Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471095
• Subject: NM_001311116.1
• Aligned Length: 1602
• Identities: 1426
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------ATGGAATCACCAGAGGAGCCTGGAGC  26
                                                            |||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAAGGAGGTATCGCAGATAGTTGGCAAAGAGAGAAGTTGGCTACCATGGAGTCACCAGAGGAGCCTGGAGC  74

Query   27  ATCCATGGATGAGAACTACTTTGTGAACTACACTTTCAAAGATCGGTCACATTCAGGCCGTGTGGCTCAAGGCA  100
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct   75  ATCCATGGATGAAAACTACTTTGTGAACTATACTTTCAAAGACCGGTCTCACTCAGGCCGAGTGGCTCAGGGCA  148

Query  101  TCATGAAACTGTGTCTAGAGGAGGAGCTCTTTGCTGATGTCACCATTTCGGTGGAAGGCCGGGAGTTTCAGCTC  174
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  149  TCATGAAACTGTGTTTAGAGGAGGAGCTCTTTGCTGATGTCACCATTTCAGTGGAAGGCCGAGAGTTTCAGCTG  222

Query  175  CATCGGCTGGTCCTCTCAGCTCAGAGCTGCTTCTTCCGATCCATGTTCACTTCCAACCTGAAGGAGGCCCACAA  248
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  CACCGGCTGGTCCTGTCAGCTCAGAGCTGCTTCTTCCGATCCATGTTCACATCCAACCTGAAGGAGGCTCACAA  296

Query  249  CCGGGTGATTGTGCTGCAGGATGTCAGCGAGTCTGTTTTCCAGCTCCTGGTTGATTATATCTACCATGGGACTG  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  297  CCGGGTGATTGTGCTGCAGGATGTCAGCGAGTCTGTTTTCCAGCTCCTAGTTGACTATATATACCATGGGACTG  370

Query  323  TGAAACTTCGAGCTGAGGAGTTGCAGGAAATTTATGAGGTGTCAGACATGTATCAGCTGACATCTCTCTTTGAG  396
            ||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAACTTCGAGCTGATGAGCTGCAGGAAATTTACGAGGTGTCAGACATGTATCAGCTGACATCTCTCTTTGAG  444

Query  397  GAATGCTCTCGGTTTTTGGCCCGCACAGTGCAAGTGGGAAACTGCCTTCAGGTGATGTGGCTGGCAGATCGGCA  470
            ||.||.|||||||||.||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||.|.||
Sbjct  445  GAGTGTTCTCGGTTTCTGGCACGCACGGTACAGGTGGGCAACTGCCTGCAGGTGATGTGGCTTGCAGATAGACA  518

Query  471  CAGTGATCCTGAGCTCTATACGGCTGCCAAGCACTGTGCCAAGACCCACCTGGCCCAGCTGCAGAATACAGAGG  544
            ||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct  519  CAGTGACCCCGAGCTCTACACTGCTGCCAAGCACTGTGCCAAGACCCACCTGGCCCAGCTGCAGAGCACAGAGG  592

Query  545  AATTTCTCCACTTGCCCCACCGCTTACTCACAGATATCATCTCGGATGGAGTTCCGTGTTCTCAGAACCCAACA  618
            |.||.||||||||||||||||...|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  593  AGTTCCTCCACTTGCCCCACCATCTACTCACTGATATCATCTCAGATGGGGTTCCATGTTCCCAGAACCCAACA  666

Query  619  GAGGCAATAGAAGCCTGGATCAACTTTAATAAAGAGGAAAGAGAGGCTTTTGCAGAGTCACTCAGGACAAGCTT  692
            ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  667  GAGGCAATAGAAGCTTGGATCAATTTCAATAAAGAGGAAAGAGAGGCTTTTGCCGAGTCACTAAGGACTAGCTT  740

Query  693  GAAGGAAATTGGGGAGAATGTGCACATTTACCTGATTGGGAAAGAGTCATCTCGTACCCACTCGTTGGCTGTGT  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct  741  GAAGGAAATTGGGGAGAATGTGCACATTTACCTGATCGGAAAAGAGTCATCCCGCACGCACTCATTGGCTGTGT  814

