Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471005
• Subject: NM_001348718.1
• Aligned Length: 1524
• Identities: 1258
• Gaps: 182

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------AT------GGA  5
                                                                           ||      |||
Sbjct    1  ATGCCCTGCTTTACTCACAGGAGCTGTAGAGAGGACCCCGGTACATCTGAAAGCCGGGAAATGATGTTTCAGGA  74

Query    6  CCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGA  79
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct   75  CCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAAGA  148

Query   80  AACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACCAGAAC  153
            |.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCTGGAACCTGACCTCTATAGGAAAAAAGTGGAAAGACCAGAAC  222

Query  154  ATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGA  227
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTGTCACAGAAGAGAAAGTCAATGAAATTAAAGA  296

Query  228  TGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTC  301
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  AGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGAAGAAGAAAGCTTCTC  370

Query  302  CTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATC  375
            |||||||||||||||||||.||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  371  CTGAAGTAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGT---GAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTCTAATATGAACATC  441

Query  376  AGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAA  449
            ||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  442  AGAGGTGACACTGGACACAAGGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAA  515

Query  450  AAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTA  523
            |||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  516  AAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTA  589

Query  524  AAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCT  597
            |||.|||||||||||.|.||||||.|||||||||..|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  590  AAGAATGTGGAAAAAACATTATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCT  663

Query  598  TATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGG  671
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  664  TATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGG  737

Query  672  AGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATAAAAGAA  745
            |||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  738  AGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAA  811

Query  746  CTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGA  819
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||..|||
Sbjct  812  CTCACATTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGA  885

Query  820  CATGAAAGGATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCGTTA  893
            ||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  886  CATGAAAGGAGTCACATGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTA  959

Query  894  TGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCT  967
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  TGTTCGTAGACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCT  1033

Query  968  CTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGAAAA  1041
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 1034  CTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAA  1107

Query 1042  GACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCA  1115
            |.|||||.|||||..||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1108  GGCTTTTATTCTGCCAAGTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCA  1181

Query 1116  GTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATG  1189
            .|||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  ATGTGGTAAAGCCTTCACTCGTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATG  1255

Query 1190  AGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAG  1263
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  AGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAG  1329

Query 1264  AAACCG--------------------------------------------------------------------  1269
            ||||||                                                                    
Sbjct 1330  AAACCGTATCAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCA  1403

Query 1270  ----------------TATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATG  1327
                            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|||.|..|||||
Sbjct 1404  CACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATG  1477

Query 1328  AAAGGACACAAACACACA--------------------------  1345
            ||||||||||||||||.|                          
Sbjct 1478  AAAGGACACAAACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA  1521