Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470684
• Subject: NR_146784.2
• Aligned Length: 3583
• Identities: 3008
• Gaps: 566

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGAACCCAGCTCTTCCCTACACGGTCGGCACATGCGCGGCAGCTCTTTTCCTTCTTCCTCCACTTCCCCTACCC  74

Query    1  ----------------------------------------------------ATGGCCGCCGCGGAGACCCAGT  22
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCACCGTCCGGGAGCCGCCGCCACCGCCGCCGAGGAGTCAGGAAGTTCAAGATGGCCGCCGCGGAGACCCAGT  148

Query   23  CGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAATGAAGAAAATGGAGAAGTATCA  96
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCTACGGGAGCAGCCAGAGATGGAAGATGCTAATTCTGAAAAGAGTATAAATGAAGAAAATGGAGAAGTATCA  222

Query   97  GAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAACACAGAAGTAAACATAAGAAACA  170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGACCAGTCTCAAAATAAGCACAGTCGTCACAAAAAAAAGAAGCATAAACACAGAAGTAAACATAAGAAACA  296

Query  171  TAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAACATAAGAAACACAAAAGAAAAG  244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAACATTCCTCAGAAGAAGACAAGGATAAAAAACATAAACATAAGCATAAACATAAGAAACACAAAAGAAAAG  370

Query  245  AGGTTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAAACTTGATGATTTAGCTTTGCTA  318
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGATTATTGATGCTTCTGATAAAGAGGGTATGTCTCCAGCAAAAAGAACTAAACTTGATGATTTAGCTTTGCTA  444

Query  319  GAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGTTAATGGAAGGAAAGGTCCAGTC  392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGACTTGGAAAAACAGAGAGCCTTGATTAAGGCCGAACTTGATAATGAGTTAATGGAAGGAAAGGTCCAGTC  518

Query  393  TGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGGGAAATTCATGAAAAGGCAAGAA  466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGTATGGGGCTCATTTTGCAAGGTTATGAGTCTGGCTCTGAAGAAGAGGGGGAAATTCATGAAAAGGCAAGAA  592

Query  467  ATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACTTGTGGACAATAAAATTACTACA  540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGGAAATAGGTCTAGTACTAGATCTTCAAGTACAAAGGGGAAACTTGAACTTGTGGACAATAAAATTACTACA  666

Query  541  AAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATAAAAAGAAAAGTAAGGGGGGTAT  614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAAACGAAGTAAAAGCAGATCCAAAGAACGGACTAGACATAGGTCTGATAAAAAGAAAAGTAAGGGGGGTAT  740

Query  615  TGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAATCTAAAAGCCCATCCAAAAGAA  688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAAATCGTTAAAGAGAAAACAACTAGGAGCAAGTCAAAGGAGAGGAAAAAATCTAAAAGCCCATCCAAAAGAA  814

Query  689  GTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCGATCTCAAGAGAAAATTGGTAAG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTAAGTCTCAAGATCAAGCAAGGAAATCAAAATCCCCTACCCTTAGAAGGCGATCTCAAGAGAAAATTGGTAAG  888

Query  763  GCCAGATCTCCTACTGATGATAAGGGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCAAAAGATAGGAAAAAATCCCCAA  836
            ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCAGATCTCCTACTGATGATAA-GGTTAAAATTGAAGATAAAAGTAAATCAAAAGATAGGAAAAAATCCCCAA  961

Query  837  TTATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGTTGATTTAAGAGGTAAATCCAAA  910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TTATAAATGAAAGTAGAAGTCGCGATCGAGGTAAAAAATCCAGATCCCCAGTTGATTTAAGAGGTAAATCCAAA  1035

Query  911  GACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATC  984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GACAGAAGGTCACGGTCCAAAGAGAGAAAATCAAAACGGTCTGAAACTGATAAAGAAAAGAAGCCAATTAAATC  1109

Query  985  TCCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGACCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAA  1058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  TCCCTCTAAAGATGCTTCATCTGGGAAAGAAAATAGGTCACCCAGCAGAAGACCTGGTCGTAGTCCTAAAAGAA  1183

Query 1059  GAAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACTTTTGAATGATAGAAGATCTAAG  1132
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  GAAGTTTGTCTCCAAAACCACGTGATAAATCAAGAAGAAGCAGGTCTCCACTTTTGAATGATAGAAGATCTAAG  1257

