Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471005
- Subject:
- NM_001348723.1
- Aligned Length:
- 1455
- Identities:
- 1164
- Gaps:
- 209
Alignment
Query 1 ATGGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACC 148
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ----------------------ATGCTGGAAACTTTCTGGAACCTGACCTCTATAGGAAAAAAGTGGAAAGACC 52
Query 149 AGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATT 222
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 53 AGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTGTCACAGAAGAGAAAGTCAATGAAATT 126
Query 223 AAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGC 296
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||
Sbjct 127 AAAGAAGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGAAGAAGAAAGC 200
Query 297 TTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGA 370
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 201 TTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGT---GAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTCTAATATGA 271
Query 371 ACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAA 444
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 272 ACATCAGAGGTGACACTGGACACAAGGCATGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAA 345
Query 445 CCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGC 518
||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 346 CCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGC 419
Query 519 TTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGGGATG 592
||||||||.|||||||||||.|.||||||.|||||||||..|||.|||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 420 TTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATTATTTACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATG 493
Query 593 GACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 494 GACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCAC 567
Query 667 ACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATAA 740
||||||||||||||.|.||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 568 ACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGA 641
Query 741 AAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATC 814
|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||
Sbjct 642 AAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTC 715
Query 815 GTAGACATGAAAGGATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCC 888
..|||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 716 ACAGACATGAAAGGAGTCACATGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCC 789
Query 889 CGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATT 962
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 CGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATT 863
Query 963 ATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 864 ATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTG 937
Query 1037 GAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGT 1110
|.||||.|||||.|||||..||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 938 GGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGC 1011
Query 1111 AAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACC 1184
|||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 AAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTCGTTCCGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACC 1085
Query 1185 CTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||.|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1086 CTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTG 1159
Query 1259 GAGAGAAACCG--------------------------------------------------------------- 1269
|||||||||||
Sbjct 1160 GAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGG 1233
Query 1270 ---------------------TATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAG 1322
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|||.|..
Sbjct 1234 ATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATGTAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATT 1307
Query 1323 TCATGAAAGGACACAAACACACA-------------------------- 1345
|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1308 TCATGAAAGGACACAAACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTA 1356