Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470849
- Subject:
- NM_001286188.1
- Aligned Length:
- 4047
- Identities:
- 3811
- Gaps:
- 234
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCGCAGCCGCTGCTGCCAGCGCTTCCTCCTCTGTCTTCGCCGAGCGGGGCTGGTTCCTGCGGCCCGAGCGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGGGGAGGTGAAACAGGAGCCCGTCGGAGGAAGGGGCAGAAGGGAGTGGAGAGTCGCCCCCTCCTCGCGGCCAC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GCAGCAGCCCGCGTCTCGCTCTCCCCACCCAGTGCAGTGGCCGCCGCCTCTTCCGCCGCCGGGCTCGGGGCCTC 222
Query 1 ------------ATGGAGGCCGTGAAGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCAT 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CGCAGCGACAACATGGAGGCCGTGAAGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCAT 296
Query 63 TTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATTACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGA 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATTACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGA 370
Query 137 GTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATGTAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTG 210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATGTAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTG 444
Query 211 CGACAATCCCGACATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCAC 284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGACAATCCCGACATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCAC 518
Query 285 TTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCTGGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGA 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCTGGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGA 592
Query 359 ATAATGTATTTAAGAGTGAGATTATTCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACA 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATAATGTATTTAAGAGTGAGATTATTCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACA 666
Query 433 CCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTGCTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAA 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTGCTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAA 740
Query 507 TGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCGTGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGA 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCGTGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGA 814
Query 581 TCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCAGCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAG 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCAGCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAG 888
Query 655 CCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATGCTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGC 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATGCTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGC 962
Query 729 AGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACTCCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTG 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACTCCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTG 1036
Query 803 ATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAGTGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCA 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAGTGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCA 1110
Query 877 GAATCTGTGAACATTTCCATTTTTCATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACA 950
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GAATCTGTGAACAATTCCATTTTTCATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACA 1184
Query 951 GCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCTCAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGC 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCTCAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGC 1258
Query 1025 ATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAGTAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATA 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAGTAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATA 1332
Query 1099 GATATTCAGCAACAGGATATGGATATAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGC 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATATTCAGCAACAGGATATGGATATAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGC 1406
Query 1173 TAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGATCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGT 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGATCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGT 1480
Query 1247 CTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAAGCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGG 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAAGCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGG 1554
Query 1321 AAATCATCACGGTCGTATTCAAGTGAAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACC 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAATCATCACGGTCGTATTCAAGTGAAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACC 1628
Query 1395 TCCAATTAGATCTAAAACACTAAGTGTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACAC 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCCAATTAGATCTAAAACACTAAGTGTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACAC 1702
Query 1469 AGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGAAGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGT 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGAAGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGT 1776
Query 1543 GCTTATGTCTGCATGGTTCATCGACAAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAAT 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GCTTATGTCTGCATGGTTCATCGACAAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAAT 1850
Query 1617 TGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCTTGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATG 1690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCTTGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATG 1924
Query 1691 TGGATCTTGGAGTTACATATATACCATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGC 1764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGGATCTTGGAGTTACATATATACCATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGC 1998
Query 1765 ATGATTGATCAGGAGACTGTAAATACTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCA 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATGATTGATCAGGAGACTGTAAATACTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCA 2072
Query 1839 GACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTTGAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTG 1912
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTTGAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTG 2146
Query 1913 TTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGCGCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCG 1986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGCGCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCG 2220
Query 1987 ATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCAGTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACA 2060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 ATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCAGTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACA 2294
Query 2061 ACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCTCCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTAC 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCTCCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTAC 2368
Query 2135 CAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATTATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTT 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATTATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTT 2442
Query 2209 ATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCAATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAAC 2282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCAATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAAC 2516
Query 2283 TAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAAGTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGAT 2356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAAGTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGAT 2590
Query 2357 CAGTGATTCCAAATGATATTTCAAGTAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCT 2430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CAGTGATTCCAAATGATATTTCAAGTAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCT 2664
Query 2431 GGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAAATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTC 2504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAAATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTC 2738
Query 2505 CAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCCCAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCAC 2578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 CAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCCCAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCAC 2812
Query 2579 CCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACTTTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGA 2652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACTTTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGA 2886
Query 2653 GTACAGCCACCAAATGTTCCAAATACTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACC 2726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GTACAGCCACCAAATGTTCCAAATACTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACC 2960
Query 2727 CCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGGATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGG 2800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGGATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGG 3034
Query 2801 CACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAATACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTT 2874
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 CACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAATACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTT 3108
Query 2875 GATTCAGCTCTTCATCCACCACCCCGTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTT 2948
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GATTCAGCTCTTCATCCACCACCCCGTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTT 3182
Query 2949 TTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTAGACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACA 3022
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 TTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTAGACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACA 3256
Query 3023 TTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTATCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCT 3096
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 TTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTACCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCT 3330
Query 3097 GTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGCGGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAG 3170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGCGGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAG 3404
Query 3171 GGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTAGATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAA 3244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 GGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTAGATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAA 3478
Query 3245 GAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGAGAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTT 3318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 GAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGAGAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTT 3552
Query 3319 CTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGA 3392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 CTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGA 3626
Query 3393 TCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGAGGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCT 3466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 TCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGAGGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCT 3700
Query 3467 GGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGACAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGA 3540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 GGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGACAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGA 3774
Query 3541 GACAGAATTCAAAACACTTGGGTTCCCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCA 3614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 GACAGAATTCAAAACACTTGGGTTCCCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCA 3848
Query 3615 ACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAGGTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAG 3688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 ACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAGGTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAG 3922
Query 3689 TACAGAATGATCCTGAACTTTATGAAAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTT 3762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 TACAGAATGATCCTGAACTTTATGAAAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTT 3996
Query 3763 GCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGGTAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA 3813
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3997 GCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGGTAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA 4047