Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471007
- Subject:
- NM_001100423.2
- Aligned Length:
- 1674
- Identities:
- 1464
- Gaps:
- 210
Alignment
Query 1 ATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGAACTCAATACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAG 74
Query 75 CAATAATGAAATAGTCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTTGTGGATG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAATAATGAAATAGTCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTTGTGGATG 148
Query 149 GCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGG---AAAGAAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAG 219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAGTGCAATTCAAGTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGGAAAAAAGAAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAG 222
Query 220 TCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCA 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCAAGCAGCATCAAGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCA 296
Query 294 GCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAA 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCACCACAGATTCAAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAA 370
Query 368 AACCAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGCACTTCGTGGGGTCAC- 440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACCAGCCCTTATCCCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGCACTTCGTGGGGTCACA 444
Query 441 -------------------------------------------------------------------------- 440
Sbjct 445 GAAGGCAACAGACTACTGCAACAGAAACTATCCTTAGATGGGAACCCCAAACCTATACATGGAACAACAGAGAG 518
Query 441 -------------------------------------------------------------------------- 440
Sbjct 519 GTCAGATGGCCTACAGTGGTCAGCTGAGCAGCCTTGTAACCCAAGCAAGCCTAAGGCAAAAACATCTCCTGTTA 592
Query 441 ----------------------------------------------------------AGGCCCAAATATTGAG 456
||||||||||||||||
Sbjct 593 AGTCCAATACCCCTGCAGCTCATCTTGAAATAAAGCCAGATGAGTTGGCAAAGAAAAGAGGCCCAAATATTGAG 666
Query 457 AAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGATTAAGGAAGAAGTGGA 530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAATCAGTGAAGGATTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGATTAAGGAAGAAGTGGA 740
Query 531 TAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCATTAA 604
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAGTTCCGTGAAGAAGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCATTAA 814
Query 605 TGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACTA 678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGCAGAAATGGATAAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACTA 888
Query 679 AAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGCAGAAATTAAGCACTT 752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGAGACTCACTGACCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGCAGAAATTAAGCACTT 962
Query 753 TGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAGG 826
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGTCAGCGAGCGTAAATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAGG 1036
Query 827 CCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCAAATCATGCTCTGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTG 1110
Query 901 CTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACAA 974
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGCCTCTGCTGAATGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACAA 1184
Query 975 TAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACCGCCGACCCCTCTCACC 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAAGCCCTCTGAAGGCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACCGCCGACCCCTCTCACC 1258
Query 1049 AGACCATGCCGGCCAACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCACAGTATCATAACAAC 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGACCATGCCGGCCAACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCACAGTATCATAACAAC 1332
Query 1123 AGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCCGCCA 1196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGGCTAAATGGGCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCCGCCA 1406
Query 1197 CGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCTTCCT 1270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CGAACACAGAAGACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCTTCCT 1480
Query 1271 TGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCACGCTGCAGACACCTCG 1344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGGGATGAAGACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCACGCTGCAGACACCTCG 1554
Query 1345 GAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAGTTTC 1418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAGGCCAGGCCCTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAGTTTC 1628
Query 1419 CACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC 1464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CACAGATGCAGCAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC 1674