Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471007
- Subject:
- XM_006496212.3
- Aligned Length:
- 1737
- Identities:
- 1279
- Gaps:
- 276
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGGCTGAACTCAA 14
||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGGAACACAGGAAACCGGCGCTTCGGCAAGCAAGGCTTATACCCCTAGAAGGAAGATGGCTGAACTCAA 74
Query 15 TACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAG 88
.|||||||||||..||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CACTCATGTGAACATCAAAGAGAAGATCTACGCAGTTAGATCAGTTGTTCCGAACAAAAGCAATAATGAAATCG 148
Query 89 TCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTTGTGGATGGCAGTGCAATTCAA 162
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 TGCTGGTACTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTACAGGCCTTTGTGGATGGCAGTGCTATTCAA 222
Query 163 GTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGGA---AAGAAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAGTCCAAGCAGCATCA 233
|||||.|||||||||||.|||||.||| ||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223 GTTCTTAAAGAATGGAACATGACGGGAAAGAAGAAGAATAATAAAAGGAAGAGAAGCAAATCCAAGCAGCATCA 296
Query 234 AGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTC 307
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||..||||||||||||||.|||.||||||.|.|.|
Sbjct 297 AGGCAACAAAGATGCTAAGGACAAGGTGGAGAGGCCAGAGGTGGGGCCCCTGCAGCCCCAGGCACCACTGGTAC 370
Query 308 AAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAAAACCAGCCCTTATC 381
||||.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||.|.|..|||||||..|||||.|..
Sbjct 371 AAAATGGTCACATGAATGGCTGCGAAAAGGACAGCTCATCCCCTGACTCTACCAGAGAAAAACTGGCCCTCACA 444
Query 382 CCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGCACTTCGTGGGGTCAC--------------- 440
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||.|||.|..|||||||||||
Sbjct 445 CCACGTGAGAAAAAGATCTCGATACTGGAGGAACCTCCAAGGGCTCAGCGTGGGGTCACAGAAGGCGGCAGACT 518
Query 441 -------------------------------------------------------------------------- 440
Sbjct 519 ACTGCAGCAGAAAATGTCCTTAGATGGGAACCCCAGAGCGATTCATGGACCATCAGAGAGGTCAGATGGCCCAC 592
Query 441 -------------------------------------------------------------------------- 440
Sbjct 593 AGTGGTCAGCTGGGCAGCCTTGTAACCCAAGCAAGCCTAAGGCAAAAACATCTCCTGTTAAGTCCAATGCCCCT 666
Query 441 --------------------------------------------AGGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGA 470
|||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 GCAGCTCATCTTGAAATAAAGCCAGATGAGCTGGCAAAGAAAAGAGGCCCAAATATTGAGAAATCGGTGAAGGA 740
Query 471 TTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGATTAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGA 544
|.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741 TCTGCAGCGCTGCACTGTTTCTCTGACGAGATACCGCGTCATGATCAAGGAAGAAGTGGACAGTTCCGTGAAGA 814
Query 545 AGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGAT 618
||||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct 815 AGATCAAAGCAGCATTTGCTGAGCTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCACTGATGGCAGAAATGGAC 888
Query 619 AAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGA 692
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 889 AAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGACATCCTGACTGCCCGTCAGAAGAAAGCAGAGGAGCTGAAGAGACTGACTGA 962
Query 693 CCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGCAGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTA 766
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 963 CCTAGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGAGCTGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAACGCA 1036
Query 767 AATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTC 840
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||.||
Sbjct 1037 AGTATGACGAGGAGCTGGGGAAGGCTGCCCGCTTCTCCTGTGACATTGAACAACTGAAAGCCCAAATCCTGATC 1110
Query 841 TGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAA 914
||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TGTGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAGCTACTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAA 1184
Query 915 TGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAG 988
..|.||.||.|.|.|.||.|||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||..||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1185 CACTCATGCGGTAGCTTCCGGGAAACAGGGGAATTTTGCCCGGAAGTCATCCGGTCACAACAAGCCCTCTGAGG 1258
Query 989 GCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACCGCCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCC 1062
|.|||||.|||||||||||||||||||||.|.||..|||.|||.|||||..|.|.|||||||||||||||..|.
Sbjct 1259 GGAAAGCAGCAAACCCCAAAATGGTGAGCGGACTTGCCAACACTGCCGATGCGTGTCACCAGACCATGCCCACT 1332
Query 1063 AACA---AGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCACAGTATCATAACAACAGGCTAAATGG 1133
|||| |||||||||||.||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACAAGCAGCAGAATGGACCTTCCAGCCAAAGACGAAGATTTAATCCACAGTATC---ACAACAGGCTAAATGG 1403
Query 1134 GCCTGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAA 1207
.||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||.||..|||..|||.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1404 TCCAGCCAAGTCACAGGGTGGTGGTAATGAAGCGGATCCCATGGCGAAGAGCAACAGCCGCCATGAACACAGAA 1477
Query 1208 GACAGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAG 1281
|||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..|||||||||..|||
Sbjct 1478 GACAGCCACATAATGGTTTCCGTCCCAAAAACAAAGGTGGTGCCAAAAACCAAGAGGCCCCCTTGGGGACAAAG 1551
Query 1282 ACCCCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCACGCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCC 1355
.||||.||||||||..|.||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||.||..|||||||||||
Sbjct 1552 GCCCCAGAGGCCCCCCCACATTCTGAAAAGGCCCGTCGAAGGCAGCATGCTGCAGACAACTTAGAGGCCAGGCC 1625
Query 1356 CTTCCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAG 1429
.||||||||||.|||..||||||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||..
Sbjct 1626 TTTCCGGGGTAATGTTAGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTTTGTCCCTCTAGAATAGAAGTTTCCACGGAGGCCA 1699
Query 1430 CAGTTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC 1464
|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1700 CGGTCCTCTCAGTCCCCGCTGTGACGTTGGTGGCC 1734