Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470813
• Subject: XM_011250125.2
• Aligned Length: 1062
• Identities: 950
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGGGACCAGTCTCTCTTCTTCCAAAATATCAGAAGTTAAACACTTGGAACGGAGATTTGGCCAAGATGACCCA  74
            |||||||||||.|||.|||||||...|..|||||..||||.|||||||.|.||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGGACCAGTTTCTGTTCTTCCCTCACCTCAGAGCTTAAGCACTTGGGAAGGAGATTTGGCCAAGATGACGCA  74

Query   75  TTTACAGGCTGGACTCAGTCCAGAGACTATAGAGAAAGCTCGCCTGGAACTGAATGAAAACCCCGATGTTTTAC  148
            |||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct   75  TTTGCAGGCTGGGCTCAGTCCAGACACTATAGAAAAAGCTCGTCTGGAACTGAATGAAAACCCAGATATTTTAC  148

Query  149  ATCAGGATATTCAGCAAGTCAGGGACATGATCATCACCAGGCCTGACATTGGATTTTTACGTACAGATGATGCC  222
            |||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCAGGACATTCAACAAGTCAGAGACATGATCATCACCAGACCAGACATTGGGTTTTTACGTACAGATGATGCC  222

Query  223  TTCATCCTGAGATTTCTCCGAGCCAGGAAGTTTCACCAAGCGGATGCCTTTAGACTCCTGGCTCAGTATTTCCA  296
            |||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  223  TTCATTCTGCGATTTCTTCGAGCCAGGAAGTTTCACCAAGCCGATGCCTTCAGACTCCTGGCCCAGTACTTTCA  296

Query  297  GTACCGCCAGCTAAACCTGGACATGTTCAAAAACTTCAAGGCAGATGATCCCGGCATTAAGAGGGCTCTGATCG  370
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||
Sbjct  297  GTACCGCCAGCTGAACCTGGACATGTTCAAAAACTTTAAGGCAGATGATCCCGGGATTAAGAGGGCTTTGATCG  370

Query  371  ATGGGTTCCCCGGGGTGCTGGAAAACCGAGACCATTACGGCAGGAAGATTCTTTTGCTGTTTGCAGCCAATTGG  444
            |.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  ACGGATTCCCCGGAGTGCTGGAAAATCGTGACCACTATGGCAGGAAGATTCTCTTGCTGTTTGCTGCCAATTGG  444

Query  445  GATCAGAGTAGGAACTCCTTCACAGACATCCTTCGTGCCATCCTGCTGTCATTGGAAGTCCTAATCGAAGATCC  518
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  GATCAGAGTAGGAACTCCTTCACGGACATCCTCCGTGCCATTCTCCTGTCCTTGGAAGTCCTTATTGAAGATCC  518

Query  519  GGAGCTTCAGATAAATGGCTTCATTTTAATTATAGACTGGAGTAATTTTTCCTTCAAACAAGCCTCCAAACTGA  592
            .|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  519  CGAGCTCCAGATAAACGGTTTCATTTTAATTATAGACTGGAGCAACTTTTCCTTCAAGCAAGCATCCAAGCTGA  592

Query  593  CACCTTCAATCCTTAAACTGGCCATTGAAGGGTTGCAGGACAGCTTTCCTGCCCGCTTTGGAGGAGTCCACTTT  666
            ||||.||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  CACCCTCTATCCTGAAACTGGCCATTGAAGGGCTGCAGGACAGCTTTCCTGCTCGCTTTGGAGGCGTCCATTTT  666

Query  667  GTCAACCAGCCCTGGTACATTCATGCCCTCTACACACTCATCAAGCCATTTCTTAAAGACAAGACCAGGAAACG  740
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  667  GTCAACCAGCCCTGGTACATCCACGCCCTGTACACACTCATCAAGCCATTCCTTAAGGACAAGACAAGAAAACG  740

Query  741  GATTTTCCTGCATGGAAACAATTTAAACAGCCTTCACCAGCTAATACACCCTGAATTTTTGCCCTCTGAATTTG  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||..|||||||||||||||
Sbjct  741  GATTTTCCTACATGGAAACAATTTAAACAGTCTTCACCAGCTAATACACCCCGAGTTCCTGCCCTCTGAATTTG  814

Query  815  GAGGAACTCTTCCTCCTTATGACATGGGAACTTGGGCCCGGACGTTACTCGGTCCCGACTACAGCGATGAAAAT  888
            |||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGGAACCCTTCCTCCTTACGACATGGGGACTTGGGCCCGGACATTACTTGGCCCTGACTACAGCGATGAAAAT  888

Query  889  GACTATACTCACACATCCTATAATGCAATGCACGTGAAGCATACGTCCTCGAATCTGGAGAGAGAATGCTCACC  962
            ||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|..||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  889  GACTATACCCATACTTCCTACAATGCCATGCATGTGAAACACACCTGTTCCAACCTGGAGAGAGAGTGCTCACC  962

Query  963  CAAGCTGATGAAAAGATCTCAGTCTGTGGTAGAAGCTGGGACCCTGAAACATGAGGAGAAGGGAGAGAATGAGA  1036
            |||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  963  CAAGCCCATGAAAAGATCTCAGTCTGTGGTAGAAGCTGGGACCTTGAAACATGAAGAGAAAGGAGAAAATGAGA  1036

Query 1037  ACACCCAGCCACTCCTGG-TCTGGAC  1061
            |||||||||||||.|||| |||||||
Sbjct 1037  ACACCCAGCCACTGCTGGCTCTGGAC  1062