Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471007
- Subject:
- XM_017322123.1
- Aligned Length:
- 1734
- Identities:
- 1279
- Gaps:
- 273
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGGCTGAACTCAA 14
||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGGAACACAGGAAACCGGCGCTTCGGCAAGCAAGGCTTATACCCCTAGAAGGAAGATGGCTGAACTCAA 74
Query 15 TACTCATGTGAATGTCAAGGAAAAGATCTATGCAGTTAGATCAGTTGTTCCCAACAAAAGCAATAATGAAATAG 88
.|||||||||||..||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CACTCATGTGAACATCAAAGAGAAGATCTACGCAGTTAGATCAGTTGTTCCGAACAAAAGCAATAATGAAATCG 148
Query 89 TCCTGGTGCTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTGCAAGCCTTTGTGGATGGCAGTGCAATTCAA 162
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 TGCTGGTACTCCAACAGTTTGATTTTAATGTGGATAAAGCCGTACAGGCCTTTGTGGATGGCAGTGCTATTCAA 222
Query 163 GTTCTAAAAGAATGGAATATGACAGGA---AAGAAGAACAATAAAAGAAAAAGAAGCAAGTCCAAGCAGCATCA 233
|||||.|||||||||||.|||||.||| ||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 223 GTTCTTAAAGAATGGAACATGACGGGAAAGAAGAAGAATAATAAAAGGAAGAGAAGCAAATCCAAGCAGCATCA 296
Query 234 AGGCAACAAAGATGCTAAAGACAAGGTGGAGAGGCCTGAGGCAGGGCCCCTGCAGCCGCAGCCACCACAGATTC 307
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||..||||||||||||||.|||.||||||.|.|.|
Sbjct 297 AGGCAACAAAGATGCTAAGGACAAGGTGGAGAGGCCAGAGGTGGGGCCCCTGCAGCCCCAGGCACCACTGGTAC 370
Query 308 AAAACGGCCCCATGAATGGCTGCGAGAAGGACAGCTCGTCCACAGATTCTGCTAACGAAAAACCAGCCCTTATC 381
||||.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.|||.|.||.|||.|.|..|||||||..|||||.|..
Sbjct 371 AAAATGGTCACATGAATGGCTGCGAAAAGGACAGCTCATCCCCTGACTCTACCAGAGAAAAACTGGCCCTCACA 444
Query 382 CCTCGTGAGAAAAAGATCTCGATACTTGAGGAACCTTCAAAGGCACTTCGTGGGGTCAC--------------- 440
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||.|||.|..|||||||||||
Sbjct 445 CCACGTGAGAAAAAGATCTCGATACTGGAGGAACCTCCAAGGGCTCAGCGTGGGGTCACAGAAGGCGGCAGACT 518
Query 441 -------------------------------------------------------------------------- 440
Sbjct 519 ACTGCAGCAGAAAATGTCCTTAGATGGGAACCCCAGAGCGATTCATGGACCATCAGAGAGGTCAGATGGCCCAC 592
Query 441 -------------------------------------------------------------------------- 440
Sbjct 593 AGTGGTCAGCTGGGCAGCCTTGTAACCCAAGCAAGCCTAAGGCAAAAACATCTCCTGTTAAGTCCAATGCCCCT 666
Query 441 --------------------------------------------AGGCCCAAATATTGAGAAATCAGTGAAGGA 470
|||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 GCAGCTCATCTTGAAATAAAGCCAGATGAGCTGGCAAAGAAAAGAGGCCCAAATATTGAGAAATCGGTGAAGGA 740
Query 471 TTTGCAACGCTGCACCGTTTCTCTAACTAGATATCGCGTCATGATTAAGGAAGAAGTGGATAGTTCCGTGAAGA 544
|.||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741 TCTGCAGCGCTGCACTGTTTCTCTGACGAGATACCGCGTCATGATCAAGGAAGAAGTGGACAGTTCCGTGAAGA 814
Query 545 AGATCAAAGCTGCCTTTGCTGAATTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCATTAATGGCAGAAATGGAT 618
||||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct 815 AGATCAAAGCAGCATTTGCTGAGCTACACAACTGCATCATTGACAAAGAAGTTTCACTGATGGCAGAAATGGAC 888
Query 619 AAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGAAATCCTGACTGCTCGTCAGAAGAAAGCAGAAGAACTAAAGAGACTCACTGA 692
