Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471087
• Subject: NM_001190996.1
• Aligned Length: 1110
• Identities: 1068
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ATGTCACTGCATCAGTTTTTACTAGAGCCAATCACCTGTCATGCCTGGAACAGGGATCGTACTCAGATTGCCCT  74
                                                    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------ATGCCTGGAACAGGGATCGTACTC--ATTGCCCT  32

Query   75  CAGTCCCAATAATCACGAAGTGCACATCTATAAGAAGAACGGGAGCCAGTGGGTGAAAGCTCATGAACTCAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   33  CAGTCCCAATAATCACGAAGTGCACATCTATAAGAAGAACGGGAGCCAGTGGGTGAAAGCTCATGAACTCAAGG  106

Query  149  AGCACAACGGACACATCACAGGTATTGACTGGGCTCCCAAGAGCGACCGCATTGTCACTTGTGGGGCAGACCGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  107  AGCACAACGGACACATCACAGGTATTGACTGGGCTCCCAAGAGCGACCGCATTGTCACTTGTGGGGCAGACCGC  180

Query  223  AATGCCTATGTCTGGAGTCAGAAAGATGGTGTTTGGAAGCCAACCCTGGTGATCCTGAGAATTAATCGCGCAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  AATGCCTATGTCTGGAGTCAGAAAGATGGTGTTTGGAAGCCAACCCTGGTGATCCTGAGAATTAATCGCGCAGC  254

Query  297  TACTTTTGTGAAGTGGTCCCCCCTAGAGAACAAATTTGCTGTGGGAAGTGGAGCACGACTCATTTCTGTTTGTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  255  TACTTTTGTGAAGTGGTCCCCCCTAGAGAACAAATTTGCTGTGGGAAGTGGAGCACGACTCATTTCTGTTTGTT  328

Query  371  ACTTTGAGTCTGAAAATGACTGGTGGGTGAGCAAGCACATTAAAAAGCCGATTCGCTCCACAGTCCTCAGCTTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  ACTTTGAGTCTGAAAATGACTGGTGGGTGAGCAAGCACATTAAAAAGCCGATTCGCTCCACAGTCCTCAGCTTG  402

Query  445  GATTGGCATCCCAACAACGTTTTGCTGGCAGCAGGATCATGTGACTTCAAATGCAGAGTGTTTTCTGCCTACAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  GATTGGCATCCCAACAACGTTTTGCTGGCAGCAGGATCATGTGACTTCAAATGCAGAGTGTTTTCTGCCTACAT  476

Query  519  TAAAGAAGTGGATGAAAAGCCAGCCAGCACGCCCTGGGGCAGCAAGATGCCTTTTGGGCAGCTGATGTCAGAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  TAAAGAAGTGGATGAAAAGCCAGCCAGCACGCCCTGGGGCAGCAAGATGCCTTTTGGGCAGCTGATGTCAGAGT  550

Query  593  TTGGTGGCAGTGGCACTGGTGGCTGGGTCCACGGGGTAAGCTTCTCTGCCAGTGGGAGCCGCCTGGCCTGGGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  TTGGTGGCAGTGGCACTGGTGGCTGGGTCCACGGGGTAAGCTTCTCTGCCAGTGGGAGCCGCCTGGCCTGGGTC  624

Query  667  AGCCACGACAGCACCGTGTCTGTTGCTGATGCCTCAAAAAGTGTGCAGGTCTCGACTCTGAAGACAGAGTTCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  AGCCACGACAGCACCGTGTCTGTTGCTGATGCCTCAAAAAGTGTGCAGGTCTCGACTCTGAAGACAGAGTTCCT  698

Query  741  GCCGCTCCTAAGTGTGTCATTTGTCTCAGAGAACAGCGTCGTGGCTGCTGGCCATGACTGCTGCCCAATGCTCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  699  GCCGCTCCTAAGTGTGTCATTTGTCTCAGAGAACAGCGTCGTGGCTGCTGGCCATGACTGCTGCCCAATGCTCT  772

Query  815  TTAACTACGATGACCGCGGCTGCCTGACCTTCGTCTCCAAGTTAGATATTCCAAAACAGAGCATCCAACGCAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773  TTAACTACGATGACCGCGGCTGCCTGACCTTCGTCTCCAAGTTAGATATTCCAAAACAGAGCATCCAACGCAAC  846

Query  889  ATGTCTGCCATGGAACGCTTCCGCAACATGGACAAGAGAGCCACAACTGAGGACCGCAACACGGCCTTGGAGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  847  ATGTCTGCCATGGAACGCTTCCGCAACATGGACAAGAGAGCCACAACTGAGGACCGCAACACGGCCTTGGAGAC  920

Query  963  GCTGCACCAGAATAGCATCACTCAAGTCTCTATTTATGAGGTGGACAAGCAAGATTGTCGCAAATTTTGCACTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  921  GCTGCACCAGAATAGCATCACTCAAGTCTCTATTTATGAGGTGGACAAGCAAGATTGTCGCAAATTTTGCACTA  994

Query 1037  CTGGCATCGATGGAGCCATGACAATTTGGGATTTCAAGACCCTCGAGTCTTCCATCCAGGGCCTCCGGATAATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  995  CTGGCATCGATGGAGCCATGACAATTTGGGATTTCAAGACCCTCGAGTCTTCCATCCAGGGCCTCCGGATAATG  1068