCCACCGTCCGGGAGCCGCCGCCACCGCCGCCGAGGAGTCAGGAAGTTCAAGATGGCCGCCGCGGAGACCCAGT 148
Query 23 CGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAATGAAGAAAATGGAGAAGTATCA 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAATGAAGAAAATGGAGAAGTATCA 222
Query 97 GAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAACACAGAAGTAAACATAAGAAACA 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAACACAGAAGTAAACATAAGAAACA 296
Query 171 TAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAACATAAGAAACACAAAAGAAAAG 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAACATAAGAAACACAAAAGAAAAG 370
Query 245 AGGTTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAAACTTGATGATTTAGCTTTGCTA 318
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGATTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAAACTTGATGATTTAGCTTTGCTA 444
Query 319 GAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGTTAATGGAAGGAAAGGTCCAGTC 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGTTAATGGAAGGAAAGGTCCAGTC 518
Query 393 TGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGGGAAATTCATGAAAAGGCAAGAA 466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGGGAAATTCATGAAAAGGCAAGAA 592
Query 467 ATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACTTGTGGACAATAAAATTACTACA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACTTGTGGACAATAAAATTACTACA 666
Query 541 AAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATAAAAAGAAAAGTAAGGGGGGTAT 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATAAAAAGAAAAGTAAGGGGGGTAT 740
Query 615 TGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAATCTAAAAGCCCATCCAAAAGAA 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAATCTAAAAGCCCATCCAAAAGAA 814
Query 689 GTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCGATCTCAAGAGAAAATTGGTAAG 762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCGATCTCAAGAGAAAATTGGTAAG 888
Query 763 GCCAGATCTCCTACTGATGATAAGGGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCAAAAGATAGGAAAAAATCCCCAA 836
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCAGATCTCCTACTGATGATAA-GGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCAAAAGATAGGAAAAAATCCCCAA 961
Query 837 TTATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGTTGATTTAAGAGGTAAATCCAAA 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 TTATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGTTGATTTAAGAGGTAAATCCAAA 1035
Query 911 GACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATC 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 GACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATC 1109
Query 985 TCCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGACCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAA 1058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TCCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGACCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAA 1183
Query 1059 GAAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACTTTTGAATGATAGAAGATCTAAG 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 GAAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACTTTTGAATGATAGAAGATCTAAG 1257
Query 1133 CAGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCCGATCCTTAGAAAGAAAACGACG 1206
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 CAGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCCGATCCTTAGAAAGAAAACGACG 1331
Query 1207 AGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGATATCCTCAGTAGACGTGAAAGAT 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 AGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGATATCCTCAGTAGACGTGAAAGAT 1405
Query 1281 CAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAGATCTCCCATTAGAAGGAGGTCT 1354
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 CAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAGATCTCCCATTAGAAGGAGGTCT 1479
Query 1355 CGTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTACTCGGAGAAGGGACAGAGGTCGGAG 1428
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 CGTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTCCTCGGAGAAGGGACAGAGGTCGGAG 1553
Query 1429 GAGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGG 1502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 GAGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGG 1627
Query 1503 AAGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATCTTCGTCTGATGATAACCTTGAA 1576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 AAGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATCTTCGTCTGATGATAACCTTGAA 1701
Query 1577 GACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAATCCAAAGGCAGGCAATTGTTCA 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 GACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAATCCAAAGGCAGGCAATTGTTCA 1775
Query 1651 GAAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCAAGCAGCCCCCAGAGCAGTACGA 1724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 GAAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCAAGCAGCCCCCAGAGCAGTACGA 1849
Query 1725 GAACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGTTAAAGAGTATGAACGGGAAAAT 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 GAACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGTTAAAGAGTATGAACGGGAAAAT 1923
Query 1799 GTTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTGAACAGAATAATGGTTCATCTCA 1872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 GTTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTGAACAGAATAATGGTTCATCTCA 1997
