Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470877
• Subject: NM_199078.3
• Aligned Length: 2121
• Identities: 1976
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGGCGGTAGCTGCGGCGGGTCGGTTAGGCTGGTTGTTCGCCGCGCTCTGCCTGGGCAACGCCGCGGG  74
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Sbjct    1  ATGGCGGCGGCGGTAGCTGCGGCGGGTCGGTTAGGCTGGTTGTTCGCCGCGCTCTGCCTGGGCAACGCCGCGGG  74

Query   75  GGAGGCCGCGCCGGGCCCGCGAGTGCTGGGCTTCTGCCTGGAGGAGGATGGAGCGGCGGGCGCGGGTTGGGTAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCCGCGCCGGGCCCGCGAGTGCTGGGCTTCTGCCTGGAGGAGGATGGAGCGGCGGGCGCGGGTTGGGTAC  148

Query  149  GCGGAGGGGCGGCGCGGGACACGCCGGACGCCACCTTCCTCCTGCGCCTCTTCGGCCCGGGCTTCGCCAACAGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGGAGGGGCGGCGCGGGACACGCCGGACGCCACCTTCCTCCTGCGCCTCTTCGGCCCGGGCTTCGCCAACAGC  222

Query  223  TCTTGGTCCTGGGTGGCCCCGGAGGGGGCGGGCTGCCGGGAGGAGGCGGCCTCCCCCGCGGGCGAGTGGCGCGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTTGGTCCTGGGTGGCCCCGGAGGGGGCGGGCTGCCGGGAGGAGGCGGCCTCCCCCGCGGGCGAGTGGCGCGC  296

Query  297  GCTGCTGCGCTTGCGCCTGCGGGCCGAGGCCGTGCGCCCGCACTCGGCGCTGCTGGCGGTGCGCGTGGAGCCGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGCTGCGCTTGCGCCTGCGGGCCGAGGCCGTGCGCCCGCACTCGGCGCTGCTGGCGGTGCGCGTGGAGCCGG  370

Query  371  GTGGCGGGGCGGCTGAGGAGGCGGCGCCGCCCTGGGCTCTGGGCCTGGGGGCGGCCGGGCTGCTGGCGCTGGCA  444
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Sbjct  371  GTGGCGGGGCGGCTGAGGAGGCGGCGCCGCCCTGGGCTCTGGGCCTGGGGGCGGCCGGGCTGCTGGCGCTGGCA  444

Query  445  GCGCTGGCGCGAGGCCTGCAGCTGAGCGCGCTGGCGCTGGCGCCTGCCGAGGTGCAGGTGCTGCGCGAGAGCGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCGCTGGCGCGAGGCCTGCAGCTGAGCGCGCTGGCGCTGGCGCCTGCCGAGGTGCAGGTGCTGCGCGAGAGCGG  518

Query  519  CTCGGAGGCGGAGCGTGCGGCGGCGCGGCGTTTGGAGCCCGCGCGGCGCTGGGCCGGCTGCGCCTTGGGCGCGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCGGAGGCGGAGCGTGCGGCGGCGCGGCGTTTGGAGCCCGCGCGGCGCTGGGCCGGCTGCGCCTTGGGCGCGC  592

Query  593  TGCTGCTGCTGGCCAGCCTGGCGCAGGCGGCGCTGGCGGTGCTGCTGTACCGCGCGGCCGGCCAGCGTGCGGTG  666
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Sbjct  593  TGCTGCTGCTGGCCAGCCTGGCGCAGGCGGCGCTGGCGGTGCTGCTGTACCGCGCGGCCGGCCAGCGTGCGGTG  666

Query  667  CCCGCCGTGTTGGGCAGCGCGGGGCTCGTGTTCCTGGTGGGAGAGGTGGTGCCGGCCGCCGTGAGCGGGCGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCGCCGTGTTGGGCAGCGCGGGGCTCGTGTTCCTGGTGGGAGAGGTGGTGCCGGCCGCCGTGAGCGGGCGCTG  740

Query  741  GACGCTGGCGCTGGCGCCGCGAGCGCTCGGCCTCAGCCGCCTGGCCGTCCTGCTCACTCTGCCCGTCGCGCTGC  814
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Sbjct  741  GACGCTGGCGCTGGCGCCGCGAGCGCTCGGCCTCAGCCGCCTGGCCGTCCTGCTCACTCTGCCCGTCGCGCTGC  814

Query  815  CCGTGGGGCAGCTGCTGGAGCTGGCGGCGCGGCCCGGGCGGCTGCGGGAGCGGGTGCTGGAGCTGGCGCGCGGC  888
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Sbjct  815  CCGTGGGGCAGCTGCTGGAGCTGGCGGCGCGGCCCGGGCGGCTGCGGGAGCGGGTGCTGGAGCTGGCGCGCGGC  888

Query  889  GGCGGTGACCCCTACAGCGATCTCAGCAAGGGCGTGCTGCGCTGCCGGACCGTGGAGGACGTGCTCACGCCCCT  962
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCGGCGACCCCTACAGCGATCTCAGCAAGGGCGTGCTGCGCTGCCGGACCGTGGAGGACGTGCTCACGCCCCT  962

Query  963  CGAAGACTGCTTCATGCTGGACGCCAGCACCGTGCTGGACTTCGGCGTCCTGGCCAGCATCATGCAGAGCGGCC  1036
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Sbjct  963  CGAAGACTGCTTCATGCTGGACGCCAGCACCGTGCTGGACTTCGGCGTCCTGGCCAGCATCATGCAGAGCGGCC  1036

