Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471005
- Subject:
- NM_001364731.1
- Aligned Length:
- 1665
- Identities:
- 1263
- Gaps:
- 329
Alignment
Query 1 ATGGACCC------AGTGGCTTTTAAGGATGTGGCT-GTGA----------ACTTC----ACCCA------GGA 47
||| ||| |||..| ||||.||| | |.|| ||.|| |.||| |||
Sbjct 1 ATG--CCCTGCTGTAGTCAC-----AGGAGGTG--TAGAGAGGACCCCGGGACATCTGAAAGCCAGGAAATGGA 65
Query 48 GGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGA 121
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 66 GGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACAAGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGA 139
Query 122 CCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGT 195
|||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 140 CCTCTGTAGGAAAAAGTTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGT 213
Query 196 CTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGA 269
|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||
Sbjct 214 CTCATAGAAAAGAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGA 287
Query 270 CAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTG 343
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 288 CAGGCTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAATAAAATCATGTGACAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTG 361
Query 344 GCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATAT 417
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 362 GCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCCTATGAGTATCAGGAATAT 435
Query 418 GGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAG 491
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 436 GGACCGAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTTAGAACACCACAAAG 509
Query 492 GGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAA 565
||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||..|||.||
Sbjct 510 GGATCACACTGGAGAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAACTTTTATTTCCCATTCAAGCATTCAAA 583
Query 566 GACACATGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGA 639
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 584 GACACGTGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAATTTTGTGGGAAAGCCTTCCATTGTCTCAGT 657
Query 640 TTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAG 713
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 658 TTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCATATGAATGTAAACAATGTGGTAAATCCTTTAG 731
Query 714 TTATTCTGCTACCCATCGAATACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGA 787
||||||||||||||.|||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.|||||||
Sbjct 732 TTATTCTGCTACCCTTCGAATACACGAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGCAATGTGGGA 805
Query 788 AAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGACATGAAAGGATTCACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAG 861
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 806 AAGCATTTCATAGTCCCAGATGCTATCGTAGACATGAAAGGATTCACACGGGAGAGAAGGCTTATCAATGTAAG 879
Query 862 GAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTA 935
||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||
Sbjct 880 GAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCAGTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAAACCCTA 953
Query 936 TGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAG 1009
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 954 TGAATGTACGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACATAAGAATGCACTCTGGAG 1027
Query 1010 AAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATT 1083
||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1028 AAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGGAAAGGCTTTTGTTCTGCCAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAACT 1101
Query 1084 CACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCA 1157
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||..||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1102 CACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCATTCATTCCAGTTCCCTTCGTTATCA 1175
Query 1158 TGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACC 1231
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1176 TGAAAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAGGCCTTCAGATCTTCCTCACACC 1249
Query 1232 TTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATAT 1305
|||.|.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1250 TTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAGCCCTATGAATGTCAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCT 1323
Query 1306 GTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACA---------------------------------- 1345
.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1324 ATGAAGAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACGTAAGAATACACTCTGGAGAAAGACCTTATAAATG 1397
Query 1346 -------------------------------------------------------------------------- 1345
Sbjct 1398 TAAGCTATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCAAATCATTGCAAAGACATGAAAAAACTCACACTGGAGAGAAAC 1471
Query 1346 -------------------------------------------------------------------------- 1345
Sbjct 1472 TCTATGAATGCAAGCAATGTGGTGAAGCCTTCAGTAGTTCCAGTTCCTTTCGATACCATGAAAGGACTCACACT 1545
Query 1346 -------------------------------------------------------------------------- 1345
Sbjct 1546 GGAGAGAAACCCTATAAATGCAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGAGCTGCCTCAGTCCTTCGAATGCATGGTAG 1619
Query 1346 ------------------------------------- 1345
Sbjct 1620 GACTCACCCTGAAGATAAACCCTATGAGTGTAAGCAA 1656
