Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471116
- Subject:
- NM_001366222.1
- Aligned Length:
- 2767
- Identities:
- 2305
- Gaps:
- 390
Alignment
Query 1 ATG-----CCGGTCCGGAAGCAAGATAC---------CCAGAGAGCATTGCACCTTTTGGAGGAATATCGTTCA 60
||| |...|.|||||.|||.|.|| |..|.| |||.|..| ||||| ||
Sbjct 1 ATGAATTACATTTTCGGAAACAACACACTTCTATACTCTCGCG-GCAGTCGA------GGAGG---------CA 58
Query 61 AAACTA-----AGCCAAACTGAAGACAGACAGCTCAGAAGTTCCATAGAACGGGTTATTAACATATTTCAGAGC 129
|.|||| ||||| || ||||||.||..|||.|| ||||
Sbjct 59 ATACTAGCTCTAGCCA---TG----------GCTCAGCAGGCCCAAAG--------------------CAGA-- 97
Query 130 AACCTCTTTCAGGCTTTAATAGATATTCAAGAATTTTATGAAGTGACCTTACTGGATAATCCAAAATGTATAGA 203
||| |||||..|| ||||.| |.
Sbjct 98 AAC-----------------------------------------------ACTGGGCAA---AAAAGG----GC 117
Query 204 TCGTTCAAAGCCGTCTGAACCAATTCAACCTGTGAATACTTGGGAGATTTCCAG--CCTTCCAAGCTCTACTGT 275
||| |||.| ||||| |.|||.|||.| |||| ||||| ||..|
Sbjct 118 TCG-TCAGA------TGAAC---TGCAAGCTGAG----------------CCAGAACCTTC--------ACGCT 157
Query 276 GACTTCAGAGA-----------CACTGCCAAG---CAGCCTTAGCCCTAGTGTAGAGAAATACA----GGTATC 331
|.|..||||.| |||| |.||| ||||.||| |.| |.|.|| ||||.|
Sbjct 158 GGCAGCAGATAGTTGCATTTTTCACT-CGAAGACACAGCTTTA----TTG--------ACTGCATCTCGGTAGC 218
Query 332 AGGATGAAGATACACCTCCTCAAGAGCATATTTCCCCA--CAAATCACAAATGAAGTGATAGGTCCAGAATTGG 403
||||..|||.| |||| ||| |||||...|
Sbjct 219 ------------CACCAGCTCCA-----------CCCAGCCAA----------------------CAGAAGCTG 247
Query 404 TTCAT--GTCTCAGAGAAGAACT-------TATCAGAGAT--------TGAGAATGTCCATG----GATT--TG 454
|||.| .|||| || |..|.|.||| ||..| ||||.|| ||.| ||
Sbjct 248 TTCTTCCCTCTC---------CTCCCACTGTCCCTGTGATCCCTGTCCTGCCA--GTCCCTGCTGAGAATACTG 310
Query 455 TTTCTCATTCT------CATATTTCACCAATAAAGGCAAATCCTCCCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTG 522
||||.|| ||| ||| |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311 ----TCATCCTACCCACCAT-----ACC---ACAGGCAAATCCTCCCCCAGTACTGGTCAACACAGATAGCTTG 372
Query 523 AAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATATGAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTC 596
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 373 GAAACACCAACTTACGTTAATGGCACAGATGCAGATTATGAATATGAAGAAATCACACTTGAAAGGGGAAATTC 446
Query 597 AGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAG--AGTACGGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCA 668
||||||||||||||||||||||| .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 447 AGGGCTTGGTTTCAGCATTGCAGGAGGTACGGACAACCCACACATTGGAGATGACTCAAGTATTTTCATTACCA 520
Query 669 AAATTATCACA-GGGGAGCAGCCGCCCAAGATGGGAAGATTGCGGGTCAATGACTGTATATTACAAGTAAATGA 741
||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 521 AAATTATCACAGGGGGAGCAGCCGCCCAAGAT-GGAAGATTGCGGGTCAATGACTGTATATTACGAGTAAATGA 593
Query 742 AGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTTGAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGT 815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 AGTAGATGTTCGTGATGTAACACATAGCAAAGCAGTTGAAGCGTTGAAAGAAGCAGGGTCTATTGTACGCTTGT 667
Query 816 ATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGG 889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 ATGTAAAAAGAAGGAAACCAGTGTCAGAAAAAATAATGGAAATAAAGCTCATTAAAGGTCCTAAAGGTCTTGGG 741
Query 890 TTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGATAATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGA 963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 TTTAGCATTGCTGGAGGTGTTGGAAATCAGCATATTCCTGGGGATAATAGCATCTATGTAACCAAAATAATTGA 815
Query 964 AGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAAACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAG 1037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 AGGAGGTGCAGCACATAAGGATGGCAAACTTCAGATTGGAGATAAACTTTTAGCAGTGAATAACGTATGTTTAG 889
Query 1038 AAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAA 1111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 AAGAAGTTACTCATGAAGAAGCAGTAACTGCCTTAAAGAACACATCTGATTTTGTTTATTTGAAAGTGGCAAAA 963
Query 1112 CCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATCACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAA 1185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 964 CCCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATCACCAACTCTTCTTCTCAGCCTGTTGATAA 1037
Query 1186 CCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCCAGCCAGATACTCCCCAGTTTCTAAAGCAG 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1038 CCATGTTAGCCCATCTTCCTTCTTGGGCCAGACACCAGCATCTCCAGCCAGATACTCCCCAGTTTCTAAAGCAG 1111
Query 1260 TACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTC 1333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1112 TACTTGGAGATGATGAAATTACAAGGGAACCTAGAAAAGTTGTTCTTCATCGTGGCTCAACGGGCCTTGGTTTC 1185