Query 1037  ACACGCGCATCCCGGTGTACGAGGAGGAGCGCTCCAACATCGTGGACATGCTCTACCTCAAGGACTTGGCCTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACACGCGCATCCCGGTGTACGAGGAGGAGCGCTCCAACATCGTGGACATGCTCTACCTCAAGGACTTGGCCTTC  1110

Query 1111  GTGGATCCCGAAGACTGCACGCCGCTCAGCACCATCACTCGTTTCTACAACCATCCGCTCCACTTCGTCTTCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGGATCCCGAAGACTGCACGCCGCTCAGCACCATCACTCGTTTCTACAACCATCCGCTCCACTTCGTCTTCAA  1184

Query 1185  CGACACCAAGCTGGACGCTGTCCTGGAGGAATTCAAGCGAGGGAAGTCCCACCTGGCCATCGTGCAGAAGGTGA  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct 1185  CGACACCAAGCTGGACGCTGTCCTGGAGGAATTCAAGCGAG---------------------------------  1225

Query 1259  ACAACGAGGGTGAAGGCGACCCCTTCTACGAGGTCCTGGGCCTGGTCACCCTGGAGGACGTGATCGAGGAGATC  1332
                                                                                      
Sbjct 1226  --------------------------------------------------------------------------  1225

Query 1333  ATCAGGTCCGAGATCCTGGACGAGTCTGAAGACTACCGAGACACCGTGGTGAAGAGGAAGCCTGCTTCTCTGAT  1406
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  -------------------------------------GAGACACCGTGGTGAAGAGGAAGCCTGCTTCTCTGAT  1262

Query 1407  GGCCCCTCTGAAGCGGAAGGAGGAGTTCTCCTTGTTCAAGGTGTCTGATGATGAATATAAAGTAACAATCTCGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  GGCCCCTCTGAAGCGGAAGGAGGAGTTCTCCTTGTTCAAGGTGTCTGATGATGAATATAAAGTAACAATCTCGC  1336

Query 1481  CTCAGCTGCTCTTGGCCACCCAGCGCTTCCTGTCCCGAGAAGTGGATGTATTCAGCCCGCTGCGCATCTCTGAG  1554
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Sbjct 1337  CTCAGCTGCTCTTGGCCACCCAGCGCTTCCTGTCCCGAGAAGTGGATGTATTCAGCCCGCTGCGCATCTCTGAG  1410

Query 1555  AAGGTCCTGCTGCACCTGTTGAAGCATCCCAGTGTCAACCAGGAAGTGAGGTTTGACGAGAGCAACCGGCTGGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  AAGGTCCTGCTGCACCTGTTGAAGCATCCCAGTGTCAACCAGGAAGTGAGGTTTGACGAGAGCAACCGGCTGGC  1484

Query 1629  CACACACCACTACCTGTACCAGCGCAGCCAGCCGGTGGATTACTTCATTCTCATCCTGCAGGGCAGGGTTGAAG  1702
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Sbjct 1485  CACACACCACTACCTGTACCAGCGCAGCCAGCCGGTGGATTACTTCATTCTCATCCTGCAGGGCAGGGTTGAAG  1558

Query 1703  TGGAGATCGGGAAAGAGGGTCTGAAGTTTGAGAATGGGGCCTTCACGTACTATGGAGTGTCGGCCCTAACTGTG  1776
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Sbjct 1559  TGGAGATCGGGAAAGAGGGTCTGAAGTTTGAGAATGGGGCCTTCACGTACTATGGAGTGTCGGCCCTAACTGTG  1632

Query 1777  CCATCCTCGGTTCACCAGTCCCCGGTGTCCTCGCTCCAGCCCATCCGCCATGACCTGCAGCCCGACCCAGGTGA  1850
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Sbjct 1633  CCATCCTCGGTTCACCAGTCCCCGGTGTCCTCGCTCCAGCCCATCCGCCATGACCTGCAGCCCGACCCAGGTGA  1706

Query 1851  CGGCACGCATTCATCTGCGTATTGTCCCGACTACACCGTGAGGGCGCTCTCTGATCTGCAGCTCATCAAGGTTA  1924
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Sbjct 1707  CGGCACGCATTCATCTGCGTATTGTCCCGACTACACCGTGAGGGCGCTCTCTGATCTGCAGCTCATCAAGGTTA  1780

Query 1925  CGCGACTGCAGTACCTCAATGCACTCCTGGCTACCCGAGCCCAGAACCTGCCACAGTCCCCTGAGAACACCGAC  1998
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Sbjct 1781  CGCGACTGCAGTACCTCAATGCACTCCTGGCTACCCGAGCCCAGAACCTGCCACAGTCCCCTGAGAACACCGAC  1854

Query 1999  CTGCAGGTTATTCCAGGCAGCCAGACCAGGCTCCTTGGTGAGAAGACCACCACAGCGGCAGGGTCCAGCCACAG  2072
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Sbjct 1855  CTGCAGGTTATTCCAGGCAGCCAGACCAGGCTCCTTGGTGAGAAGACCACCACAGCGGCAGGGTCCAGCCACAG  1928

Query 2073  CAGGCCCGGCGTCCCGGTGGAAGGCAGCCCTGGGCGGAACCCAGGCGTT  2121
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Sbjct 1929  CAGGCCCGGCGTCCCGGTGGAAGGCAGCCCTGGGCGGAACCCAGGCGTT  1977