Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470849
- Subject:
- NM_134123.3
- Aligned Length:
- 3817
- Identities:
- 3371
- Gaps:
- 17
Alignment
Query 1 ATGGAGGCCGTGAAGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCATTTCGAAAGCGAA 74
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1 ATGGAGGCCGTGAAGACCTTCAACAGCGAGTTGTATTCACTGAATGACTATAAGCCACCCATTTCTAAAGCAAA 74
Query 75 AATGACCCAAATTACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGAGTGTTGAGAAGT 148
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 AATGACCCAAATTACAAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTTTATAAACATGTGGTACAAAGTGTTGAGAAAT 148
Query 149 TTATTCAGAAATGTAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGA 222
|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 TCATTCAGAAATGTAAACCAGAATACAAGGTACCTGGACTATATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGG 222
Query 223 CATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTCCAGAATTT 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 CATCAGTTTGGTCAAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTTCAGAATTT 296
Query 297 ATATCGTTGCCCTGGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTATTTA 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 ATATCGTTGCCCTGGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTATTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTTTTTA 370
Query 371 AGAGTGAGATTATTCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACACCTGTTTTGGCC 444
|||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 AGAGTGAGATTATCCAGCCTCTTCTGGATATGGCGGCAGGGATTCCTCCCCCAGTTGTCACGCCTGTTTTGGCC 444
Query 445 AGCACTACCACTGCTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAATGTGGTCCAAGG 518
|||||.||..|.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCACCACTGCAGCTATGAGCAACACTCCAGGAACACCCGTGACACCTGTTACTCCAGCCAATGTGGTCCAAGG 518
Query 519 CTTACCTGATCCGTGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGATCTTGCAAAGTC 592
||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.|||||||
Sbjct 519 CTTACCTGATCCATGGGTATCTCAGATAGCAAACACAGACACACTGGCAGCTGTTGCTCAGATCCTACAAAGTC 592
Query 593 CTCAAGGCCAGCAGCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAGCCTTCCATTCTG 666
|||||||.||.||||||||.||..||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 593 CTCAAGGTCAACAGCTTCAGCAGCTAATACAAACCTTACAGATACAGCAGCAGAAGCCTCAGCCTTCTATCCTG 666
Query 667 CAGGCCCTAGATGCTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGCAGCTGCAGCTGC 740
||||||.|.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 667 CAGGCCTTGGATGCTGGTCTTGTGGTTCAGTTACAGGCACTCACTGCACAGCTCACAGCTGCAGCTGCTGCAGC 740
Query 741 CAACACTCTTACTCCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTGATTTTGGGGAAG 814
||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACACACTTACGCCCTTGGATCAGGGAGTCTCTTTCAACAAGAAGTTGATGGATAGATTTGATTTTGGGGAAG 814
Query 815 ACTCTGAGCATAGTGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCAGAATCTGTGAAC 888
|.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||..||.|.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 ATTCTGAGCATAGTGAAGAATCCAAAAAGGAAATGCCTACTCCTCAACTCTCTCACGTTTCAGAGTCTGTGAAC 888
Query 889 ATTTCCATTTTTCATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACAGCAGCTCTTGGA 962
|..|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||.|.||.||..|..|||||||||||.||||
Sbjct 889 AACTCCATCTTCCATCAGATAGCAGAACAGCTGCAGCAGCAGAACTTGGAGCAGTTGCGACAGCAGCTCCTGGA 962
Query 963 GCAGCAACAGCCTCAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGCATTCAGCGTCAC 1036
||||||.||||||||.||||..||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 963 GCAGCAGCAGCCTCAGAAGGTAACTCCTCAAGATAGCCAGGAGGGGACATTTGGGTCTGAGCACTCAGCTTCTC 1036
Query 1037 CATCACAAGGGAGTAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATAGATATTCAGCAA 1110
|.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 CCTCACAAGGGAGTAGCCAACAGCATTTTCTGGAACCTGAAGCAAATTTAGATGATTCCATAGACATTCAGCAA 1110
Query 1111 CAGGATATGGATATAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGCTAAGAAAGTGGC 1184
||||||||||||||.||||||||||||||||..||.|||||||||.|||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1111 CAGGATATGGATATTGATGAAGGGCAAGATGTTGTTGAAGAGGAGATCTTTGAACCAGAAGCTAAGAAAGTAGC 1184
Query 1185 GGTTCGCTCAAGATCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGTCTAGGTCACGGT 1258
.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1185 TGTTCGCTCAAGATCAAGAACTCATTCACGATCTCGATCAAGGTCACCAAGAAAACGAAGGTCCAGGTCACGCT 1258
Query 1259 CTGGCTCTAGAAAGCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGGAAATCATCACGG 1332
||||.||..|||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||.|||.|||||.|.||||||.|||.|.|||||.
