Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471065
- Subject:
- XM_011542903.3
- Aligned Length:
- 1335
- Identities:
- 987
- Gaps:
- 324
Alignment
Query 1 ATGTTACAGGATCCTGAGAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC 74
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTACAGGATCCTGACAGTGATCAACCTCTGAACAGCCTCGATGTCAAACCCCTGCGCAAACCCCGTATCCC 74
Query 75 CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGAGACCTTCAGAAAGGTGGGGATCCCCATCATCATAGCACTACTGAGCCTGGCGAGTATCATCATTGTGG 148
Query 149 TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTGTCCTCATCAAGGTGATTCTGGATAAATACTACTTCCTCTGCGGGCAGCCTCTCCACTTCATCCCGAGGAAG 222
Query 223 CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGCTGTGTGACGGAGAGCTGGACTGTCCCTTGGGGGAGGACGAGGAGCACTGTGTCAAGAGCTTCCCCGAAGG 296
Query 297 GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCCTGCAGTGGCAGTCCGCCTCTCCAAGGACCGATCCACACTGCAGGTGCTGGACTCGGCCACAGGGAACTGGT 370
Query 371 TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TCTCTGCCTGTTTCGACAACTTCACAGAAGCTCTCGCTGAGACAGCCTGTAGGCAGATGGGCTACAGCAGCAAA 444
Query 445 CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCCACTTTCAGAGCTGTGGAGATTGGCCCAGACCAGGATCTGGATGTTGTTGAAATCACAGAAAACAGCCAGGA 518
Query 519 GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTTCGCATGCGGAACTCAAGTGGGCCCTGTCTCTCAGGCTCCCTGGTCTCCCTGCACTGTCTTGCCTGTGGGA 592
Query 593 AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGGGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC 666
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAGCCTGAAGACCCCCCGTGTGGTGGGTGTGGAGGAGGCCTCTGTGGATTCTTGGCCTTGGCAGGTCAGCATC 666
Query 667 CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGTACGACAAACAGCACGTCTGTGGAGGGAGCATCCTGGACCCCCACTGGGTCCTCACGGCAGCCCACTGCTT 740
Query 741 CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGGAAACATACCGATGTGTTCAACTGGAAGGTGCGGGCAGGCTCAGACAAACTGGGCAGCTTCCCATCCCTGG 814
Query 815 CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGTGGCCAAGATCATCATCATTGAATTCAACCCCATGTACCCCAAAGACAATGACATCGCCCTCATGAAGCTG 888
Query 889 CAGTTCCCACTCACTTTCTCAGGCACAGTCAGG---CCCATCTGTCTGCCCTTCTTTGATGAGGAGCTCACTCC 959
|||||||||||||||||||||| .||||| ||||.||| ||.||
Sbjct 889 CAGTTCCCACTCACTTTCTCAG-----ATCAGGATTCCCAACTG---------------TGGGG---------- 932
Query 960 AGCCACCCCACTCTGGATCATTGGATGGGGCTTTACGAAGCAGAATGGA---------------------GGGA 1012
.||||...||.||||..|.||||| |||| ||| ||| ||||
Sbjct 933 -TCCACAAGACACTGGCCCCTTGGA-----------GAAG-AGA--GGATTCCATTGTCAAATAAGTTTGGGGA 991
Query 1013 AGATGTCTGACATACTGCTGCAGGCGTCAGTCCAGGTCATTGACAGCACACGGTGCAATGCAGACGATGCGTAC 1086
|.|| |..|||||| |||||.|.| |.|.|
Sbjct 992 ACAT---TTTCATACT--------------------------ACAGCTCCC----------------TTCTT-- 1018
Query 1087 CAGGGGGAAGTCACCGAGAAGATGATGTGTGCAGGCATCCCGGAAGGGGGTGTGGACACCTGCCAGGGTGACAG 1160
|||| ||| |..||.|.||
Sbjct 1019 -----GGAA--CAC--ATTAGTTTAT------------------------------------------------ 1035
Query 1161 TGGTGGGCCCCTGATGTACCAATCTGACCAGTGGCATGTGGTGGGCATCGTTAGCTGGGGCTATGGCTGCGGGG 1234
Sbjct 1036 -------------------------------------------------------------------------- 1035
Query 1235 GCCCGAGCACCCCAGGAGTATACACCAAGGTCTCAGCCTATCTCAACTGGATCTACAATGTCTGGAAGGCTGAG 1308
Sbjct 1036 -------------------------------------------------------------------------- 1035
Query 1309 CTG 1311
Sbjct 1036 --- 1035