Query 1133  CAGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCCGATCCTTAGAAAGAAAACGACG  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  CAGAGCAAATCCCCCTCGCGGACACTGTCTCCTGGGAGAAGAGCCAAGAGCCGATCCTTAGAAAGAAAACGACG  1331

Query 1207  AGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGATATCCTCAGTAGACGTGAAAGAT  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  AGAACCAGAGAGGAGACGACTTTCTTCTCCAAGAACACGACCTCGAGATGATATCCTCAGTAGACGTGAAAGAT  1405

Query 1281  CAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAGATCTCCCATTAGAAGGAGGTCT  1354
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CAAAAGATGCCAGCCCCATCAATAGATGGTCTCCAACCCGAAGAAGAAGTAGATCTCCCATTAGAAGGAGGTCT  1479

Query 1355  CGTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTACTCGGAGAAGGGACAGAGGTCGGAG  1428
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  CGTTCCCCACTCAGACGTAGCAGGTCTCCAAGAAGAAGAAGCAGATCTCCTCGGAGAAGGGACAGAGGTCGGAG  1553

Query 1429  GAGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGG  1502
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  GAGCAGATCACGCTTGCGAAGGCGGTCTCGATCACGCGGTGGTCGTAGACGAAGGAGCAGAAGCAAAGTAAAGG  1627

Query 1503  AAGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATCTTCGTCTGATGATAACCTTGAA  1576
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  AAGATAAATTTAAAGGAAGTCTTTCTGAAGGAATGAAAGTTGAGCAGGAATCTTCGTCTGATGATAACCTTGAA  1701

Query 1577  GACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAATCCAAAGGCAGGCAATTGTTCA  1650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  GACTTTGATGTAGAGGAAGAAGATGAAGAAGCCCTAATAGAACAGAGAAGAATCCAAAGGCAGGCAATTGTTCA  1775

Query 1651  GAAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCAAGCAGCCCCCAGAGCAGTACGA  1724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776  GAAATATAAATACCTTGCTGAAGATAGCAACATGTCTGTGCCATCTGAACCAAGCAGCCCCCAGAGCAGTACGA  1849

Query 1725  GAACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGTTAAAGAGTATGAACGGGAAAAT  1798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850  GAACACGATCACCATCTCCAGATGACATTCTGGAGCGAGTAGCTGCTGATGTTAAAGAGTATGAACGGGAAAAT  1923

Query 1799  GTTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTGAACAGAATAATGGTTCATCTCA  1872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  GTTGATACATTTGAGGCCTCAGTGAAAGCCAAGCATAATCTAATGACAGTTGAACAGAATAATGGTTCATCTCA  1997

Query 1873  GAAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCTGCGTATTTTGATAGTGCTCGTC  1946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998  GAAGAAGTTGTTGGCACCTGATATGTTTACAGAATCTGATGATATGTTTGCTGCGTATTTTGATAGTGCTCGTC  2071

Query 1947  TTCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGATAACTGGACCGATGCAGAAGGC  2020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072  TTCGGGCCGCTGGCATTGGAAAAGATTTCAAAGAGAATCCCAACCTCAGAGATAACTGGACCGATGCAGAAGGC  2145

Query 2021  TATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATGGCTACACTGGGCAAGGTGTATT  2094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146  TATTATCGTGTGAACATAGGTGAAGTCCTAGATAAACGTTACAATGTGTATGGCTACACTGGGCAAGGTGTATT  2219

Query 2095  CAGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCTGTAAAGATCATCAGAAACAATG  2168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220  CAGTAATGTTGTACGAGCCAGAGATAATGCAAGAGCCAACCAAGAAGTGGCTGTAAAGATCATCAGAAACAATG  2293

Query 2169  AGCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAATGATGCTGATCCTGATGACAAA  2242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294  AGCTCATGCAAAAGACTGGTTTAAAAGAATTAGAGTTCTTGAAAAAACTTAATGATGCTGATCCTGATGACAAA  2367

Query 2243  ATTCATTGTCTGAGA-TCTTCAGGCAC-TCTATCACCAGCAGCATC-TTGTCTGGTATTCGAGCCTCTCAGCAT  2313
            .|||||||||||||| ||||||||||| ||||||||.||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368  TTTCATTGTCTGAGACTCTTCAGGCACTTCTATCACAAGCAGCATCTTTGTCTGGTATTCGAGCCTCTCAGCAT  2441

