Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470842
• Subject: NM_001144910.2
• Aligned Length: 1275
• Identities: 901
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  ATGGCCTCAGCCTGCCCAGGCTCTGATTTCACGTCTATCCATTCAGAGGAGGAACAGCTGAGAGGCCT--TGGA  72
            |||     ||             |||.|.||.|  .|.|||   || ||.|.|.||||||   |||||  ||||
Sbjct    1  ATG-----AG-------------TGACTCCAAG--GAACCA---AG-GGTGCAGCAGCTG---GGCCTCCTGGA  47

Query   73  --------------------------------TTCCGACAGAC-------TCGAG--GAT--------ACAAGA  97
                                            ||||.|.||||       ||.||  |||        ||||||
Sbjct   48  AGAAGATCCAACAACCAGTGGCATCAGACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGA  121

Query   98  G-------------CTTAGC------------------------------------------------------  104
            |             |||.||                                                      
Sbjct  122  GCTCTACAGGGTGTCTTGGCCATGGCGCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGCTCTTGGCTGGGGTCCTG  195

Query  105  -----------------AGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTA  161
                             ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||.|||||
Sbjct  196  GTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAAGGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTA  269

Query  162  CCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGG  235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  CCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGCAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGG  343

Query  236  AGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTG  309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  AGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTG  417

Query  310  ACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTG  383
            |||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  418  ACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCG  491

Query  384  GCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGA  457
            ||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  492  GCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGAC--------  557

Query  458  AGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCT  531
                                                    |||                     ||||||||||
Sbjct  558  ----------------------------------------GGA---------------------GCTGAAGGCT  570

Query  532  GCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGT  605
            ||||||||||||.|.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  571  GCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGT  644

Query  606  GGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAAC  679
            |||||||.|.|||||..|.||.|||||||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|||||.|.||||
Sbjct  645  GGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCAGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAAC  718

Query  680  GCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAATGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGG  753
            |||||||||.||.|||||||..|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  GCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACTGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGG  792

Query  754  AACTGGCACGACTCCATCACCGCCTGCAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCA  827
            |||||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  793  AACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGCCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCA  866

Query  828  GAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCAGAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAG  901
            |||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  867  GAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAGGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAG  940

Query  902  GCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAAC  975
            |||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  941  GCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCACCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAAC  1014

Query  976  AACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGAATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATT  1049
            ||....|||.|.||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|..|||.|||.|.
Sbjct 1015  AATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTA  1088

Query 1050  CTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCTCCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCC  1123
            ||||||||||||||||.||||||   ||||||.|||.||.|||                               
Sbjct 1089  CTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---CCTGCTTCAGAGACGAA-------------------------------  1128

Query 1124  CAAACCCCCCTCCTGCG  1140
                             
Sbjct 1129  -----------------  1128