Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471008
• Subject: NM_010306.3
• Aligned Length: 1064
• Identities: 856
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGGCTGCACGCTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGTAAGATGATCGACCGCAACCTCCGTGA  74
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||.||
Sbjct    1  ATGGGCTGCACGTTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGCAAGATGATCGACCGCAACTTGCGGGA  74

Query   75  GGACGGCGAGAAGGCGGCGCGCGAGGTCAAGCTGCTGCTGCTCGGTGCTGGTGAATCTGGTAAAAGTACAATTG  148
            ||||||.|||||.|||||....||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct   75  GGACGGGGAGAAAGCGGCCAAAGAAGTGAAGCTGCTGCTGCTCGGCGCTGGAGAATCTGGTAAAAGTACCATCG  148

Query  149  TGAAGCAGATGAAAATTATCCATGAAGCTGGTTATTCAGAAGAGGAGTGTAAACAATACAAAGCAGTGGTCTAC  222
            ||||.|||||||||||.||.|||||.|..||.||||||||.||.||.||||||||.||.||||.|||.||||||
Sbjct  149  TGAAACAGATGAAAATCATTCATGAGGACGGCTATTCAGAGGACGAATGTAAACAGTATAAAGTAGTTGTCTAC  222

Query  223  AGTAACACCATCCAGTCAATTATTGCTATCATTAGGGCTATGGGGAGGTTGAAGATAGACTTTGGTGACTCAGC  296
            ||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||..|.||.|||||..||||||||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct  223  AGCAATACTATTCAGTCCATCATTGCAATCATACGAGCCATGGGACGGTTGAAGATTGATTTTGGGGAATCTGC  296

Query  297  CCGGGCGGATGATGCACGCCAACTCTTTGTGCTAGCT-GGAGCTGCTGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAACTT  369
            |.|.||.||||||||.||.||..|.|||||..||||| |||| ||||||||||||..|.||||||.|||||||.
Sbjct  297  CAGAGCAGATGATGCCCGACAGTTATTTGTTTTAGCTGGGAG-TGCTGAAGAAGGAGTCATGACTTCAGAACTA  369

Query  370  GCTGGAGTTATAAAGAGATTGTGGAAAGATAGTGGTGTACAAGCCTGTTTCAACAGATCCCGAGAGTACCAGCT  443
            ||.||.||.||.||..|.||.|||..||||.|.||.|||||.||.||.||.|.|||.|||.|.||.||.|||||
Sbjct  370  GCAGGCGTGATTAAACGTTTATGGCGAGATGGCGGGGTACAGGCATGCTTTAGCAGGTCCAGGGAATATCAGCT  443

Query  444  TAATGATTCTGCAGCATACTATTTGAATGACTTGGACAGAATAGCTCA-ACCAAATTACATCCCGACTCAACAA  516
            .|||||||||||..|||||||..|.|||||.|||||.||||||.|.|| ||| ||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  444  CAATGATTCTGCTTCATACTACCTAAATGATTTGGATAGAATATCCCAGACC-AACTACATTCCAACTCAGCAA  516

Query  517  GATGTTCTCAGAACTAGAGTGAAAACTACAGGAATTGTTGAAACCCATTTTACTTTCAAAGATCTTCATTTTAA  590
            ||||||||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||..|.||.||
Sbjct  517  GATGTTCTTCGGACAAGAGTGAAGACTACAGGCATTGTGGAGACCCACTTCACCTTCAAGGAACTCTACTTCAA  590

Query  591  AATGTTTGATGTGGGAGGTCAGAGATCTGAGCGGAAGAAGTGGATTCATTGCTTCGAAGGAGTGGCGGCGATCA  664
            ||||||||||||.||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||.|.||.||.|
Sbjct  591  AATGTTTGATGTAGGTGGCCAAAGATCCGAACGAAAAAAGTGGATTCACTGTTTTGAGGGAGTGACAGCAATTA  664

Query  665  TCTTCTGTGTAGCACTGAGTGACTACGACCTGGTTCTAGCTGAAGATGAAGAAATGAACCGAATGCATGAAAGC  738
            ||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  TCTTTTGTGTGGCTCTCAGTGATTACGACCTTGTTCTGGCTGAGGATGAGGAAATGAACCGAATGCATGAAAGC  738

Query  739  ATGAAATTGTTTGACAGCATATGTAACAACAAGTGGTTTACAGATACATCCATTATACTTTTTCTAAACAAGAA  812
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct  739  ATGAAATTGTTTGACAGCATTTGTAACAACAAATGGTTTACAGACACTTCAATCATTCTCTTTCTTAATAAGAA  812

Query  813  GGATCTTTTTGAAGAAAAAATCAAAAAGAGCCCTCTCACTATATGCTATCAAGAATATGCAGGATCAAACACAT  886
            .||.||||||||.||||||||.||.|.|||.||..|.||.||.||.||||.||||||..||||.||.||.||||
Sbjct  813  AGACCTTTTTGAGGAAAAAATAAAGAGGAGTCCATTAACAATCTGTTATCCAGAATACACAGGTTCCAATACAT  886

Query  887  ATGAAGAGGCAGCTGCATATATTCAATGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAAGAAAGGACACAAAGGAAATATAC  960
            |.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||...||||||.||.||.|||||..|.|||
Sbjct  887  ACGAAGAGGCAGCTGCTTACATTCAGTGCCAGTTTGAAGATCTGAACCGAAGAAAAGATACCAAGGAGGTCTAC  960

Query  961  ACCCACTTCACATGTGCCACAGATACTAAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTAACAGATGTCATCATAAA  1034
            ||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  961  ACTCACTTCACCTGTGCCACAGACACCAAAAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTTACGGATGTCATCATTAA  1034

Query 1035  AAATAATCTAAAAGATTGTGGTCTCTTT  1062
            |||.||..||||.||.|||||.||.|.|
Sbjct 1035  AAACAACTTAAAGGAATGTGGGCTTTAT  1062