Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471083
• Subject: XM_011533264.1
• Aligned Length: 1427
• Identities: 1152
• Gaps: 271

Alignment

Query    1  ATGCCTATCCGTGCTCTGTGCACTATCTGCTCCGACTTCTTCGATCACTCCCGCGACGTGGCCGCCATCCACTG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGCCACACCTTCCACTTGCAGTGCCTAATTCAGTGGTTTGAGACAGCACCAAGTCGGACCTGCCCACAGTGCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAATCCAGGTTGGCAAAAGAACCATTATCAATAAGCTCTTCTTTGATCTTGCCCAGGAGGAGGAGAATGTCTTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GATGCAGAATTCTTAAAGAATGAACTGGACAATG--------------TCAG------AGCCCAGCTTTCCCAG  276
                               |||.| ||||||  |              ||.|      |.|||.||  |||   
Sbjct    1  -------------------ATGGA-TGGACA--GGCCTTTCCCTTTCCTCCGCCCTCTACCCCTGC--TCC---  47

Query  277  AAAGACAAGGAGAAACGAGACAGCCAGGTCATCATCGACACTCTGCGGGATACGCTGGAAGAACGCAATGCTAC  350
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  --AGACAAGGAGAAACGAGACAGCCAGGTCATCATCGACACTCTGCGGGATACGCTGGAAGAACGCAATGCTAC  119

Query  351  TGTGGTATCTCTGCAGCAGGCCTTGGGCAAGGCCGAGATGCTGTGCTCCACACTGAAAAAGCAGATGAAGTACT  424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  120  TGTGGTATCTCTGCAGCAGGCCTTGGGCAAGGCCGAGATGCTGTGCTCCACACTGAAAAAGCAGATGAAGTACT  193

Query  425  TAGAGCAGCAGCAGGATGAGACCAAACAAGCACAAGAGGAGGCCCGCCGGCTCAGGAGCAAGATGAAGACCATG  498
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  194  TAGAGCAGCAGCAGGATGAGACCAAACAAGCACAAGAGGAGGCCCGCCGGCTCAGGAGCAAGATGAAGACCATG  267

Query  499  GAGCAGATTGAGCTTCTACTCCAGAGCCAGCGCCCTGAGGTGGAGGAGATGATCCGAGACATGGGTGTGGGACA  572
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  268  GAGCAGATTGAGCTTCTACTCCAGAGCCAGCGCCCTGAGGTGGAGGAGATGATCCGAGACATGGGTGTGGGACA  341

Query  573  GTCAGCGGTGGAACAGCTGGCTGTGTACTGTGTGTCTCTCAAGAAAGAGTACGAGAATCTAAAAGAGGCACGGA  646
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  342  GTCAGCGGTGGAACAGCTGGCTGTGTACTGTGTGTCTCTCAAGAAAGAGTACGAGAATCTAAAAGAGGCACGGA  415

Query  647  AGGCCTCAGGGGAGGTGGCTGACAAGCTGAGGAAGGATTTGTTTTCCTCCAGAAGCAAGTTGCAGACAGTCTAC  720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  416  AGGCCTCAGGGGAGGTGGCTGACAAGCTGAGGAAGGATTTGTTTTCCTCCAGAAGCAAGTTGCAGACAGTCTAC  489

Query  721  TCTGAATTGGATCAGGCCAAGTTAGAACTGAAGTCAGCCCAGAAGGACTTACAGAGTGCTGACAAGGAAATCAT  794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  490  TCTGAATTGGATCAGGCCAAGTTAGAACTGAAGTCAGCCCAGAAGGACTTACAGAGTGCTGACAAGGAAATCAT  563

Query  795  GAGCCTGAAAAAGAAGCTAACGATGCTGCAGGAAACCTTGAACCTGCCACCAGTGGCCAGTGAGACTGTCGACC  868
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  564  GAGCCTGAAAAAGAAGCTAACGATGCTGCAGGAAACCTTGAACCTGCCACCAGTGGCCAGTGAGACTGTCGACC  637

Query  869  GCCTGGTTTTAGAGAGCCCAGCCCCTGTGGAGGTGAATCTGAAGCTCCGCCGGCCATCCTTCCGTGATGATATT  942
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  638  GCCTGGTTTTAGAGAGCCCAGCCCCTGTGGAGGTGAATCTGAAGCTCCGCCGGCCATCCTTCCGTGATGATATT  711

Query  943  GATCTCAATGCTACCTTTGATGTGGATACTCCCCCAGCCCGGCCCTCCAGCTCCCAGCATGGTTACTACGAAAA  1016
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  712  GATCTCAATGCTACCTTTGATGTGGATACTCCCCCAGCCCGGCCCTCCAGCTCCCAGCATGGTTACTACGAAAA  785

Query 1017  ACTTTGCCTAGAGAAGTCACACTCCCCAATTCAGGATGTCCCCAAGAAGATATGCAAAGGCCCCAGGAAGGAGT  1090
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  786  ACTTTGCCTAGAGAAGTCACACTCCCCAATTCAGGATGTCCCCAAGAAGATATGCAAAGGCCCCAGGAAGGAGT  859

Query 1091  CCCAGCTCTCACTGGGTGGCCAGAGCTGTGCAGGAGAGCCAGATGAGGAACTGGTTGGTGCCTTCCCTATTTTT  1164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  860  CCCAGCTCTCACTGGGTGGCCAGAGCTGTGCAGGAGAGCCAGATGAGGAACTGGTTGGTGCCTTCCCTATTTTT  933

Query 1165  GTCCGGAATGCCATCCTAGGCCAGAAACAGCCCAAGAGGCCCAGGTCAGAGTCCTCTTGCAGCAAAGATGTGGT  1238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  934  GTCCGGAATGCCATCCTAGGCCAGAAACAGCCCAAGAGGCCCAGGTCAGAGTCCTCTTGCAGCAAAGATGTGGT  1007

Query 1239  AAGGACAGGCTTCGATGGGCTCGGTGGCCGGACAAAATTCATCCAGCCTACTGACACAGTCATGATCCGCCCAT  1312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008  AAGGACAGGCTTCGATGGGCTCGGTGGCCGGACAAAATTCATCCAGCCTACTGACACAGTCATGATCCGCCCAT  1081

Query 1313  TGCCTGTTAAGCCCAAGACCAAGGTTAAGCAGAGGGTGAGGGTGAAGACAGTGCCTTCTCTCTTCCAGGCCAAG  1386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082  TGCCTGTTAAGCCCAAGACCAAGGTTAAGCAGAGGGTGAGGGTGAAGACAGTGCCTTCTCTCTTCCAGGCCAAG  1155

Query 1387  CTGGACACCTTCCTGTGGTCG  1407
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1156  CTGGACACCTTCCTGTGGTCG  1176