Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000471010
Subject:
XM_011534091.2
Aligned Length:
1047
Identities:
846
Gaps:
201

Alignment

Query    1  ATGAACCGGAAAGCGCGGCGCTGCCTGGGCCACCTCTTTCTCAGCCTGGGCATGGTCTACCTCCGGATCGGTGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTCTCCTCAGTGGTAGCTCTGGGCGCAAGCATCATCTGTAACAAGATCCCAGGCCTGGCTCCCAGACAGCGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CGATCTGCCAGAGCCGGCCCGACGCCATCATCGTCATAGGAGAAGGCTCACAAATGGGCCTGGACGAGTGTCAG  222
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------ATGGGCCTGGACGAGTGTCAG  21

Query  223  TTTCAGTTCCGCAATGGCCGCTGGAACTGCTCTGCACTGGGAGAGCGCACCGTCTTCGGGAAGGAGCTCAAAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   22  TTTCAGTTCCGCAATGGCCGCTGGAACTGCTCTGCACTGGGAGAGCGCACCGTCTTCGGGAAGGAGCTCAAAGT  95

Query  297  GGGGAGCCGGGAGGCTGCGTTCACCTACGCCATCATTGCCGCCGGCGTGGCCCACGCCATCACAGCTGCCTGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   96  GGGGAGCCGGGAGGCTGCGTTCACCTACGCCATCATTGCCGCCGGCGTGGCCCACGCCATCACAGCTGCCTGTA  169

Query  371  CCCAGGGCAACCTGAGCGACTGTGGCTGCGACAAAGAGAAGCAAGGCCAGTACCACCGGGACGAGGGCTGGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  170  CCCAGGGCAACCTGAGCGACTGTGGCTGCGACAAAGAGAAGCAAGGCCAGTACCACCGGGACGAGGGCTGGAAG  243

Query  445  TGGGGTGGCTGCTCTGCCGACATCCGCTACGGCATCGGCTTCGCCAAGGTCTTTGTGGATGCCCGGGAGATCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  TGGGGTGGCTGCTCTGCCGACATCCGCTACGGCATCGGCTTCGCCAAGGTCTTTGTGGATGCCCGGGAGATCAA  317

Query  519  GCAGAATGCCCGGACTCTCATGAACTTGCACAACAACGAGGCAGGCCGAAAGATCCTGGAGGAGAACATGAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  GCAGAATGCCCGGACTCTCATGAACTTGCACAACAACGAGGCAGGCCGAAAGATCCTGGAGGAGAACATGAAGC  391

Query  593  TGGAATGTAAGTGCCACGGCGTGTCAGGCTCGTGCACCACCAAGACGTGCTGGACCACACTGCCACAGTTTCGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392  TGGAATGTAAGTGCCACGGCGTGTCAGGCTCGTGCACCACCAAGACGTGCTGGACCACACTGCCACAGTTTCGG  465

Query  667  GAGCTGGGCTACGTGCTCAAGGACAAGTACAACGAGGCCGTTCACGTGGAGCCTGTGCGTGCCAGCCGCAACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  GAGCTGGGCTACGTGCTCAAGGACAAGTACAACGAGGCCGTTCACGTGGAGCCTGTGCGTGCCAGCCGCAACAA  539

Query  741  GCGGCCCACCTTCCTGAAGATCAAGAAGCCACTGTCGTACCGCAAGCCCATGGACACGGACCTGGTGTACATCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  GCGGCCCACCTTCCTGAAGATCAAGAAGCCACTGTCGTACCGCAAGCCCATGGACACGGACCTGGTGTACATCG  613

Query  815  AGAAGTCGCCCAACTACTGCGAGGAGGACCCGGTGACCGGCAGTGTGGGCACCCAGGGCCGCGCCTGCAACAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  AGAAGTCGCCCAACTACTGCGAGGAGGACCCGGTGACCGGCAGTGTGGGCACCCAGGGCCGCGCCTGCAACAAG  687

Query  889  ACGGCTCCCCAGGCCAGCGGCTGTGACCTCATGTGCTGTGGGCGTGGCTACAACACCCACCAGTACGCCCGCGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  ACGGCTCCCCAGGCCAGCGGCTGTGACCTCATGTGCTGTGGGCGTGGCTACAACACCCACCAGTACGCCCGCGT  761

Query  963  GTGGCAGTGCAACTGTAAGTTCCACTGGTGCTGCTATGTCAAGTGCAACACGTGCAGCGAGCGCACGGAGATGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  GTGGCAGTGCAACTGTAAGTTCCACTGGTGCTGCTATGTCAAGTGCAACACGTGCAGCGAGCGCACGGAGATGT  835

Query 1037  ACACGTGCAAG  1047
            |||||||||||
Sbjct  836  ACACGTGCAAG  846