Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470842
• Subject: NM_001144904.2
• Aligned Length: 1208
• Identities: 883
• Gaps: 232

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGGCCTCAGCCTGCC  16
                                                                      |||||        |||
Sbjct    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGGGTGTCTTGGCCATGGC--------GCC  66

Query   17  CAGGCTCTGATTTC-ACGTCTATCCATTCAGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCTTGGAT----TCC-----GACA  80
            |.||..|||    | ||..||.||| ||||          .|||       |||||.|    |||     |.||
Sbjct   67  CTGGTGCTG----CAACTCCTCTCC-TTCA----------TGCT-------CTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCA  118

Query   81  GACTCGAGGATACAAGAGCTTAGCAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACG  154
            ..||.|    |.||          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||||||
Sbjct  119  TCCTTG----TCCA----------AGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACG  178

Query  155  CGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATC  228
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179  CAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATC  252

Query  229  TACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCA  302
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  253  TACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCA  326

Query  303  GGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGC  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  327  GGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGC  400

Query  377  TGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACT  450
            |||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  401  TGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGAC-  473

Query  451  CGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCT  524
                                                           |||                     |||
Sbjct  474  -----------------------------------------------GGA---------------------GCT  479

Query  525  GAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGG  598
            |||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  480  GAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGG  553

Query  599  CTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCA  672
            ||||||||||||||.|.|||||..|.||.|||||||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|||||
Sbjct  554  CTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCA  627

Query  673  GTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTC  746
            .|.|||||||||||||.||.|||||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  TTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTC  701

Query  747  CCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTG  820
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  702  CCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTG  775

Query  821  AGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAAT  894
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  776  AGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAAT  849

Query  895  CAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGA  968
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|||||
Sbjct  850  CAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGA  923

Query  969  GCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTG  1042
            .||||||||....|||.|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|..|||
Sbjct  924  ACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTG  997

Query 1043  CCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCT  1116
            .|||.|.||||||||||||||||.||||||   ||||||.|||.||.|||                        
Sbjct  998  ACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA------------------------  1044

Query 1117  GCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG  1140
                                    
Sbjct 1045  ------------------------  1044