Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471206
- Subject:
- NR_146758.1
- Aligned Length:
- 2394
- Identities:
- 1508
- Gaps:
- 883
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGGGAGGCGGGTCGTATAAGGAGGTGGGGCGAGGCCGGAACTGGCGGACTGCGGCGCACTTCCGTAGAGGTGGA 74
Query 1 -ATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCC--------------------------------------- 34
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGGCGTGCGGCTTTCGCCGCGCTATTGCTTGCCAGGTATGGATCCCGGAGCGCGCAGAGGAGTCCCTGAGGA 148
Query 35 -------------------------------------------------------------------------- 34
Sbjct 149 GCTAGGGACCCCAAAGGCCTTTCACCGCTGCGGGCCAGTCCTCAGTCAGCTGGAGGGTGGGTCCCACGGAATCC 222
Query 35 -------------------------------------------------------------------------- 34
Sbjct 223 TGTTAGTTTCTACCACCTCCTCCCCCTTCTCTGGAGCTGGTGGAGCTTCAGAAGTCCTGTGGAGCGTCGGCTGG 296
Query 35 ----------------------------------AGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATCAGTTTGTCTCGGTGAAAAGTAAACTTTGAAAGCTTTCCAGAGTGTTGAATCTTCCACCAGAAAACTTGAT 370
Query 75 CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACATCAATATCTGCAGTTCCAATTTCCCAAAAAGAAGAAGTAGCTGATTTTCAGCTTTCTGTGGATTCTTTAT 444
Query 149 TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGAAAAAGACAATGACCATTCAAGACCAGATATTCAAGTTCAAGCCAAGAGACTAGCAGAGAAGCTAAGATGT 518
Query 223 GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATACAGTGGTGAGTGAAATCAGTACTGGTCAAAGGACTGTAAATTTCAAAATAAACAGAGAGCTCTTAACAAA 592
Query 297 GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GACAGTGCTACAACAAGTAATTGAAGATGGCTCAAAATATGGATTAAAAAGTGAACTTTTCTCTGGACTTCCCC 666
Query 371 AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAGTTCACCTAATGTTGCCAAAAAATTTCATGTTGGACATTTGCGTTCTACC 444
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAAGAAGATTGTGGTTGAATTCAG------------------------------------------------- 691
Query 445 ATCATAGGAAATTTTATAGCAAATCTCAAAGAAGCTTTAGGACATCAAGTAATAAGAATAAATTACCTTGGCGA 518
Sbjct 692 -------------------------------------------------------------------------- 691
Query 519 TTGGGGCATGCAGTTTGGTCTTCTGGGAACTGGCTTCCAGCTGTTTGGCTATGAGGAAAAACTGCAGTCCAATC 592
Sbjct 692 -------------------------------------------------------------------------- 691
Query 593 CTCTACAGCATCTCTTTGAAGTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 --------------------GTTTATGTACAAGTTAATAAAGAAGCAGCAGATGATAAAAGTGTAGCAAAAGCA 745
Query 667 GCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 746 GCACAGGAGTTCTTCCAACGATTGGAACTGGGCGATGTGCAAGCACTTTCACTGTGGCAAAAATTTCGGGACTT 819
Query 741 GAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 820 GAGCATTGAAGAGTACATTCGGGTTTACAAGCGTCTGGGAGTATATTTTGATGAATATTCAGGAGAATCATTTT 893
Query 815 ATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAGAACAATAAAAGGAACG 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 894 ATCGTGAAAAATCTCAAGAGGTCTTAAAGTTGCTGGAGAGTAAAGGACTCCTACTGAAAACAATAAAAGGAACG 967
Query 889 GCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 968 GCTGTAGTAGATCTCTCTGGGAATGGCGACCCCTCCTCAATTTGTACTGTAATGCGAAGTGATGGGACTTCTCT 1041
Query 963 CTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGTGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 CTATGCAACCAGAGATCTTGCAGCTGCTATAGATCGAATGGACAAGTATAATTTTGATACAATGATATATGT-- 1113
Query 1037 CAGATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 --GATAAAGGACAAAAAAAGCATTTTCAGCAAGTATTCCAAATGCTGAAGATCATGGGATATGACTGGGCAGAA 1185
Query 1111 AGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1186 AGGTGCCAGCACGTGCCCTTTGGAGTAGTACAGGGAATGAAGACTCGAAGAGGAGATGTCACTTTCCTGGAAGA 1259
Query 1185 TGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260 TGTTTTAAATGAGATTCAATTAAGGATGCTACAGAACATGGCTTCAATTAAGACAACTAAAGAACTCAAGAACC 1333
Query 1259 CACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334 CACAAGAGACTGCAGAGAGGGTCGGGCTCGCAGCACTCATTATTCAGGACTTCAAAGGTTTACTCTTATCTGAC 1407
Query 1333 TACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1408 TACAAGTTCAGCTGGGATCGTGTTTTCCAGAGTCGCGGGGACACAGGAGTCTTCCTACAGTACACACACGCCCG 1481
Query 1407 CCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCAC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482 CCTCCACAGTTTGGAAGAGACTTTTGGATGTGGGTACCTGAATGACTTCAACACTGCTTGTTTACAAGAGCCAC 1555
Query 1481 AGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556 AGTCTGTTTCAATTCTTCAGCATCTTCTCAGGTTCGACGAGGTGCTTTATAAATCATCTCAGGACTTTCAACCC 1629
Query 1555 AGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630 AGGCATATCGTCAGTTACCTTCTAACTTTAAGTCATCTTGCAGCTGTGGCACACAAAACACTACAAATAAAAGA 1703
Query 1629 TAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704 TAGTCCTCCTGAAGTGGCTGGGGCCAGACTTCATCTTTTCAAAGCTGTCCGTTCTGTCCTAGCCAATGGAATGA 1777
Query 1703 AACTTCTTGGAATAACACCTGTATGTAG----------GATG-------------------------------- 1734
||||||||||||||||||| ||||.|| |.||
Sbjct 1778 AACTTCTTGGAATAACACC--TATGGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATGTTGGC 1849
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 1850 TCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCA 1923
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 1924 CGTGCCATCACGCCAGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCTATGTTGGTCAGGCTGGTCTTG 1997
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 1998 CACTCCCGACCTCAGGTTATCTGTCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTAGAGGCATGAACCACCACGCC 2071
Query 1735 -------------------------------------------------------------------------- 1734
Sbjct 2072 CAGCCAAAGTTAAACTATTATTCTGTGTCAGAATCTGTATTAAATGTGACTTGTCAAGTTATTCAGTCTTTATC 2145
Query 1735 -------------------------- 1734
Sbjct 2146 CTTAAATAAATGAGTTATCTGAATTC 2171