Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471123
• Subject: XM_006497053.3
• Aligned Length: 1563
• Identities: 1406
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACACCGAGTCCCAGTACTCGGGCTATTCCTACAAGTCGGGCCACTCCCGCAGCTCCCGCAAGCACAGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGACACCGAGTCCCAGTACTCGGGCTATTCCTACAAGTCGGGCCACTCCCGCAGCTCCCGGAAGCACAGGGA  74

Query   75  CCGCCGGGACCGACACCGCTCTAAGAGTCGAGATGGGGGCCGAGGGGACAAGTCGGTGACAATCCAGGCTCCCG  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CCGCCGGGACCGACACCGCTCTAAGAGCCGGGATGGGAGTCGTGGAGATAAATCAGTGACGATCCAGGCTCCGG  148

Query  149  GGGAGCCCCTGCTGGACAATGAGTCCACACGAGGGGATGAGCGGGATGACAACTGGGGGGAAACGACGACAGTA  222
            |.||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.
Sbjct  149  GAGAACCCCTGCTGGACAATGAGTCCACGAGGGGGGATGAGCGGGATGACAACTGGGGAGAAACAACAACGGTG  222

Query  223  GTAACGGGCACCTCAGAGCACAGCATCTCCCATGATGACCTCACACGCATCGCCAAGGACATGGAGGACAGTGT  296
            ||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCACGGGCACTTCTGAGCACAGTATCTCCCATGATGACCTCACGCGCATCGCCAAGGACATGGAGGACAGTGT  296

Query  297  CCCTCTGGACTGCTCCCGTCACCTGGGTGTGGCAGCGGGGGCCACCCTGGCACTGCTGTCTTTCCTCACGCCTC  370
            |||..||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||..|||||.|||||.||.||||||||.||.|
Sbjct  297  CCCGTTGGATTGTTCCCGCCACCTGGGCGTGGCGGCAGGGGCCATTCTGGCGCTGCTCTCGTTCCTCACCCCGC  370

Query  371  TGGCCTTCCTGCTGCTGCCCCCACTGCTGTGGCGGGAGGAGCTGGAGCCTTGCGGGACGGCCTGCGAGGGCCTC  444
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TGGCTTTCCTGCTGCTGCCTCCACTGCTGTGGCGGGAGGAGCTGGAGCCGTGTGGGACGGCCTGTGAGGGCCTC  444

Query  445  TTCATCTCTGTCGCCTTCAAGCTGCTCATCCTGCTACTGGGCAGCTGGGCTCTGTTCTTCCGCCGGCCCAAGGC  518
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCATCTCCGTGGCCTTCAAGCTGCTCATCCTGCTGTTGGGCAGCTGGGCTCTGTTCTTCCGCCGGCCCAAGGC  518

Query  519  CTCGCTGCCCCGCGTCTTTGTGCTGCGTGCCCTGCTTATGGTGCTGGTTTTCCTGCTCGTGGTCTCCTACTGGC  592
            |||.||||||||.|||||.|||.|.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||..|.|||||.||||
Sbjct  519  CTCACTGCCCCGAGTCTTCGTGTTACGAGCTCTGCTCATGGTGCTTGTCTTCCTGCTGGTTATTTCCTATTGGC  592

Query  593  TCTTCTATGGTGTGCGCATCCTGGATGCTCGGGAGCGCAGCTACCAGGGCGTGGTGCAGTTCGCCGTGTCGCTG  666
            |||||||.||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.
Sbjct  593  TCTTCTACGGTGTGCGCATCTTGGACGCCCGGGAGCGGAGCTACCAGGGCGTGGTTCAGTTTGCCGTTTCTCTA  666

Query  667  GTGGACGCCCTTCTTTTCGTGCACTACCTGGCCGTGGTCCTGCTGGAGCTGCGCCAGCTCCAGCCTCAGTTCAC  740
            |||||.||..|.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GTGGATGCTTTACTCTTCGTGCACTATCTGGCCGTAGTTCTGCTGGAGCTCCGTCAGCTCCAGCCCCAGTTCAC  740

