Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471065
- Subject:
- XM_011542902.2
- Aligned Length:
- 1482
- Identities:
- 1192
- Gaps:
- 285
Alignment
Query 1 ATGTTACAGGATCCTGAGAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC 74
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTACAGGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCG------------------------------- 43
Query 75 CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG 148
Sbjct 44 -------------------------------------------------------------------------- 43
Query 149 TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44 ---------TCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG 108
Query 223 CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 109 CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG 182
Query 297 GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 183 GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT 256
Query 371 TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 257 TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA 330
Query 445 CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331 CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA 404
Query 519 GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405 GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA 478
Query 593 AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGGGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC 666
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGTGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC 552
Query 667 CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT 626
Query 741 CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG 700
Query 815 CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 701 CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG 774
Query 889 CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGGCCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCCAGC 848
Query 963 CACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGGAAGATGTCTGACATACTGCTGCAGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 CACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGAGGGAAGATGTCTGACATACTGCTGCAGG 922
Query 1037 CGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 923 CGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTACCAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATG 996
Query 1111 ATGTGTGCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAGTGGTGGGCCCCTGATGTACCAATC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 997 ATGTGTGCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAGTGGTGGGCCCCTGATGTACCAATC 1070
Query 1185 TGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGCTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071 TGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGTTGGGGCTATGGCTGCGGGGGCCCGAGCACCCCAGGAGTATACA 1144
Query 1259 CCAAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGCT--------------GAGCTG------- 1311
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| .|||||
Sbjct 1145 CCAAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGATAGAACTATTCAGAGAAGCTGTAACTCC 1218
Query 1312 -------------------------------------------------------------------------- 1311
Sbjct 1219 CCAGGGACAGGTCTTGTGATTCAGCAACCAGCTGTACCGCTGATGGAGCTACGGTCAGCTCGGCACACACATCG 1292
Query 1312 -------------------------------------------------------------------------- 1311
Sbjct 1293 CCTGACCACCTGTGTTTGCTTTCTCTCATTCCCTGCCTTACAGCCCCTGTCCCCCTTATGCCCATTTCCCTGGG 1366
Query 1312 -- 1311
Sbjct 1367 AT 1368