Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000471142
Subject:
XM_024447979.1
Aligned Length:
691
Identities:
561
Gaps:
125

Alignment

Query   1  ATGATGCCTGAAATAAACACTAACCACCTCGACAAGCAACAGGTTCAACTCCTGGCAGAGATGTGTATCCTTAT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TGATGAAAATGACAATAAAATTGGAGCTGAGACCAAGAAGAAT-TGTCACCTGAACGA------GAACATTGAG  141
                               .|||||       ||||     | |||||   |.||.|      .||||     
Sbjct   1  --------------------ATGGAG-------CAAG-----TCTGTCA---GCACCATCTTTCTAACA-----  34

Query 142  AAAGGATTATTGCATCGAGCTTTTAGTGTCTTCTTATTCAACACCGAAAATAAGCTTCTGCTACAGCAAAGATC  215
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  35  ----GATTATTGCATCGAGCTTTTAGTGTCTTCTTATTCAACACCGAAAATAAGCTTCTGCTACAGCAAAGATC  104

Query 216  AGATGCTAAGATTACCTTTCCAGGTTGTTTTACGAATACGTGTTGTAGTCATCCATTAAGCAATCCAGCCGAGC  289
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105  AGATGCTAAGATTACCTTTCCAGGTTGTTTTACGAATACGTGTTGTAGTCATCCATTAAGCAATCCAGCCGAGC  178

Query 290  TTGAGGAAAGTGACACCCTTGGAGTGAGGCGAGCAGCACAGAGACGGCTGAAAGCTGAGCTAGGAATTCCCTTG  363
           ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179  TTGAGGAAAGTGACGCCCTTGGAGTGAGGCGAGCAGCACAGAGACGGCTGAAAGCTGAGCTAGGAATTCCCTTG  252

Query 364  GAAGAGGTTCCTCCAGAAGAAATTAATTATTTAACACGAATTCACTACAAAGCTCAGTCTGATGGTATCTGGGG  437
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253  GAAGAGGTTCCTCCAGAAGAAATTAATTATTTAACACGAATTCACTACAAAGCTCAGTCTGATGGTATCTGGGG  326

Query 438  TGAACATGAAATTGATTACATTTTGTTGGTGAGGAAGAATGTAACTTTGAATCCAGATCCCAATGAGATTAAAA  511
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327  TGAACATGAAATTGATTACATTTTGTTGGTGAGGAAGAATGTAACTTTGAATCCAGATCCCAATGAGATTAAAA  400

Query 512  GCTATTGTTATGTGTCAAAGGAAGAACTAAAAGAACTTCTGAAAAAAGCAGCCAGTGGTGAAATTAAGATAACG  585
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401  GCTATTGTTATGTGTCAAAGGAAGAACTAAAAGAACTTCTGAAAAAAGCAGCCAGTGGTGAAATTAAGATAACG  474

Query 586  CCATGGTTTAAAATTATTGCAGCGACTTTTCTCTTTAAATGGTGGGATAACTTAAATCATTTGAATCAGTTTGT  659
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475  CCATGGTTTAAAATTATTGCAGCGACTTTTCTCTTTAAATGGTGGGATAACTTAAATCATTTGAATCAGTTTGT  548

Query 660  TGACCATGAGAAAATATACAGAATG  684
           |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549  TGACCATGAGAAAATATACAGAATG  573