Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470807
• Subject: XM_024449638.1
• Aligned Length: 1266
• Identities: 1029
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAAAACACAAATGAATTCTATAAGACCAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCCCCGGTTTTATTATAGGCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTAAGAGAGGAATCAAGAGCTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAAGAATTACAGAACTTATGGTTTTTGCTGGACAAA  222

Query    1  ---------------ATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTTTGAAGGTTGGTGAAAAGGC  59
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACCAGACACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTTTGAAGGTTGGTGAAAAGGC  296

Query   60  TGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCATACAGATTCATATGGAAGAA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGAGCAAAGTGCAAGCAATTTTTCACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCATACAGATTCATATGGAAGAA  370

Query  134  TTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAACAAGAATAGGACTCAGTTTA  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGTTTGGCTTCATCAAACAAGAATAGGACTCAGTTTA  444

Query  208  TATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATATTGGAACTTATCCCTACGTT  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATGATGTCGCTGGGCAGGGGTACCTTCGGGAATCTGATTTAGAAAACTACATATTGGAACTTATCCCTACGTT  518

Query  282  GCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCAGTTAGGAAGTTCTTCTTCT  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACTCCTTTTATGTTTGTACAGCAGTTAGGAAGTTCTTCTTCT  592

Query  356  TTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAGCTTCCTAGATGATTTATTG  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTTAGATCCTTTAAGAACAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATGCAGCTTCCTAGATGATTTATTG  666

Query  430  GAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTGCTCCTTCTGCCCTAAGAGT  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCTAAGGGATGAGGAACTGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTGCTCCTTCTGCCCTAAGAGT  740

Query  504  TTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAAGAACTCTCACGCTATGGAA  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTATGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAATGGCATGCTCAGTAAAGAAGAACTCTCACGCTATGGAA  814

Query  578  CAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTATGATGGAGAAATGGACTAT  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCTACCATGACCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTATGATGGAGAAATGGACTAT  888

Query  652  AAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTCTACAATATATTTTCAAACT  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATTAGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTCTACAATATATTTTCAAACT  962

Query  726  GCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTTAGGGCCATACAGGAACTAA  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTTGATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTTAGGGCCATACAGGAACTAA  1036

Query  800  TGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTTTGACATGGTAAAACCAAAG  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGAAAATCCATGGACAAGATCCTGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGATGAAATCTTTGACATGGTAAAACCAAAG  1110

Query  874  GATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAGTAACCACCATTCTAATCGA  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGTAATCAAGGAGACACAGTAACCACCATTCTAATCGA  1184

Query  948  TTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGTGAAAACTCTGCAGACCTTG  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTGAATGGCTTCTGGACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGTGAAAACTCTGCAGACCTTG  1258

Query 1022  ATGATACA  1029
            ||||||||
Sbjct 1259  ATGATACA  1266