Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470980
- Subject:
- XM_011529474.2
- Aligned Length:
- 2349
- Identities:
- 2200
- Gaps:
- 147
Alignment
Query 1 ATGGTTATCATGTCGGAGTTCAGCGCGGACCCCGCGGGCCAGGGTCAGGGCCAGCAGAAGCCCCTCCGGGTGGG 74
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Sbjct 1 ATGGTTATCATGTCGGAGTTCAGCGCGGACCCCGCGGGCCAGGGTCAGGGCCAGCAGAAGCCCCTCCGGGTGGG 74
Query 75 TTTTTACGACATCGAGCGGACCCTGGGCAAAGGCAACTTCGCGGTGGTGAAGCTGGCGCGGCATCGAGTCACCA 148
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Sbjct 75 TTTTTACGACATCGAGCGGACCCTGGGCAAAGGCAACTTCGCGGTGGTGAAGCTGGCGCGGCATCGAGTCACCA 148
Query 149 AAACGCAGGTTGCAATAAAAATAATTGATAAAACACGATTAGATTCAAGCAATTTGGAGAAAATCTATCGTGAG 222
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Sbjct 149 AAACGCAGGTTGCAATAAAAATAATTGATAAAACACGATTAGATTCAAGCAATTTGGAGAAAATCTATCGTGAG 222
Query 223 GTTCAGCTGATGAAGCTTCTGAACCATCCACACATCATAAAGCTTTACCAGGTTATGGAAACAAAGGACATGCT 296
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Sbjct 223 GTTCAGCTGATGAAGCTTCTGAACCATCCACACATCATAAAGCTTTACCAGGTTATGGAAACAAAGGACATGCT 296
Query 297 TTACATCGTCACTGAATTTGCTAAAAATGGAGAAATGTTTGATTATTTGACTTCCAACGGGCACCTGAGTGAGA 370
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Sbjct 297 TTACATCGTCACTGAATTTGCTAAAAATGGAGAAATGTTTGATTATTTGACTTCCAACGGGCACCTGAGTGAGA 370
Query 371 ACGAGGCGCGGAAGAAGTTCTGGCAAATCCTGTCGGCCGTGGAGTACTGTCACGACCATCACATCGTCCACCGG 444
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Sbjct 371 ACGAGGCGCGGAAGAAGTTCTGGCAAATCCTGTCGGCCGTGGAGTACTGTCACGACCATCACATCGTCCACCGG 444
Query 445 GACCTCAAGACCGAGAACCTCCTGCTGGATGGCAACATGGACATCAAGCTGGCAGATTTTGGATTTGGGAATTT 518
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Sbjct 445 GACCTCAAGACCGAGAACCTCCTGCTGGATGGCAACATGGACATCAAGCTGGCAGATTTTGGATTTGGGAATTT 518
Query 519 CTACAAGTCAGGAGAGCCTCTGTCCACGTGGTGTGGGAGCCCCCCGTATGCCGCCCCGGAAGTCTTTGAGGGGA 592
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Sbjct 519 CTACAAGTCAGGAGAGCCTCTGTCCACGTGGTGTGGGAGCCCCCCGTATGCCGCCCCGGAAGTCTTTGAGGGGA 592
Query 593 AGGAGTATGAAGGCCCCCAGCTGGACATCTGGAGCCTGGGCGTGGTGCTGTACGTCCTGGTCTGCGGTTCTCTC 666
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Sbjct 593 AGGAGTATGAAGGCCCCCAGCTGGACATCTGGAGCCTGGGCGTGGTGCTGTACGTCCTGGTCTGCGGTTCTCTC 666
Query 667 CCCTTCGATGGGCCTAACCTGCCGACGCTGAGACAGCGGGTGCTGGAGGGCCGCTTCCGCATCCCCTTCTTCAT 740
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Sbjct 667 CCCTTCGATGGGCCTAACCTGCCGACGCTGAGACAGCGGGTGCTGGAGGGCCGCTTCCGCATCCCCTTCTTCAT 740
Query 741 GTCTCAAGACTGTGAGAGCCTGATCCGCCGCATGCTGGTGGTGGACCCCGCCAGGCGCATCACCATCGCCCAGA 814