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||
Sbjct 889 AAAGTTAAAGAAGAAGCCATGGACATCCTGACTGCCCGTCAGAAGAAAGCAGAGGAGCTGAAGAGACTGACTGA 962
Query 693 CCTTGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGGGCAGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAGCGTA 766
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 963 CCTAGCCAGTCAGATGGCAGAGATGCAGCTGGCCGAACTCAGAGCTGAAATTAAGCACTTTGTCAGCGAACGCA 1036
Query 767 AATATGACGAGGAGCTCGGGAAAGCTGCCCGGTTTTCCTGTGACATCGAACAGCTGAAGGCCCAAATCATGCTC 840
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||.||.||
Sbjct 1037 AGTATGACGAGGAGCTGGGGAAGGCTGCCCGCTTCTCCTGTGACATTGAACAACTGAAAGCCCAAATCCTGATC 1110
Query 841 TGCGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAACTATTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAA 914
||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TGTGGAGAAATTACACATCCAAAGAACAGCTACTCCTCAAGAACTCCCTGCAGCTCCCTGCTGCCTCTGCTGAA 1184
Query 915 TGCGCACGCAGCAACCTCTGGGAAACAGAGTAACTTTTCCCGAAAATCATCCACTCACAATAAGCCCTCTGAAG 988
..|.||.||.|.|.|.||.|||||||||.|.||.|||.||||.||.||||||..||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1185 CACTCATGCGGTAGCTTCCGGGAAACAGGGGAATTTTGCCCGGAAGTCATCCGGTCACAACAAGCCCTCTGAGG 1258
Query 989 GCAAAGCGGCAAACCCCAAAATGGTGAGCAGTCTCCCCAGCACCGCCGACCCCTCTCACCAGACCATGCCGGCC 1062
|.|||||.|||||||||||||||||||||.|.||..|||.|||.|||||..|.|.|||||||||||||||..|.
Sbjct 1259 GGAAAGCAGCAAACCCCAAAATGGTGAGCGGACTTGCCAACACTGCCGATGCGTGTCACCAGACCATGCCCACT 1332
Query 1063 AACAAGCAGAATGGATCTTCTAACCAAAGACGGAGATTTAATCCACAGTATCATAACAACAGGCTAAATGGGCC 1136
|||||||||||||||.||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||| ||||||||||||||||.||
Sbjct 1333 AACAAGCAGAATGGACCTTCCAGCCAAAGACGAAGATTTAATCCACAGTATC---ACAACAGGCTAAATGGTCC 1403
Query 1137 TGCCAAGTCGCAGGGCAGTGGGAATGAAGCCGAGCCACTGGGAAAGGGCAACAGCCGCCACGAACACAGAAGAC 1210
.||||||||.|||||..||||.||||||||.||.||..|||..|||.|||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1404 AGCCAAGTCACAGGGTGGTGGTAATGAAGCGGATCCCATGGCGAAGAGCAACAGCCGCCATGAACACAGAAGAC 1477
Query 1211 AGCCGCACAACGGCTTCCGGCCCAAAAACAAAGGCGGTGCCAAAAATCAAGAGGCTTCCTTGGGGATGAAGACC 1284
||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..|||||||||..|||.||
Sbjct 1478 AGCCACATAATGGTTTCCGTCCCAAAAACAAAGGTGGTGCCAAAAACCAAGAGGCCCCCTTGGGGACAAAGGCC 1551
Query 1285 CCCGAGGCCCCGGCCCATTCTGAAAAGCCCCGGCGAAGGCAGCACGCTGCAGACACCTCGGAGGCCAGGCCCTT 1358
||.||||||||..|.||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||.||..|||||||||||.||
Sbjct 1552 CCAGAGGCCCCCCCACATTCTGAAAAGGCCCGTCGAAGGCAGCATGCTGCAGACAACTTAGAGGCCAGGCCTTT 1625
Query 1359 CCGGGGTAGTGTCGGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTCTGCCCCACGAGAATAGAAGTTTCCACAGATGCAGCAG 1432
||||||||.|||..||||||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||..|.|
Sbjct 1626 CCGGGGTAATGTTAGTAGGGTTTCACAGTGCAATCTTTGTCCCTCTAGAATAGAAGTTTCCACGGAGGCCACGG 1699
Query 1433 TTCTCTCAGTCCCGGCTGTGACGTTGGTGGCC 1464
|.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1700 TCCTCTCAGTCCCCGCTGTGACGTTGGTGGCC 1731