Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471038
• Subject: XM_006712398.4
• Aligned Length: 783
• Identities: 631
• Gaps: 138

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------ATGGCC  6
                                                                               .|.|..
Sbjct   1  ATGTGGAGAAGACAGGAGGAAGTCCTTCCTAAAATAAACCTGACCTCCTGTGGGTTCCCAAACACTAACTTGTT  74

Query   7  TACCCGGG-ATACGGAGGAGGG---------TTTGGAAATTTTAGCATTCAGGTGCCAGGAATGCAGATGGGAC  70
           |.||.||| ||..|||||.|||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCCCTGGGAATTTGGAGGTGGGTTCGAAAAATTTGGAAATTTTAGCATTCAGGTGCCAGGAATGCAGATGGGAC  148

Query  71  AGCCAGTGCCAGAAACAGGCCCAGCTATACTCCTCGATGGATACTCTGGGCCAGCATATTCAGACACTTATTCC  144
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGCCAGTGCCAGAAACAGGCCCAGCTATACTCCTCGATGGATACTCTGGGCCAGCATATTCAGACACTTATTCC  222

Query 145  TCAGCTGGTGACTCCGTGTATACTTACTTCAGTGCTGTTGCTGGACAGGATGGTGAAGTGGATGCTGAAGAACT  218
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TCAGCTGGTGACTCCGTGTATACTTACTTCAGTGCTGTTGCTGGACAGGATGGTGAAGTGGATGCTGAAGAACT  296

Query 219  TCAGAGATGTTTGACACAGTCTGGAATTAATGGAACTTACTCTCCCTTCAGTTTGGAAACCTGCAGAATTATGA  292
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TCAGAGATGTTTGACACAGTCTGGAATTAATGGAACTTACTCTCCCTTCAGTTTGGAAACCTGCAGAATTATGA  370

Query 293  TTGCCATGTTGGATAGAGATCACACAGGAAAAATGGGATTTAATGCATTCAAAGAGCTATGGGCAGCTCTTAAT  366
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TTGCCATGTTGGATAGAGATCACACAGGAAAAATGGGATTTAATGCATTCAAAGAGCTATGGGCAGCTCTTAAT  444

Query 367  GCCTGGAAGGAAAACTTCATGACTGTTGATCAAGATGGAAGTGGCACAGTAGAACATCATGAGTTGCGTCAAGC  440
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GCCTGGAAGGAAAACTTCATGACTGTTGATCAAGATGGAAGTGGCACAGTAGAACATCATGAGTTGCGTCAAGC  518

Query 441  CATTGGTCTTATGGGTTATAGGTTGAGTCCTCAAACATTAACTACAATTGTTAAACGTTATAGCAAGAATGGCA  514
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CATTGGTCTTATGGGTTATAGGTTGAGTCCTCAAACATTAACTACTATTGTTAAACGTTATAGCAAGAATGGCA  592

Query 515  GAATTTTCTTTGATGATTATGTTGCTTGCTGTGTGAAGCTTCGAGCATTGACAGATTTCTTTAGGAAAAGAGAC  588
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  GAATTTTCTTTGATGATTATGTTGCTTGCTGTGTGAAGCTTCGAGCATTGACAGATTTCTTTAGGAAAAGAGAC  666

Query 589  CACTTGCAACAAGGGTCTGCGAATTTCATATATGACGATTTTTTGCAGGGCACTATG---GCAATT--------  651
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.||.|||    .|||   |.||||        
Sbjct 667  CACTTGCAACAAGGGTCTGCGAATTTCATATATGACGA--TTGTGGAGG----AATGAACGTAATTAACTTTGA  734

Query 652  -------------------------------------------  651
                                                      
Sbjct 735  ACATCTTGATACAGAAAGACCTGAATCTGTGTGCAAAAGTGAC  777