Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471005
• Subject: NM_001348719.1
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1258
• Gaps: 173

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGACCCAGTGGC  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCTGCTTTACTCACAGGAGCTGTAGAGAGGACCCCGGTACATCTGAAAGCCGGGAAATGGACCCAGTGGC  74

Query   15  TTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACA  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct   75  TTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAAGAATCTCTACA  148

Query   89  GGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACCAGAACATTGAATAT  162
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCTGGAACCTGACCTCTATAGGAAAAAAGTGGAAAGACCAGAACATTGAATAT  222

Query  163  GAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCA  236
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  GAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTGTCACAGAAGAGAAAGTCAATGAAATTAAAGAAGACAGTCA  296

Query  237  TTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAA  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGAAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAA  370

Query  311  AATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGAC  384
            ||||||||||.||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCATGTGACAGCTTTGTGTGT---GAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTCTAATATGAACATCAGAGGTGAC  441

Query  385  ATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTT  458
            |.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  ACTGGACACAAGGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAAAGCCTT  515

Query  459  CAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTAAAGTATGTG  532
            ||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct  516  CAGATATCACCCCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTG  589

Query  533  GAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGT  606
            ||||||.|.||||||.|||||||||..|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  GAAAAAACATTATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGT  663

Query  607  AAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACC  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  664  AAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACC  737

Query  681  ATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATAAAAGAACTCACACTG  754
            .|.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  738  GTATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTCACATTG  811

Query  755  GAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGACATGAAAGG  828
            ||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||..||||||||||||
Sbjct  812  GAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACATGAAAGG  885

Query  829  ATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCGTTATGTTCGTAT  902
            |.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  886  AGTCACATGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGTTCGTAG  959

Query  903  ACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAA  976
            |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  ACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAA  1033

Query  977  GTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGAAAAGACTTTTGT  1050
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||.|
Sbjct 1034  GTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGCTTTTAT  1107

Query 1051  TCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCAGTGTGGTAA  1124
            ||||..||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1108  TCTGCCAAGTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATGTGGTAA  1181

Query 1125  AGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGC  1198
            |||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  AGCCTTCACTCGTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGC  1255

Query 1199  AATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCG---  1269
            ||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1256  AATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTAT  1329

Query 1270  --------------------------------------------------------------------------  1269
                                                                                      
Sbjct 1330  CAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACACTGGAGA  1403

Query 1270  -------TATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACAC  1336
                   ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|||.|..||||||||||||||
Sbjct 1404  GAAACCCTATGAATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAAGGACAC  1477

Query 1337  AAACACACA--------------------------  1345
            |||||||.|                          
Sbjct 1478  AAACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA  1512