Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471005
- Subject:
- NM_001348721.1
- Aligned Length:
- 1461
- Identities:
- 1258
- Gaps:
- 119
Alignment
Query 1 AT------GGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATAT 68
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTTCAGGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATAT 74
Query 69 TTCCCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGA 142
||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 75 TTCCCAGAAGAATCTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCTGGAACCTGACCTCTATAGGAAAAAAGTGGA 148
Query 143 AAGACCAGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAAT 216
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||
Sbjct 149 AAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTGTCACAGAAGAGAAAGTCAAT 222
Query 217 GAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAA 290
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 223 GAAATTAAAGAAGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGAAGAA 296
Query 291 GAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTA 364
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 297 GAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGT---GAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTCTA 367
Query 365 ATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGT 438
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 368 ATATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAAGGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGT 441
Query 439 CAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACC 512
||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 442 CAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACC 515
Query 513 CAATGCTTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTG 586
|.||||||||||||.|||||||||||.|.||||||.|||||||||..|||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct 516 CTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATTATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTG 589
Query 587 GGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGA 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 590 GGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGA 663
Query 661 ATTCACACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAAT 734
|.||||||||||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 ACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAAT 737
Query 735 ACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGAT 808
||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 738 ACATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGAT 811
Query 809 CCTATCGTAGACATGAAAGGATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACG 882
|||.||..|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 812 CCTGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATG 885
Query 883 TGTCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAA 956
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 TGTCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAA 959
Query 957 AGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGA 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 AGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGA 1033
Query 1031 TATGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTAT 1104
.||||||.||||.|||||.|||||..||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1034 CATGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTAT 1107
Query 1105 AAATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGA 1178
|||||.|||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 AAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTCGTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGA 1181
Query 1179 GAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTC 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1182 GAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATTGCATGGTAGGACTC 1255
Query 1253 ACACTGGAGAGAAACCG--------------------------------------------------------- 1269
|||||||||||||||||
Sbjct 1256 ACACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCAT 1329
Query 1270 ---------------------------TATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCT 1316
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|
Sbjct 1330 CGTAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTT 1403
Query 1317 TCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACA-------------------------- 1345
||.|..|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1404 TCGATTTCATGAAAGGACACAAACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA 1458