Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470691
• Subject: XM_024449925.1
• Aligned Length: 1399
• Identities: 1127
• Gaps: 263

Alignment

Query    1  ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGGAGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCA  74

Query   75  CCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGCACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGG  148

Query  149  CCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAGCGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCT  222

Query  223  CTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGCGACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGA  296

Query  297  CGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCGCGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTT  370

Query  371  TTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATACAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTA  444

Query  445  GAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCACCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGA  518

Query  519  CCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGTCAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCG  592

Query  593  CTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGATGATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCC  666

Query  667  TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAACAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGC  740

Query  741  TTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATAAGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCA  814

Query  815  AAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTCCAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAG  888

Query  889  AAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCTCCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAAT  962

Query  963  AGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG---------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCAT  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAGGTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCAT  1036

Query 1016  ATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAG--  1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1037  ATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGT  1110

Query 1088  -----GACCTATG--AGTGGA----------------------ATGGGCATGAATATGG-GCATGGATGGGCAA  1131
                 ||.| |||  ||.|||                      |||||.||||.||||| .||      |.|||
Sbjct 1111  TTGCAGAGC-ATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACA------GCCAA  1177

Query 1132  -TGGCACT-------ACATG------------------------------------------------------  1143
             |..||||       |.|||                                                      
Sbjct 1178  GTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCA  1251

Query 1144  --------------------------------------------------------------------------  1143
                                                                                      
Sbjct 1252  AGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACA  1325

Query 1144  -------------------------------------------------------------------  1143
                                                                               
Sbjct 1326  GAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA  1392