Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471206
• Subject: NR_146754.1
• Aligned Length: 2394
• Identities: 1589
• Gaps: 802

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGGAGGCGGGTCGTATAAGGAGGTGGGGCGAGGCCGGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGA  74

Query    1  -ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCC---------------------------------------  34
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct   75  CATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGGTATGGATCCCGGAGCGCGCAGAGGAGTCCCTGAGGA  148

Query   35  --------------------------------------------------------------------------  34
                                                                                      
Sbjct  149  GCTAGGGACCCCAAAGGCCTTTCACCGCTGCGGGCCAGTCCTCAGTCAGCTGGAGGGTGGGTCCCACGGAATCC  222

Query   35  --------------------------------------------------------------------------  34
                                                                                      
Sbjct  223  TGTTAGTTTCTACCACCTCCTCCCCCTTCTCTGGAGCTGGTGGAGCTTCAGAAGTCCTGTGGAGCGTCGGCTGG  296

Query   35  ----------------------------------AGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT  74
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCAGTTTGTCTCGGTGAAAAGTAAACTTTGAAAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT  370

Query   75  CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT  444

Query  149  TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT  518

Query  223  GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA  592

Query  297  GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC  666

Query  371  AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC  444
            ||||||||||||||||||||||||                                                  
Sbjct  667  AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCA--------------------------------------------------  690

Query  445  ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA  518
                                                                                      
Sbjct  691  --------------------------------------------------------------------------  690

Query  519  TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC  592
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  691  ----------------GGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC  748

Query  593  CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  749  CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCA  822

Query  667  GCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  GCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTT  896

Query  741  GAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  GAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTT  970

Query  815  ATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAACG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  971  ATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAACG  1044

Query  889  GCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1045  GCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCT  1118

Query  963  CTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1119  CTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGA  1192

Query 1037  CAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1193  CAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAA  1266

Query 1111  AGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1267  AGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGA  1340

Query 1185  TGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1341  TGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACC  1414

Query 1259  CACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1415  CACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGAC  1488

Query 1333  TACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1489  TACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCG  1562

Query 1407  CCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1563  CCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCAC  1636

Query 1481  AGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1637  AGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCC  1710

Query 1555  AGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711  AGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGA  1784

Query 1629  TAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785  TAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGA  1858

Query 1703  AACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAG----------GATG--------------------------------  1734
            |||||||||||||||||||  ||||.||          |.||                                
Sbjct 1859  AACTTCTTGGAATAACACC--TATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATGTTGGC  1930

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 1931  TCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCA  2004

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2005  CGTGCCATCACGCCAGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCTATGTTGGTCAGGCTGGTCTTG  2078

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2079  CACTCCCGACCTCAGGTTATCTGTCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAGAGGCATGAACCACCACGCC  2152

Query 1735  --------------------------------------------------------------------------  1734
                                                                                      
Sbjct 2153  CAGCCAAAGTTAAACTATTATTCTGTGTCAGAATCTGTATTAAATGTGACTTGTCAAGTTATTCAGTCTTTATC  2226

Query 1735  --------------------------  1734
                                      
Sbjct 2227  CTTAAATAAATGAGTTATCTGAATTC  2252