Query 1873 GAAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCTGCGTATTTTGATAGTGCTCGTC 1946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 GAAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCTGCGTATTTTGATAGTGCTCGTC 2071
Query 1947 TTCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGATAACTGGACCGATGCAGAAGGC 2020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072 TTCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGATAACTGGACCGATGCAGAAGGC 2145
Query 2021 TATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATGGCTACACTGGGCAAGGTGTATT 2094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 TATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATGGCTACACTGGGCAAGGTGTATT 2219
Query 2095 CAGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCTGTAAAGATCATCAGAAACAATG 2168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 CAGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCTGTAAAGATCATCAGAAACAATG 2293
Query 2169 AGCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAATGATGCTGATCCTGATGACAAA 2242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294 AGCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAATGATGCTGATCCTGATGACAAA 2367
Query 2243 ATTCATTGTCTGAGA-TCTTCAGGCAC-TCTATCACCAGCAGCATC-TTGTCTGGTATTCGAGCCTCTCAGCAT 2313
.|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||.||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368 TTTCATTGTCTGAGACTCTTCAGGCACTTCTATCACAAGCAGCATCTTTGTCTGGTATTCGAGCCTCTCAGCAT 2441
Query 2314 GAACTTACGAGAGGTG-TAAAAAAATATGTNAAAGATGTTGGTCTTCATATTAAGNCTGTAAGATCCTATAGTC 2386
|||||||||||||||| ||||||||||||..|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||
Sbjct 2442 GAACTTACGAGAGGTGTTAAAAAAATATGGTAAAGATGTTGGTCTTCATATTAAAGCTGTAAGATCCTATAGTC 2515
Query 2387 AGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCNTACATGCAGATATCAAGCCAGACAATATC 2460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516 AGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCCTACATGCAGATATCAAGCCAGACAATATC 2589
Query 2461 CTGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTTCACATGTTGCGGATAATGACAT 2534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590 CTGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTTCACATGTTGCGGATAATGACAT 2663
Query 2535 AACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGTAAAAGCTATGACTATGGTATAG 2608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664 AACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGTAAAAGCTATGACTATGGTATAG 2737
Query 2609 ATATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTTATTCCCTGGCAAAACCAATAAC 2682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738 ATATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTTATTCCCTGGCAAAACCAATAAC 2811
Query 2683 CATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGATTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGA 2756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 CATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGATTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGA 2885
Query 2757 TCAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTG 2830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886 TCAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTG 2959
Query 2831 TTATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAA 2904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2960 TTATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAA 3033
Query 2905 CGTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGGACCCAGCTAAACGAATTAGCAT 2978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034 CGTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGGACCCAGCTAAACGAATTAGCAT 3107
Query 2979 CAACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATT---------------------------------- 3018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3108 CAACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATTTAAACAAGATGAAGAAACTCCAAGGGTTTGAGTA 3181
Query 3019 -------------------------------------------------------------------------- 3018
Sbjct 3182 AATACAAAGACTGAAGAAATTTCACAGCAGTTTATTAATGTGTGTGTGTGCAGGCCACAGCAGCATGCCCTTGG 3255
Query 3019 -------------------------------------------------------------------------- 3018
Sbjct 3256 TGTAGTCAGTGCCGAAAGGGGTCTGTTCCTTCTTGAGCCTGCCTGCAGGGATGGTCTCCTTTTAAAGCAGGTTG 3329
Query 3019 -------------------------------------------------------------------------- 3018
Sbjct 3330 TGTGCAGCATTCAGTACACTGAAGGCATAAACCTTCCACTCTTGAACAAAGCAGCTGCTTTTTAAAAGCGAGAA 3403
Query 3019 -------------------------------------------------------------------------- 3018
Sbjct 3404 AAAGGAAAACGGGGCACAGGCCATTCGACGCCTTCTCCAAGGGGTCTGATTTGCTGAGACACCAGCTTCACCTT 3477
Query 3019 -------------------------------------------------------------------------- 3018
Sbjct 3478 CTTAACAAGGTGCAGCTCAGTGGAAGATGATGACAACCAGAAGACATGAGCTAAGGGTAAGGGACTGTTCTGAA 3551
Query 3019 -------------------------------------------------------------------------- 3018
Sbjct 3552 GAACCTTTCCATTTAGTGATCAAGATATGGAAGCTGATTTCTGAAAATGCTCAGTGTGTACTCTAATTATTTAT 3625
Query 3019 -------------------------------------------------------------------------- 3018
Sbjct 3626 GGTACCATTTGAATTGTAACTTGCATTTTAGCAGTGCATGTTTCTAATTGACTTACTGGGAAACTGAATAAAAT 3699
Query 3019 ---------------- 3018
Sbjct 3700 ATGCCTCTTATTATCA 3715