Sbjct 1259 CTGGGTCCCGAAAGCGAAAGCACAGGAAGCGGTCTCGGTCCCACTCGAGAGAGAAAAAGAGAAAAGCCTCACGC 1332
Query 1333 TCGTATTCAAGTGAAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACCTCCAATTAGATC 1406
||.||.||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||..|.||.||
Sbjct 1333 TCCTACTCCAGTGAGCGCAGAGCCAGGGAAAGGGAGAAAGAGCGCCAGAAAAAGGGCTTGCCTCCTGTCAGGTC 1406
Query 1407 TAAAACACTAAGTGTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACACAGCAAGACTTAA 1480
.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1407 AAAAACACTAAGTGTATGCAGCACTACTCTCTGGGTTGGCCAAGTGGACAAGAAGGCTACACAGCAAGATTTAA 1480
Query 1481 CCAACCTGTTTGAAGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGTGCTTATGTCTGC 1554
|||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481 CCAACCTTTTTGAGGAATTTGGACAAATTGAATCCATTAATATGATTCCACCCAGGGGCTGTGCATATGTCTGC 1554
Query 1555 ATGGTTCATCGACAAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAATTGGGTCCAAGGT 1628
||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1555 ATGGTTCATCGACAAGATTCATTTCGGGCTCTTCAGAAACTGAGTTCAGGATCCTATAAAATTGGTTCCAAGGT 1628
Query 1629 CATTAAGATCGCTTGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATGTGGATCTTGGAG 1702
|||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629 CATTAAGATTGCCTGGGCTTTGAACAAAGGTGTAAAGACAGAATACAAACAGTTCTGGGATGTGGATCTTGGCG 1702
Query 1703 TTACATATATACCATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGCATGATTGATCAG 1776
|.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1703 TCACATATATACCCTGGGAAAAAGTGAAAGTAGATGACTTGGATGGCTTTGCAGAGGGCGGCATGATTGATCAG 1776
Query 1777 GAGACTGTAAATACTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCAGACAACTCAGAG 1850
||||||||||||.||||.|||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|.||.|||||..|.|||||
Sbjct 1777 GAGACTGTAAATGCTGAATGGGAAACTGTGAAAGCCTCAGAACCTGTTAAAGAGCCAGTGCAGACTGCACAGAG 1850
Query 1851 CCCAACTCCAGTTGAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTTGCTATGTTGC 1924
.|||.||||||||||.||||||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||
Sbjct 1851 TCCAGCTCCAGTTGAGAAGGAGTCAGTGGTCACCACACAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTCGCCATGCTGC 1924
Query 1925 AGATTCCAGTGGCGCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCGATGCCGGTTCCT 1998
|||||||.||.||.|||||.||.|||.|||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1925 AGATTCCTGTAGCACCAGCTGTTCCTGCAGTTAGCTTAGTTCCTCCAGCGTTTCCTGTGTCGATGCCTGTCCCC 1998
Query 1999 CCTCCTGGATTCAGTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCACCTGG 2072
|||||||||||||..||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1999 CCTCCTGGATTCAACCCGATCCCTCCACCTCCTTTTCTACGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCTCCTGG 2072
Query 2073 TTTCATGCCGCCTCCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTACCAACATCTTTAG 2146
|||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TTTTATGCCACCTCCAGTTCCCCCACCTGTGGTACCTCCCCCTGCAATCCCACCGGTAGTACCAACATCTTTAG 2146
Query 2147 TGCAGCCGTCATTATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTTATACCAGGCGGT 2220
||||.||..||||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||.|.|||
Sbjct 2147 TGCAACCACCATTGTCCATGACCCCTGAAGCTGTGAAAGATGTTGGATTTGGCAGCCTGGTTTTACCAAGTGGT 2220
Query 2221 TCTGTTGCCAGCAATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAACTAAACAGGCAGA 2294
||||||||..|||.|||||||.||||..||||.|||||||||||||||||||||.||||.|.|||| |||||
Sbjct 2221 TCTGTTGCTGGCAGTCTTGCTCCTTCAACTCTACCAGCTGGAAATGTTTTTAATCCTCCCAGTAAA---GCAGA 2291
Query 2295 GCCTGAAGAAAAAGTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGATCAGTGATTCCAA 2368
|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||.|||.||||||||||||
Sbjct 2292 GCCTGAAGAAAAAGTACCTCACCTTATAGAGCACCAGATTCCTTCTGGTGAGAACACAAGACCAGTGATTCCAA 2365
Query 2369 ATGATATTTCAAGTAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTG---ACAAGCAATTCTGGAATTCTG 2439
.|||||||.||||||.|||||||||.|| ||.||||||||| ||.| .||||||..|||||.||.|||
Sbjct 2366 GTGATATTCCAAGTAGTGCTGCAATGTT---AGCACAGCCGCC---TGGGGCCTCAAGCACCTCTGGGATCCTG 2433
Query 2440 GGAGTCCAAAGACCAAATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTCCAGTAGTTC 2513
.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||||||||||..|||.|
Sbjct 2434 TGCGTGCAGAGACCAAATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTGGGGGTTCGTCCAGCTAATGTTTCCAACAGTGC 2507
Query 2514 TGGGATTATTGCAGCCCAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCACCCAGTGTGT 2587
||..|||||.|.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||.|.|||||
Sbjct 2508 TGCAATTATGGGAGCCCAGCCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATTTTGGCCATACAGCCACCAAATGTGT 2581
