Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470691
• Subject: XM_017316104.1
• Aligned Length: 1494
• Identities: 1066
• Gaps: 357

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCAAACATCCCCAACGCGACCCAGTTAGGCAGGAGCCAAGAGGAGTGGTGGGGAAATAAACGAGAATACGA  74

Query    1  ----------------------ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGC  52
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGC  148

Query   53  GGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCC  126
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGCACTACGGCGCGCACGCC  222

Query  127  CCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGAT  200
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.||
Sbjct  223  CCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAAAGAGACAAGGACGCAAT  296

Query  201  CTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGG  274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGG  370

Query  275  AACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAG  348
            ||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAG  444

Query  349  GTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACT  422
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATACAAGCAATTCAAGTACT  518

Query  423  AAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTT  496
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  AAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCACCGGTACATTAGCTGTT  592

Query  497  TGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTT  570
            |||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTT  666

Query  571  TCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCA  644
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  667  TCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGATGACGCAACCTCAACGCA  740

Query  645  CTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGG  718
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  CTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGCG  814

Query  719  ATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAG  792
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACAAGGACAAAAAACGCCAG  888

Query  793  AAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCC  866
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  AAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTCCAGCATCTCACACACCC  962

Query  867  GTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGT  940
            |||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  963  GTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCTGCAAGTGAACAACTGGT  1036

Query  941  TTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG--------------------  994
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct 1037  TTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTGATCCT  1110

Query  995  -CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACA  1067
             |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACA  1184

Query 1068  CATGGGGATCCGGCCTGCA--------------------GGAC-------CTATGAGTGG---AATGGGCATGA  1111
            |||||||||||||||||||                    ||||       ||..|.||||   ||||||.|||.
Sbjct 1185  CATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGAGCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCAATGGGAATGG  1258

Query 1112  ATATGG-GCATGGATGGGCAA-TGGCACT-------ACATG---------------------------------  1143
            .||||| .||      |.||| |..||||       |.|||                                 
Sbjct 1259  GTATGGCCCA------GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAGTTAAGACATGGACCC  1326

Query 1144  --------------------------------------------------------------------------  1143
                                                                                      
Sbjct 1327  CCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGGTGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCC  1400

Query 1144  --------------------------------------------------------------------------  1143
                                                                                      
Sbjct 1401  TGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGG  1474

Query 1144  --------------  1143
                          
Sbjct 1475  ACATTCATGCCCAA  1488