Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471005
• Subject: NM_001367172.2
• Aligned Length: 1367
• Identities: 1035
• Gaps: 207

Alignment

Query    1  ATGGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCA  74
            ||||||||.|||||.|.|.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGACCCTGTGGCCTGTGAGGATGTTGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCGCA  74

Query   75  GAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||
Sbjct   75  GAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTATAGGGAAAAAGTGGAAAGACC  148

Query  149  AGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATT  222
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||||||
Sbjct  149  AGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGGGAATGTCAATGAAATT  222

Query  223  AAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGC  296
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGAAGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGC  296

Query  297  TTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGA  370
            |||||||||||.||||||||||||.|.||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCTCCTGAAGCAAAATCATGTGATAACTTTGTATGTGGAGAAGTTGGCATAGGTAACTCATCTTTTAATATGA  370

Query  371  ACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAA  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  371  ACATCAGAGGTGACATTGGGCACAAGGCATACGAGTATCAGGACTATGCACCAAAGCCATATAAGTGTCAACAA  444

Query  445  CCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGC  518
            |||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.||||
Sbjct  445  CCTAAGAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGAATCACACCGGAGAGAAACCCTATGC  518

Query  519  TTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGGGATG  592
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTGTAAAGAATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAGGCATTCGAAGACGCATGGTAATGCACAGTGGGGATG  592

Query  593  GACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  593  GACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCTGTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAACTCAC  666

Query  667  ACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATAA  740
            ||||||||||||||.|.||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  667  ACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGTTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGA  740

Query  741  AAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||||||||||.||||||.||||.||.|.||
Sbjct  741  AAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGCAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTTCCAGTTCTTTTC  814

Query  815  GTAG-ACATGAAAGGATTCACA-TGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCA---CGT  883
             .|| ||||.||||.|..|||| |||| |.||||.|.|||.|||||||..|||||||.|||.|.||||   .||
Sbjct  815  -AAGCACATAAAAGAACCCACACTGGG-GGAAAGCCATATGAATGTAAACAATGTGGCAAATCCTTCAGTTGGT  886

Query  884  GTCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGC-AGTGTGGGAA  956
            ||   |.||...|||..|||||||||||.||.|||.||.||.|.||.|.||.||||||| ||| |.|||...||
Sbjct  887  GT---CATTCCTTTCAAATACATGAAAGAACTCACACTGGGGAGAAGCCCTGTGAATGT-AGCAAATGTAATAA  956

Query  957  AGCATTATCC-TCTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAG  1029
            |||||  ||| |        ||||                              |.|||.|.|||         
Sbjct  957  AGCAT--TCCGT--------AGTT------------------------------ACAGATCCTAT---------  981

Query 1030  ATATGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTA  1103
                          |||                      ||||||.|||..|.|||||..||||||||.||.||
Sbjct  982  --------------CTT----------------------AGACATAAAAGGAGTCACACGGGAGAGAAGCCTTA  1019

Query 1104  TAAATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATA-TCATGAAAGGACTCACACTG-G  1175
            |.||||||||.|.|||.|.|||||.|||.|..||.||||||||||||| || .|||||||||||.|||.||| |
Sbjct 1020  TCAATGTAAGGAATGTAGAAAAGCATTCACGTATCCCAGTTCCCTTCG-TAGACATGAAAGGACCCACTCTGCG  1092

Query 1176  AGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCT-------------CACACCTTCGA  1236
            | |.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||   ||||   |             |||||||..||
Sbjct 1093  A-AAAAACCTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATT---ATCT---TATAAGTTTTCAAACACACCTAAGA  1159

Query 1237  GTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAA  1310
            .||            |.|.|||||||.|.|||.||                                       
Sbjct 1160  ATG------------CGCTCTGGAGAAAGACCTTA---------------------------------------  1182

Query 1311  TAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACA  1345
                                               
Sbjct 1183  -----------------------------------  1182