Query 2588 CAAATAGTTCTGGACTT-TTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGAGTACAGCC 2660
|.|.|.|.||||||||| ||||| ||.||.||.|||||..|.||||||||.|||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2582 CCAGTGGCTCTGGACTTCTTGGG-GTACTGCCTCCAAACTTGCCTAACAACTCTGGACTTGTAGGACTACAGCC 2654
Query 2661 ACCAAATGTTCCAAATACTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACCCCCTTTAA 2734
||||||||||.|||.|.||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 2655 ACCAAATGTTACAAGTCCTGCTGGACTTTTGGGAACACAGCCACCAATTGGACCTCAAAACTTACCACCTTTAG 2728
Query 2735 GTATCCCTAATCAAAGGATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGGCACCTGGG 2808
..||||||..|||||||||||||.|..|||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||.||.|||
Sbjct 2729 CCATCCCTGCTCAAAGGATGCCCGCGTTGCCAATGTTAGACATTCGCCCAGGACTGATAGCACAGGCTCCCGGG 2802
Query 2809 CCAAGATTCCCTTTAATACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTTGATTCAGC 2882
|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2803 CCACGATTCCCTTTACTACAGCCTGGAATTCCACCACAACGCGGTATCCCTCCCCCATCGGTACTTGATGCAGC 2876
Query 2883 TCTTCATCCACCACCCCGTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTTTTTAGCTC 2956
|||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||.|.||.|
Sbjct 2877 TCTTCATCCTCCACCCCGCGGACCTTTTCCTCCAGGAGATCTTTTCAGTCAGCCAGAAAGACCTTTTCTGGCCC 2950
Query 2957 CTGGAAGACAAAGCGTAGACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACATTCAACAG 3030
|||||||||.|||..|||||||||||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2951 CTGGAAGACCAAGTATAGACAATGTTCCCAACCCAGATAAAAGAATACCACTTGGGAATGACAATATTCAGCAG 3024
Query 3031 GAAGGAGATAGAGATTATCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCTGTGGATGT 3104
|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..||||||..||||||||.|..||||||||
Sbjct 3025 GAAGGGGATAGAGATTACCGCTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAGGGCATTACCAGACCTCCTCAGGTGGATGT 3098
Query 3105 TAGAGATGTGGTTGGGCGGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAGGGATCATT 3178
|||.||||||||||||||.|.|.|||||||.||||||||.||||||.||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct 3099 TAGGGATGTGGTTGGGCGACGTCTAGATCCCAGAGAAGGCCCTGGAAGGCCTCCATTAGATGCTAGGGATCATT 3172
Query 3179 TTGGAAGACCTCCTGTAGATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAAGAGACCAC 3252
||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||.||.||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 3173 TTGGAAGACCTCCTGTGGACATGAGGGAGAATCTTGTGAGGCCAAGTCTAGACCACCTTGGTCGAAGAGACCAC 3246
Query 3253 TTTGGCTTTAATCCAGAGAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTTCTACCGGT 3326
|||||||||...|||||||||||.|||||||.|| |||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 3247 TTTGGCTTTCCCCCAGAGAAGCCTTGGGGGCCTA---GAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGAGTTCTGCCTGT 3317
Query 3327 CTATGGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGATCCTAGAA 3400
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 3318 CTTTGGTGGTCCAAAAGGCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGGCTGGAAATTACCGATTTGATCCTAGAA 3391
Query 3401 GTGGTCCTTGGAACCGAGGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGG 3474
||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3392 GTGGTCCTTGGAACAGAGGATTTGGTCAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGG 3465
Query 3475 CAAAGGGATAGGGATGACAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGAGACAGAAT 3548
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 3466 CAGAGGGATAGGGATGACAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATTAATGGAAATCGTCTTGGACGAGATAGAAT 3539
Query 3549 TCAAAACACTTGGGTTCCCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCAACGAAAAG 3622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 3540 TCAAAACACTTGGGTTCCCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTCGAAGGGGCCACTTCTCAACGGAAAG 3613
Query 3623 GTGATAATGTGCCTCAGGTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAGTACAGAAT 3696
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.
Sbjct 3614 GTGATAATGTGCCTCAAGTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCGCCTTTACCAGTACAGAAG 3687
Query 3697 GATCCTGAACTTTATGAAAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTTGCTGATAT 3770
||.||||||||.|||||.||||||.|.||||||..|||..||.||||||||.||||.|.|||||||||||.|.|
Sbjct 3688 GACCCTGAACTCTATGAGAAACTGGCGTCTTCAGGTGACGTAGACAAGGAGGAGAGCGGCACAGTTGCTGGTGT 3761
Query 3771 AGAAAGTGAACCAGTGGTAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA 3813
|||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 3762 AGAGAGTGAAGCGGTGGTAGAAAGCACAGAGACTGAGGGGACA 3804