Query  741  GCTCAAGGTCGTGCGCTCCACCGACGGCGCCAGCCGCTTCTACAACGTTGGCCATCTCAGCATCCAGCGCGTGG  814
            .||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  ACTCAAGGTCGTGCGATCCACAGATGGGGCCAGCCGCTTCTACAATGTCGGCCATCTCAGCATCCAGCGAGTGG  814

Query  815  CAGTGTGGATCCTGGAGAAGTATTACCATGACTTCCCTGTCTACAACCCTGCCCTCCTCAACCTGCCCAAGTCC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGTGTGGATCCTGGAGAAGTATTACCATGACTTCCCTGTCTACAACCCCGCCCTCCTCAACCTGCCCAAGTCC  888

Query  889  GTCCTGGCCAAGAAAGTGTCTGGCTTCAAGGTGTATTCCCTCGGAGAGGAAAACAGCACCAACAACTCCACTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  889  GTCCTGGCCAAGAAAGTGTCTGGCTTCAAGGTGTATTCTCTCGGAGAGGAAAATAGCACCAATAACTCCACGGG  962

Query  963  CCAGTCTCGGGCTGTGATTGCAGCGGCAGCTCGGAGGCGGGACAACAGTCACAATGAGTACTACTATGAGGAGG  1036
            |||.||..||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  963  CCAATCAAGGGCTGTGATCGCGGCTGCGGCACGGAGGCGCGACAACAGCCACAATGAGTACTACTACGAGGAAG  1036

Query 1037  CTGAGCATGAGCGAAGGGTGCGCAAGAGGAGGGCCAGGCTTGTAGTGGCGGTGGAGGAGGCCTTCACTCACATT  1110
            |.|||||||||||.||.|||||||||.|.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  CCGAGCATGAGCGCAGAGTGCGCAAGCGCAGGGCCAGGCTCGTGGTGGCTGTGGAGGAGGCCTTCACGCACATT  1110

Query 1111  AAGCGGCTGCAGGAAGAGGAGCAGAAGAACCCCAGGGAGGTGATGGACCCCCGGGAGGCAGCCCAAGCCATCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1111  AAGCGGCTGCAGGAAGAGGAGCAGAAGAACCCCAGGGAGGTGATGGACCCCCGGGAAGCAGCCCAAGCGATCTT  1184

Query 1185  TGCATCCATGGCCCGTGCCATGCAGAAGTACCTTCGGACCACCAAGCAGCAGCCCTACCACACCATGGAGAGCA  1258
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  TGCATCCATGGCTCGTGCCATGCAGAAGTACCTTCGCACCACCAAACAGCAGCCTTACCATACCATGGAGAGCA  1258

Query 1259  TCCTGCAGCACCTTGAATTCTGCATCACGCATGACATGACGCCCAAGGCCTTCTTGGAGCGATACTTGGCGGCT  1332
            ||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1259  TCCTTCAGCACCTGGAGTTCTGCATTACCCACGACATGACGCCCAAGGCCTTCCTGGAGCGATATTTGGCTGCT  1332

Query 1333  GGACCTACCATCCAGTACCACAAGGAACGCTGGCTGGCCAAACAGTGGACATTGGTGAGCGAGGAGCCGGTGAC  1406
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGACCCACCATCCAGTACCACAAGGAACGTTGGCTGGCCAAACAGTGGACCTTGGTGAGCGAGGAGCCGGTGAC  1406

Query 1407  CAACGGCCTCAAGGATGGCATCGTTTTCCTCTTAAAACGCCAGGACTTCAGCCTGGTGGTCAGCACCAAGAAGG  1480
            |||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1407  CAATGGGCTTAAGGATGGCATCGTGTTCCTCTTGAAGCGCCAGGACTTCAGCTTGGTAGTGAGCACCAAGAAGG  1480

Query 1481  TCCCATTCTTCAAACTCTCCGAGGAATTTGTGGATCCCAAGTCACACAAGTTTGTCATGAGGCTGCAGTCTGAG  1554
            |.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||.|||
Sbjct 1481  TGCCCTTCTTCAAACTCTCTGAGGAATTTGTGGATCCCAAGTCACATAAGTTCGTCATGCGGCTGCAGTCGGAG  1554

Query 1555  ACCTCAGTG  1563
            |||||.|||
Sbjct 1555  ACCTCTGTG  1563