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Sbjct 741 GTCTCAAGACTGTGAGAGCCTGATCCGCCGCATGCTGGTGGTGGACCCCGCCAGGCGCATCACCATCGCCCAGA 814
Query 815 TCCGGCAGCACCGGTGGATGCGGGCTGAGCCCTGCTTGCCGGGACCCGCCTGCCCCGCCTTCTCCGCACACAGC 888
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Sbjct 815 TCCGGCAGCACCGGTGGATGCGGGCTGAGCCCTGCTTGCCGGGACCCGCCTGCCCCGCCTTCTCCGCACACAGC 888
Query 889 TACACCTCCAACCTGGGCGACTACGATGAGCAGGCGCTGGGTATCATGCAGACCCTGGGCGTGGACCGGCAGAG 962
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Sbjct 889 TACACCTCCAACCTGGGCGACTACGATGAGCAGGCGCTGGGTATCATGCAGACCCTGGGCGTGGACCGGCAGAG 962
Query 963 GACGGTGGAGTCACTGCAAAACAGCAGCTATAACCACTTTGCTGCCATTTATTACCTCCTCCTTGAGCGGCTCA 1036
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Sbjct 963 GACGG--------------------------------------------------------------------- 967
Query 1037 AGGAGTATCGGAATGCCCAGTGCGCCCGCCCCGGGCCTGCCAGGCAGCCGCGGCCTCGGAGCTCGGACCTCAGT 1110
Sbjct 968 -------------------------------------------------------------------------- 967
Query 1111 GGTTTGGAGGTGCCTCAGGAAGGTCTTTCCACCGACCCTTTCCGACCTGCCTTGCTGTGCCCGCAGCCGCAGAC 1184
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Sbjct 968 ----TGGAGGTGCCTCAGGAAGGTCTTTCCACCGACCCTTTCCGACCTGCCTTGCTGTGCCCGCAGCCGCAGAC 1037
Query 1185 CTTGGTGCAGTCCGTCCTCCAGGCCGAGATGGACTGTGAGCTCCAGAGCTCGCTGCAGTGGCCCTTGTTCTTCC 1258
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Sbjct 1038 CTTGGTGCAGTCCGTCCTCCAGGCCGAGATGGACTGTGAGCTCCAGAGCTCGCTGCAGTGGCCCTTGTTCTTCC 1111
Query 1259 CGGTGGATGCCAGCTGCAGCGGAGTGTTCCGGCCCCGGCCCGTGTCCCCAAGCAGCCTGCTGGACACAGCCATC 1332
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Sbjct 1112 CGGTGGATGCCAGCTGCAGCGGAGTGTTCCGGCCCCGGCCCGTGTCCCCAAGCAGCCTGCTGGACACAGCCATC 1185
Query 1333 AGTGAGGAGGCCAGGCAGGGGCCGGGCCTAGAGGAGGAGCAGGACACGCAGGAGTCCCTGCCCAGCAGCACGGG 1406
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Sbjct 1186 AGTGAGGAGGCCAGGCAGGGGCCGGGCCTAGAGGAGGAGCAGGACACGCAGGAGTCCCTGCCCAGCAGCACGGG 1259
Query 1407 CCGGAGGCACACCCTGGCCGAGGTCTCCACCCGCCTCTCCCCACTCACCGCGCCATGTATAGTCGTCTCCCCCT 1480
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Sbjct 1260 CCGGAGGCACACCCTGGCCGAGGTCTCCACCCGCCTCTCCCCACTCACCGCGCCATGTATAGTCGTCTCCCCCT 1333
Query 1481 CCACCACGGCAAGTCCTGCAGAGGGAACCAGCTCTGACAGTTGTCTGACCTTCTCTGCGAGCAAAAGCCCCGCG 1554
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Sbjct 1334 CCACCACGGCAAGTCCTGCAGAGGGAACCAGCTCTGACAGTTGTCTGACCTTCTCTGCGAGCAAAAGCCCCGCG 1407
