Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471065
• Subject: XM_005271614.3
• Aligned Length: 1482
• Identities: 1300
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  ATGTTACAGGATCCTGAGAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC  74
            ||      |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  AT------GGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC  68

Query   75  CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   69  CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG  142

Query  149  TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  143  TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG  216

Query  223  CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG  290

Query  297  GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT  364

Query  371  TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  365  TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA  438

Query  445  CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA  512

Query  519  GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  513  GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA  586

Query  593  AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGGGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGTGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC  660

Query  667  CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  661  CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT  734

Query  741  CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  735  CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG  808

Query  815  CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  809  CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG  882

Query  889  CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  883  CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGC  956

Query  963  CACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGGAAGATGTCTGACATACTGCTGCAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957  CACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGGAAGATGTCTGACATACTGCTGCAGG  1030

Query 1037  CGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031  CGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATG  1104

Query 1111  ATGTGTGCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAGTGGTGGGCCCCTGATGTACCAATC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105  ATGTGTGCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAGTGGTGGGCCCCTGATGTACCAATC  1178

Query 1185  TGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGCTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179  TGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGTTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACA  1252

Query 1259  CCAAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGCT--------------GAGCTG-------  1311
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|              .|||||       
Sbjct 1253  CCAAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGATAGAACTATTCAGAGAAGCTGTAACTCC  1326

Query 1312  --------------------------------------------------------------------------  1311
                                                                                      
Sbjct 1327  CCAGGGACAGGTCTTGTGATTCAGCAACCAGCTGTACCGCTGATGGAGCTACGGTCAGCTCGGCACACACATCG  1400

Query 1312  --------------------------------------------------------------------------  1311
                                                                                      
Sbjct 1401  CCTGACCACCTGTGTTTGCTTTCTCTCATTCCCTGCCTTACAGCCCCTGTCCCCCTTATGCCCATTTCCCTGGG  1474

Query 1312  --  1311
              
Sbjct 1475  AT  1476