Query 1334 AACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTTTATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAG 1407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186 AACATTGTAGGAGGAGAAGATGGAGAAGGAATATTTATTTCCTTTATCTTAGCCGGAGGACCTGCTGATCTAAG 1259
Query 1408 TGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGG 1481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TGGAGAGCTCAGAAAAGGAGATCGTATTATATCGGTAAACAGTGTTGACCTCAGAGCTGCTAGTCATGAGCAGG 1333
Query 1482 CAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTTGCACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGT 1555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334 CAGCAGCTGCATTGAAAAATGCTGGCCAGGCTGTCACAATTGTTGCACAATATCGACCTGAAGAATACAGTCGT 1407
Query 1556 TTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAGTAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCG 1629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1408 TTTGAAGCTAAAATACATGATTTACGGGAGCAGATGATGAATAGTAGTATTAGTTCAGGGTCAGGTTCTCTTCG 1481
Query 1630 AACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATTATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCA 1703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 AACTAGCCAGAAGCGATCCCTCTATGTCAGAGCCCTTTTTGATTATGACAAGACTAAAGACAGTGGGCTTCCCA 1555
Query 1704 GTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATTAATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCC 1777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 GTCAGGGACTGAACTTCAAATTTGGAGATATCCTCCATGTTATTAATGCTTCTGATGATGAATGGTGGCAAGCC 1629
Query 1778 AGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGATTCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGA 1851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 AGGCAGGTTACACCAGATGGTGAGAGCGATGAGGTCGGAGTGATTCCCAGTAAACGCAGAGTTGAGAAGAAAGA 1703
Query 1852 ACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGAGAGATAAAGGGCAGTCATTC--AATGACAAGCG 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|| ||.| .|.||||.|.|
Sbjct 1704 ACGAGCCCGATTAAAAACAGTGAAATTCAATTCTAAAACGAGAGATAAAGGGGAG--ATCCCTGACGACATGGG 1775
Query 1924 -TAAAAAGAACCTCTTTTCCCGAA------AATTCCCCTTCTACAAGAACAAGGACCAG----AGTGAGCAGGA 1986
|.||||| .||.||| || |||||| |.| |||| |||||
Sbjct 1776 ATCAAAAG---------GCCTGAAGCATGTAA-----CTTCTA-ATG--------CCAGCGATAGTGA------ 1820
Query 1987 AACAAGTGATGCTCACAAGTATGTATATGAATGATGGCTATGCACCACCTGATATCACCAACTGTGGTCAAGAA 2060
|||||..| ||.|||||||||||
Sbjct 1821 ----------------AAGTAGTT------------------------------------ACCGTGGTCAAGAA 1842
Query 2061 GAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAAGTTAATTATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACC 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 GAATACGTCTTATCTTATGAACCAGTGAATCAACAAGAAGTTAATTATACTCGACCAGTGATCATATTGGGACC 1916
Query 2135 TATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAA 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1917 TATGAAAGACAGGATAAATGATGACTTGATCTCAGAATTTCCTGACAAATTTGGATCCTGTGTTCCTCATACAA 1990
Query 2209 CTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATTATCATTTTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAA 2282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1991 CTAGACCAAAACGAGATTATGAGGTAGATGGAAGAGATTATCATTTTGTGACTTCAAGAGAGCAGATGGAAAAA 2064
Query 2283 GATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTATAACAATCATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGT 2356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2065 GATATCCAGGAACATAAATTCATTGAAGCTGGCCAGTATAACAATCATCTATATGGAACAAGTGTTCAGTCTGT 2138
Query 2357 ACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTG 2430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2139 ACGAGAAGTAGCAGAAAAGGGCAAACACTGTATCCTTGATGTGTCTGGAAATGCCATAAAGAGATTACAGATTG 2212
Query 2431 CACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAATCCATGGAAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTA 2504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2213 CACAGCTTTACCCTATCTCCATTTTTATTAAACCCAAATCCATGGAAAATATCATGGAAATGAATAAGCGTCTA 2286
Query 2505 ACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAACTGGAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGC 2578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2287 ACAGAAGAACAAGCCAGAAAAACATTTGAGAGAGCCATGAAACTGGAACAGGAGTTTACTGAACATTTCACAGC 2360
Query 2579 TATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCAAGTGAAACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTT 2652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2361 TATTGTACAGGGGGATACGCTGGAAGACATTTACAACCAAGTGAAACAGATCATAGAAGAACAATCTGGTTCTT 2434
Query 2653 ACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA 2681
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2435 ACATCTGGGTTCCGGCAAAAGAAAAGCTA 2463