Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471005
• Subject: NM_001367173.2
• Aligned Length: 1373
• Identities: 1035
• Gaps: 213

Alignment

Query    1  AT------GGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATAT  68
            ||      ||||||.|||||.|.|.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTCAGGACCCTGTGGCCTGTGAGGATGTTGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATAT  74

Query   69  TTCCCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGA  142
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||.|||||
Sbjct   75  TTCGCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTATAGGGAAAAAGTGGA  148

Query  143  AAGACCAGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAAT  216
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||
Sbjct  149  AAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGGGAATGTCAAT  222

Query  217  GAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAA  290
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAATTAAAGAAGACAGTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCAGGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGGAGAA  296

Query  291  GAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTA  364
            |||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAAGCTTCTCCTGAAGCAAAATCATGTGATAACTTTGTATGTGGAGAAGTTGGCATAGGTAACTCATCTTTTA  370

Query  365  ATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGT  438
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  371  ATATGAACATCAGAGGTGACATTGGGCACAAGGCATACGAGTATCAGGACTATGCACCAAAGCCATATAAGTGT  444

Query  439  CAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACC  512
            |||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  445  CAACAACCTAAGAAAGCCTTCAGATATCACCCCTCCTTTAGAACACAAGAAAGGAATCACACCGGAGAGAAACC  518

Query  513  CAATGCTTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTG  586
            |.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|..|||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  519  CTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAACCTTTATTTCCCATTCAGGCATTCGAAGACGCATGGTAATGCACAGTG  592

Query  587  GGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGA  660
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCTGTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGA  666

Query  661  ATTCACACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAAT  734
            |.||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACAATGTGTTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAAT  740

Query  735  ACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGAT  808
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||||||||||.||||||.||||.|
Sbjct  741  ACATGAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATGTCAGCAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTTCCAGTT  814

Query  809  CCTATCGTAG-ACATGAAAGGATTCACA-TGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCA  880
            |.|.|| .|| ||||.||||.|..|||| |||| |.||||.|.|||.|||||||..|||||||.|||.|.||||
Sbjct  815  CTTTTC-AAGCACATAAAAGAACCCACACTGGG-GGAAAGCCATATGAATGTAAACAATGTGGCAAATCCTTCA  886

Query  881  ---CGTGTCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGC-AGTG  950
               .||||   |.||...|||..|||||||||||.||.|||.||.||.|.||.|.||.||||||| ||| |.||
Sbjct  887  GTTGGTGT---CATTCCTTTCAAATACATGAAAGAACTCACACTGGGGAGAAGCCCTGTGAATGT-AGCAAATG  956

Query  951  TGGGAAAGCATTATCC-TCTCTTACAAGTTTTCAAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAA  1023
            |...|||||||  ||| |        ||||                              |.|||.|.|||   
Sbjct  957  TAATAAAGCAT--TCCGT--------AGTT------------------------------ACAGATCCTAT---  987

Query 1024  TGTAAGATATGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAA  1097
                                |||                      ||||||.|||..|.|||||..||||||||
Sbjct  988  --------------------CTT----------------------AGACATAAAAGGAGTCACACGGGAGAGAA  1019

Query 1098  ACCCTATAAATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTCCAGTTCCCTTCGATA-TCATGAAAGGACTCAC  1170
            .||.|||.||||||||.|.|||.|.|||||.|||.|..||.||||||||||||| || .|||||||||||.|||
Sbjct 1020  GCCTTATCAATGTAAGGAATGTAGAAAAGCATTCACGTATCCCAGTTCCCTTCG-TAGACATGAAAGGACCCAC  1092

Query 1171  ACTG-GAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCT-------------CACAC  1230
            .||| || |.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||   ||||   |             |||||
Sbjct 1093  TCTGCGA-AAAAACCTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATT---ATCT---TATAAGTTTTCAAACACAC  1159

Query 1231  CTTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATA  1304
            ||..||.||            |.|.|||||||.|.|||.||                                 
Sbjct 1160  CTAAGAATG------------CGCTCTGGAGAAAGACCTTA---------------------------------  1188

Query 1305  TGTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACA  1345
                                                     
Sbjct 1189  -----------------------------------------  1188