Query  767  CCTTGCACTGTGCAGAAGATGACTCCATCAGTGTAAGTGGCCAAAACAGTTTGTGCCACCAGATCACTGCGGCC  840
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  CCTTGCACTGTGCAGAAGATGACTCCATCAGTGTAAGTGGCCAAAACAGCTTATGCCACCAAATCACTGCAGCC  888

Query  841  TGCAAGCATGGTGGAGACTTGTATGTGGTGGGAGGGTCCATCCCACGGCGCATGTGGAAGTGCAACAATGCCAC  914
            ||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  889  TGCAAGCATGGTGGCGACCTGTATGTGGTAGGAGGGTCCATCCCACGACGCATGTGGAAATGTAACAATGCCAC  962

Query  915  CGTTGACTGGGAGTGGTGTGCTCCTTTGCCTCGGGACCGGCTCCAGCACACCCTGGTGTCTGTGCCCGGGAAAG  988
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  TGTTGACTGGGAGTGGTGTGCTCCTTTGCCCCGCGACCGCCTCCAGCACACCCTAGTATCTGTGCCTGGGAAAG  1036

Query  989  ATGCCATATATTCACTGGGTGGCAAGACACTGCAAGATACCCTCTCCAACGCAGTCATTTATTATCGCGTAGGT  1062
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 1037  ATGCCATATATTCCCTGGGCGGCAAGACACTACAGGATACCCTCTCGAATGCAGTTATCTACTATCGGGTAGGT  1110

Query 1063  GATAATGTGTGGACAGAGACAACTCAGCTAGAGGTGGCTGTGTCAGGGGCTGCTGGTGCCAACCTCAACGGGAT  1136
            |||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1111  GATAACGTGTGGACAGAGACAACTCAGTTAGAGGTGGCTGTGTCTGGGGCTGCTGGTGCCAACCTGAATGGAAT  1184

Query 1137  CATCTACTTACTAGGGGGGGAGGAGAATGATCTGGACTTCTTTACCAAACCTTCCCGACTCATCCAGTGCTTTG  1210
            ||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  CATCTACTTACTGGGGGGTGAGGAGAATGATCTAGACTTCTTTACCAAACCTTCCCGACTGATCCAGTGCTTTG  1258

Query 1211  ACACAGAGACAGACAAATGCCATGTGAAGCCCTATGTGCTGCCCTTTGCAGGCCGCATGCACGCAGCTGTGCAT  1284
            |||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  ACACAGAAACTGACAAGTGCCACGTGAAGCCCTACGTACTGCCCTTTGCAGGCCGCATGCACGCAGCAGTGCAT  1332

Query 1285  AAAGATCTGGTGTTCATCGTGGCTGAAGGGGACTCCCTGGTGTGCTACAATCCCTTGCTAGACAGCTTCACCCG  1358
            ||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGATCTGGTGTTTATTGTGGCTGAGGGGGACTCTCTAGTGTGCTATAATCCCCTTCTAGACAGCTTCACCCG  1406

Query 1359  GCTTTGCCTTCCTGAGGCCTGGAGCTCTGCCCCATCCCTCTGGAAGATTGCCAGCTGTAACGGGAGCATCTATG  1432
            |||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 1407  GCTCTGTCTTCCTGAGGCCTGGAGCTCTGCCCCATCCCTCTGGAAGATTGCCAGCTGTAATGGCAGCATCTACG  1480

Query 1433  TCTTCCGGGACCGATATAAAAAGGGGGATGCCAACACCTACAAGCTTGACCCTGCCACTTCAGCCGTAACTGTC  1506
            |||||.||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481  TCTTCAGGGATCGATATAAGAAGGGTGATGCCAACACCTATAAGCTTGACCCTGCCACTTCAGCTGTAACTGTC  1554

Query 1507  ACAAGAGGTATTAAGGTGCTGCTTACCAATTTGCAGTTTGTGTTGGCC  1554
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACAAGAGGCATTAAGGTGCTGCTTACCAACTTGCAGTTTGTGTTGGCC  1602