Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470774
- Subject:
- NM_001197082.1
- Aligned Length:
- 1303
- Identities:
- 1128
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ATGTCACCCAAGCGCATAGCTAAAAGAAGGTCCCCCCCAGCAGATGCCATCCCCAAAAGCAAGAAGGTGA---- 70
|||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCACCCAAGCGCATAGCTAAGAGAAGGTCACCCCCAGAAGATGCCATCCCCAAAAGCAAGAAGGTGAAAGA 74
Query 71 -----------------------------------AGGTCTCACACAGGTCCCACAGCACAGAACCCGGCTTGG 109
|.|||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 75 CACTCGTAATCGCGGTCCTGCTACTCGCTCGTGCCAAGTCTCACACAGGTCCCACAACACAGAACCAGGCTTGG 148
Query 110 TGCTGACACTAGGCCAGGGCGACGTGGGCCAGCTGGGGCTGGGTGAGAATGTGATGGAGAGGAAGAAGCCGGCC 183
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGCTGACACTGGGCCAGGGCGACGTGGGCCAGCTGGGGCTGGGTGAAAGTGTGCTGGAGAGGAAGAAGCCGGCC 222
Query 184 CTGGTATCCATTCCGGAGGATGTTGTGCAGGCTGAGGCTGGGGGCATGCACACCGTGTGTCTAAGCAAAAGTGG 257
.||||..||.|||.|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||.|||||||
Sbjct 223 TTGGTGCCCCTTCTGCAGGATGTTGTGCAGGCTGAGGCCGGGGGCATGCATACTGTGTGTCTGAGCCAAAGTGG 296
Query 258 CCAGGTCTATTCCTTCGGCTGCAATGATGAGGGTGCCCTGGGAAGGGACACATCAGTGGAGGGCTCGGAGATGG 331
|||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 297 CCAGGTCTACTCCTTTGGCTGCAATGACGAGGGTGCCCTGGGAAGGGACACTTCAGTCGAAGGCTCAGAAATGG 370
Query 332 TCCCTGGGAAAGTGGAGCTGCAAGAGAAGGTGGTACAGGTGTCAGCAGGAGACAGTCACACAGCAGCCCTCACC 405
||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCCCTGGGAAAGTGGAACTGCAAGAGAAAGTGGTGCAAGTGTCAGCGGGGGACAGTCACACAGCAGCCCTCACC 444
Query 406 GATGATGGCCGTGTCTTCCTCTGGGGCTCCTTCCGGGACAATAACGGTGTGATTGGACTGTTGGAGCCCATGAA 479
||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGACGGCCGTGTCTTCCTTTGGGGCTCTTTCCGGGACAATAATGGTGTGATCGGGTTGTTGGAGCCCATGAA 518
Query 480 GAAGAGCATGGTGCCTGTGCAGGTGCAGCTGGATGTGCCTGTGGTAAAGGTGGCCTCAGGAAACGACCACTTGG 553
||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 519 GAAGAGCATGGTACCTGTTCAAGTGCAGCTGGATGCGCCCGTGGTAAAGGTGGCCTCGGGGAACGACCACTTGG 592
Query 554 TGATGCTGAC-AGCTGATGGTGACCTCTACACCTTGGGCTGCGGGGAACAGGGCCAGCTAGGCCGTGTGCCTGA 626
|||||||.|| |.| |||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 593 TGATGCTCACGAAC-GATGGCGACCTCTACACCTTGGGTTGTGGGGAGCAAGGTCAGCTGGGCCGTGTACCTGA 665
Query 627 GTTATTTGCCAACCGTGGTGGCCGGCAAGGCCTCGAACGACTCCTGGTCCCCAAGTGTGTGATGCTGAAATCCA 700
.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|..||||||||||||||||..||||||.||||||||||||
Sbjct 666 ATTATTTGCCAACCGAGGTGGCCGTCAGGGCCTTGGGCGACTCCTGGTCCCCAGATGTGTGCTGCTGAAATCCA 739
Query 701 GGGGAAGCCGGGGCCACGTGAGATTCCAGGATGCCTTTTGTGGTGCCTATTTCACCTTTGCCATCTCCCATGAG 774
||||.|.||||||||..|||.|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||..|||
Sbjct 740 GGGGGACCCGGGGCCGTGTGCGGTTCCAGGATGCCTTCTGTGGCGCCTATTTCACTTTTGCCATCTCCCGAGAG 813
Query 775 GGCCACGTGTACGGCTTCGGCCTCTCCAACTACCATCAGCTTGGAACTCCGGGCACAGAATCTTGCTTCATACC 848
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|.||||||||||||.||
Sbjct 814 GGCCACGTGTATGGCTTTGGCCTCTCCAACTATCACCAGCTCGGGACTCCAGGCACTGGATCTTGCTTCATTCC 887
Query 849 CCAGAACCTAACATCCTTCAAGAATTCCACCAAGTCCTGGGTGGGCTTCTCTGGTGGCCAGCACCATACAGTCT 922
.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 888 TCAAAACTTGACATCCTTCAAGAATTCCACCAAGTCCTGGGTAGGCTTCTCCGGTGGCCAGCATCACACAGTCT 961
Query 923 GCATGGATTCGGAAGGAAAAGCATACAGCCTGGGCCGGGCTGAGTATGGGCGGCTGGGCCTTGGAGAGGGTGCT 996
||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 962 GCATGGATTCGGAAGGGAAGGCGTACAGCCTGGGCCGGGCTGAGTACGGGCGCCTGGGCCTTGGGGAGGGTGCT 1035
Query 997 GAGGAGAAGAGCATACCCACCCTCATCTCCAGGCTGCCTGCTGTCTCCTCGGTGGCTTGTGGGGCCTCTGTGGG 1070
||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|..||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1036 GAGGAGAAGAGCATACCCACCCTCATTTCCCGGCTGCCCGTGGTCTCCTCAGTGGCCTGTGGGGCTTCTGTGGG 1109
Query 1071 GTATGCTGTGACCAAGGATGGTCGTGTTTTCGCCTGGGGCATGGGCACCAACTACCAGCTGGGCACAGGGCAGG 1144
.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1110 TTATGCTGTGTCCAAGGATGGTCGTGTTTTTGCCTGGGGCATGGGCACCAACTACCAGCTGGGCACCGGGCAGG 1183
Query 1145 ATGAGGACGCCTGGAGCCCTGTGGAGATGATGGGCAAACAGCTGGAGAACCGTGTGGTCTTATCTGTGTCCAGC 1218
||||.||.||||||||.||||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.
Sbjct 1184 ATGAAGATGCCTGGAGTCCTGTGGAAATGACTGGCAAACAGCTGGAGAACCGTGTGGTGTTAACTGTGTCCAGT 1257
Query 1219 GGGGGCCAGCATACAGTCTTATTAGTCAAGGACAAAGAACAGAGC 1263
|||||||||||.||.||||||.||||.||||||.|.|.|||||||
Sbjct 1258 GGGGGCCAGCACACGGTCTTACTAGTTAAGGACCAGGCACAGAGC 1302