Query 2314  GAACTTACGAGAGGTG-TAAAAAAATATGTNAAAGATGTTGGTCTTCATATTAAGNCTGTAAGATCCTATAGTC  2386
            |||||||||||||||| ||||||||||||..|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||
Sbjct 2442  GAACTTACGAGAGGTGTTAAAAAAATATGGTAAAGATGTTGGTCTTCATATTAAAGCTGTAAGATCCTATAGTC  2515

Query 2387  AGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCNTACATGCAGATATCAAGCCAGACAATATC  2460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2516  AGCAGTTGTTCCTGGCATTGAAACTCCTTAAAAGATGCAATATCCTACATGCAGATATCAAGCCAGACAATATC  2589

Query 2461  CTGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTTCACATGTTGCGGATAATGACAT  2534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2590  CTGGTTAATGAATCCAAAACTATTTTAAAGCTTTGCGATTTTGGGTCGGCTTCACATGTTGCGGATAATGACAT  2663

Query 2535  AACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGTAAAAGCTATGACTATGGTATAG  2608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2664  AACACCTTATCTTGTCAGTAGATTTTATCGTGCTCCTGAAATCATTATAGGTAAAAGCTATGACTATGGTATAG  2737

Query 2609  ATATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTTATTCCCTGGCAAAACCAATAAC  2682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2738  ATATGTGGTCTGTAGGTTGCACCTTATACGAACTCTATACTGGAAAAATTTTATTCCCTGGCAAAACCAATAAC  2811

Query 2683  CATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGATTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGA  2756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2812  CATATGCTGAAGCTTGCAATGGATCTCAAAGGAAAGATGCCAAATAAGATGATTCGAAAAGGTGTGTTCAAAGA  2885

Query 2757  TCAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTG  2830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886  TCAGCATTTTGATCAAAATCTCAACTTCATGTACATAGAAGTTGATAAAGTAACAGAGAGGGAGAAAGTTACTG  2959

Query 2831  TTATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAA  2904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2960  TTATGAGCACCATTAATCCAACTAAGGACCTGTTGGCTGACTTGATTGGGTGCCAGAGACTTCCTGAAGACCAA  3033

Query 2905  CGTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGGACCCAGCTAAACGAATTAGCAT  2978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3034  CGTAAGAAAGTACACCAGCTAAAGGACTTGTTGGACCAGATTCTGATGTTGGACCCAGCTAAACGAATTAGCAT  3107

Query 2979  CAACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATT----------------------------------  3018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct 3108  CAACCAGGCCCTACAGCACGCCTTCATCCAGGAAAAAATTTAAACAAGATGAAGAAACTCCAAGGGTTTGAGTA  3181

Query 3019  --------------------------------------------------------------------------  3018
                                                                                      
Sbjct 3182  AATACAAAGACTGAAGAAATTTCACAGCAGTTTATTAATGCATAAACCTTCCACTCTTGAACAAAGCAGCTGCT  3255

Query 3019  --------------------------------------------------------------------------  3018
                                                                                      
Sbjct 3256  TTTTAAAAGCGAGAAAAAGGAAAACGGGGCACAGGCCATTCGACGCCTTCTCCAAGGGGTCTGATTTGCTGAGA  3329

Query 3019  --------------------------------------------------------------------------  3018
                                                                                      
Sbjct 3330  CACCAGCTTCACCTTCTTAACAAGGTGCAGCTCAGTGGAAGATGATGACAACCAGAAGACATGAGCTAAGGGTA  3403

Query 3019  --------------------------------------------------------------------------  3018
                                                                                      
Sbjct 3404  AGGGACTGTTCTGAAGAACCTTTCCATTTAGTGATCAAGATATGGAAGCTGATTTCTGAAAATGCTCAGTGTGT  3477

Query 3019  --------------------------------------------------------------------------  3018
                                                                                      
Sbjct 3478  ACTCTAATTATTTATGGTACCATTTGAATTGTAACTTGCATTTTAGCAGTGCATGTTTCTAATTGACTTACTGG  3551

Query 3019  -------------------------------  3018
                                           
Sbjct 3552  GAAACTGAATAAAATATGCCTCTTATTATCA  3582