Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471005
• Subject: NM_152262.2
• Aligned Length: 1500
• Identities: 1258
• Gaps: 158

Alignment

Query    1  ---------------------------------------AT------GGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGC  29
                                                   ||      |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGTCACTCTCACCCATCCTCCTCTACACATGTGAGATGTTTCAGGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGC  74

Query   30  TGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGCTGG  103
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGAACTTCACCCAGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAAGAATCTCTACAGGGAAGTGATGCTGG  148

Query  104  AAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGAAAAAGGTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCC  177
            ||||||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  149  AAACTTTCTGGAACCTGACCTCTATAGGAAAAAAGTGGAAAGACCAGAACATTGAATATGAGTACCAAAACCCC  222

Query  178  AGGAGAAACTTCAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACAGTCATTGTGGAGAAACTTT  251
            ||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGAGAAACTTCAGGAGTGTCACAGAAGAGAAAGTCAATGAAATTAAAGAAGACAGTCATTGTGGAGAAACTTT  296

Query  252  TACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTCCAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCT  325
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TACCCCAGTTCCAGATGACAGGCTGAACTTCCAGAAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGACAGCT  370

Query  326  TTGTGTGTGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTGACATTGGACACAAGGCA  399
            ||||||||   |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  371  TTGTGTGT---GAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTCTAATATGAACATCAGAGGTGACACTGGACACAAGGCA  441

Query  400  TATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGTAAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTC  473
            |.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct  442  TGTGAATGTCAGGAATATGGACCAAAGCCATGGAAGAGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATATCACCCCTC  515

Query  474  CTTTAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTAAAGTATGTGGAAAAACCTTTATTT  547
            |||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||.|.||||||
Sbjct  516  CTTGAGAACACAAGAAAGGGATCACACTGGAAAGAAACCCTATGCTTGTAAAGAATGTGGAAAAAACATTATTT  589

Query  548  CCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAA  621
            .|||||||||..|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  ACCATTCAAGCATTCAAAGACACATGGTAGTGCACAGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAA  663

Query  622  GCATTCCATTGTCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCATGTGAATGTAAACA  695
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||
Sbjct  664  GCATTCCATTGTCTCAGTTTATATCTTATCCATGAAAGAACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAACA  737

Query  696  GTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATG  769
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  738  ATGTGGTAAATCTTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGAATACATGAAAGAACTCACATTGGAGAAAAGCCTTATG  811

Query  770  AATATCAGGAGTGTGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGACATGAAAGGATTCACATGGGAGAA  843
            |||.||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||.||..|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct  812  AATGTCAGGAATGTGGGAAAGCATTCCATAGTCCCAGATCCTGTCACAGACATGAAAGGAGTCACATGGGAGAG  885

Query  844  AAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACGTGTCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCA  917
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  886  AAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCATGTGTCCCCGTTATGTTCGTAGACATGAAAGGACCCA  959

Query  918  CTCTAGGAAAAATCTCTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACG  991
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  960  CTCTAGGAAAAAACTTTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTCAAACACACA  1033

Query  992  TAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATATGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTT  1065
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||..||.||||||
Sbjct 1034  TAAGAATGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGACATGTGGGAAAGGCTTTTATTCTGCCAAGTCATTT  1107

Query 1066  CAAAGACATGAAAAAATTCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCCCTCATTC  1139
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||.|||
Sbjct 1108  CAAAGACATGAAAAAACTCACAGTGGAGAGAAACCGTATAAATGCAAGCAATGTGGTAAAGCCTTCACTCGTTC  1181

Query 1140  CAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCT  1213
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  CGGTTCCTTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCT  1255

Query 1214  TCAGATCTGCCTCACACCTTCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCG------------------  1269
            |||||||||||.||.|.||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 1256  TCAGATCTGCCCCAAATCTTCAATTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATCAATGTAAGGAATGT  1329

Query 1270  ------------------------------------------------------------------TATGAATG  1277
                                                                              ||||||||
Sbjct 1330  GGGAAAGCTTTCAGATCTGCCTCACAACTTCGAATCCATCGTAGGATTCACACTGGAGAGAAACCCTATGAATG  1403

Query 1278  TAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGGACACAAACACACA------  1345
            ||||.|||||||||||||||||||||||||..|.|||.|||.|..|||||||||||||||||||||.|      
Sbjct 1404  TAAGAAATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTCCAGAACTTTCGATTTCATGAAAGGACACAAACACATAAGAATG  1477

Query 1346  --------------------  1345
                                
Sbjct 1478  CACTCTGGAGAAAGACCTTA  1497