Query 1555 GGGCTCAGTGGCACCCCGGCCACTCAGGGGCTGCTGGGCGCCTGCTCCCCGGTCAGGCTGGCCTCGCCCTTCCT 1628
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Sbjct 1408 GGGCTCAGTGGCACCCCGGCCACTCAGGGGCTGCTGGGCGCCTGCTCCCCGGTCAGGCTGGCCTCGCCCTTCCT 1481
Query 1629 GGGGTCGCAGTCCGCCACCCCAGTGCTGCAGGCTCAGGGGGGCTTGGGAGGAGCTGTTCTGCTCCCTGTCAGCT 1702
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Sbjct 1482 GGGGTCGCAGTCCGCCACCCCAGTGCTGCAGGCTCAGGGGGGCTTGGGAGGAGCTGTTCTGCTCCCTGTCAGCT 1555
Query 1703 TCCAGGAGGGACGGCGGGCGTCGGACACCTCACTGACTCAAGGGCTGAAGGCCTTTCGGCAGCAGCTGAGGAAG 1776
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Sbjct 1556 TCCAGGAGGGACGGCGGGCGTCGGACACCTCACTGACTCAAGGGCTGAAGGCCTTTCGGCAGCAGCTGAGGAAG 1629
Query 1777 ACCACGCGGACCAAAGGGTTTCTGGGACTGAACAAAATCAAGGGGCTGGCTCGCCAGGTGTGCCAGGTCCCTGC 1850
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Sbjct 1630 ACCACGCGGACCAAAGGGTTTCTGGGACTGAACAAAATCAAGGGGCTGGCTCGCCAGGTGTGCCAGGCCCCCGC 1703
Query 1851 CAGCCGGGCCAGCAGGGGCGGCCTGAGCCCCTTCCACGCCCCTGCACAGAGCCCAGGCCTGCACGGCGGCGCAG 1924
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Sbjct 1704 CAGCCGGGCCAGCAGGGGCGGCCTGAGCCCCTTCCACGCCCCTGCACAGAGCCCAGGCCTGCACGGCGGCGCAG 1777
Query 1925 CCGGCAGCCGGGAGGGCTGGAGCCTGCTGGAGGAGGTGCTAGAGCAGCAGAGGCTGCTCCAGTTACAGCACCAC 1998
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Sbjct 1778 CCGGCAGCCGGGAGGGCTGGAGCCTGCTGGAGGAGGTGCTAGAGCAGCAGAGGCTGCTCCAGTTACAGCACCAC 1851
Query 1999 CCGGCCGCTGCACCCGGCTGCTCCCAGGCCCCCCAGCCGGCCCCTGCCCCGTTTGTGATCGCCCCCTGTGATGG 2072
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Sbjct 1852 CCGGCCGCTGCACCCGGCTGCTCCCAGGCCCCCCAGCCGGCCCCTGCCCCGTTTGTGATCGCCCCCTGTGATGG 1925
Query 2073 CCCTGGGGCTGCCCCGCTCCCCAGCACCCTCCTCACGTCGGGGCTCCCGCTGCTGCCGCCCCCACTCCTGCAGA 2146
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Sbjct 1926 CCCTGGGGCTGCCCCGCTCCCCAGCACCCTCCTCACGTCGGGGCTCCCGCTGCTGCCGCCCCCACTCCTGCAGA 1999
Query 2147 CCGGCGCGTCCCCGGTGGCCTCAGCGGCGCAGCTCCTGGACACACACCTGCACATTGGCACCGGCCCCACCGCC 2220
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Sbjct 2000 CCGGCGCGTCCCCGGTGGCCTCAGCGGCGCAGCTCCTGGACACACACCTGCACATTGGCACCGGCCCCACCGCC 2073
Query 2221 CTCCCCGCTGTGCCCCCACCACGCCTGGCCAGGCTGGCCCCAGGTTGTGAGCCCCTGGGGCTGCTGCAGGGGGA 2294
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Sbjct 2074 CTCCCCGCTGTGCCCCCACCACGCCTGGCCAGGCTGGCCCCAGGTTGTGAGCCCCTGGGGCTGCTGCAGGGGGA 2147
Query 2295 CTGTGAGATGGAGGACCTGATGCCCTGCTCCCTAGGCACGTTTGTCCTGGTGCAG 2349
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Sbjct 2148 CTGTGAGATGGAGGACCTGATGCCCTGCTCCCTAGGCACGTTTGTCCTGGTGCAG 2202
