Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471005
• Subject: NM_001364730.1
• Aligned Length: 1698
• Identities: 1274
• Gaps: 353

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGACCCAGTGGC  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCTGCTGTAGTCACAGGAGGTGTAGAGAGGACCCCGGGACATCTGAAAGCCAGGAAATGGACCCAGTGGC  74

Query   15  TTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACA  88
            .|||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTTGATGATGTTGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACA  148

Query   89  GGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACCAGAACATTGAATAT  162
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTGTAGGAAAAAGTTGGAAAGACCAGAACATTGAATAT  222

Query  163  GAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCA  236
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAAAGAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCA  296

Query  237  TTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAA  310
            ||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  297  TTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAATAA  370

Query  311  AATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGAC  384
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCATGTGACAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGAC  444

Query  385  ATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTT  458
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGGACACAAGGCCTATGAGTATCAGGAATATGGACCGAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTT  518

Query  459  CAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTAAAGTATGTG  532
            ||||||.|.|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct  519  CAGATATCACCCCTCCTTTAGAACACCACAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTG  592

Query  533  GAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGT  606
            |||||||.|||||||||||||||||..|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAAAACTTTTATTTCCCATTCAAGCATTCAAAGACACGTGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGT  666

Query  607  AAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACC  680
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAATTTTGTGGGAAAGCCTTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACC  740

Query  681  ATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATAAAAGAACTCACACTG  754
            ||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||||
Sbjct  741  ATATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCTTCGAATACACGAAAGAACTCACACTG  814

Query  755  GAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGACATGAAAGG  828
            ||||||||||||||||||.||||.|.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGCAATGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATGCTATCGTAGACATGAAAGG  888

Query  829  ATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCGTTATGTTCGTAT  902
            |||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct  889  ATTCACACGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCAGTATGTTCGTAT  962

Query  903  ACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAA  976
            |||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACCCTATGAATGTACGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAA  1036

Query  977  GTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGAAAAGACTTTTGT  1050
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||
Sbjct 1037  GTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGGAAAGGCTTTTGT  1110

Query 1051  TCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCAGTGTGGTAA  1124
            ||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  TCTGCCAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCAATGTGGTAA  1184

Query 1125  AGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGC  1198
            |||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCCTTCATTCATTCCAGTTCCCTTCGTTATCATGAAAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGC  1258

Query 1199  AATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTAT  1272
            ||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1259  AATGTGGGAAGGCCTTCAGATCTTCCTCACACCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAGCCCTAT  1332

Query 1273  GAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACA-  1345
            ||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||. 
Sbjct 1333  GAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTATGAAGAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACGT  1406

Query 1346  --------------------------------------------------------------------------  1345
                                                                                      
Sbjct 1407  AAGAATACACTCTGGAGAAAGACCTTATAAATGTAAGCTATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCAAATCATTGC  1480

Query 1346  --------------------------------------------------------------------------  1345
                                                                                      
Sbjct 1481  AAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGCAAGCAATGTGGTGAAGCCTTCAGTAGTTCC  1554

Query 1346  --------------------------------------------------------------------------  1345
                                                                                      
Sbjct 1555  AGTTCCTTTCGATACCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCAATGTGGGAAAGCCTT  1628

Query 1346  ----------------------------------------------------------------------  1345
                                                                                  
Sbjct 1629  CAGAGCTGCCTCAGTCCTTCGAATGCATGGTAGGACTCACCCTGAAGATAAACCCTATGAGTGTAAGCAA  1698